基于大型藥物數(shù)據(jù)庫的藥物相互作用預測模型
本文關鍵詞:基于大型藥物數(shù)據(jù)庫的藥物相互作用預測模型
更多相關文章: 藥物相互作用 相似度 支持向量機 粒子群算法
【摘要】:目的本文旨在建立一種便捷而有效的藥物-藥物相互作用(DDI)預測模型。方法從Drug Bank、SIDER等數(shù)據(jù)庫獲取相關藥物數(shù)據(jù),計算分子結構相似度、3D藥效團相似度、相互作用組相似度、靶點相似度以及藥物不良反應相似度。利用以上5種藥物相似度,來提取特征屬性,再用粒子群優(yōu)化的支持向量機方法,根據(jù)特征屬性進行建模,實施分類預測。結果在交叉驗證中,該模型獲得了較高的特異度和靈敏度(受試者工作特征曲線的曲線下面積0.97)。獨立的外部藥物相互作用數(shù)據(jù)庫(Drugs.com)也驗證了模型的正確性與合理性。結論本模型對于藥物評價的安全性和有效性具有重要意義。
【作者單位】: 中國藥科大學理學院;
【關鍵詞】: 藥物相互作用 相似度 支持向量機 粒子群算法
【基金】:中央高;究蒲袠I(yè)務費專項基金資助項目(ZJ14040) 國家自然科學基金資助項目(81373482)
【分類號】:R96
【正文快照】: MIN Qian,LIAO Jun,LU Tao(School of Sciences,China Pharmaceuti-cal University,Nanjing 210009,China)對于藥物研發(fā)以及臨床安全,更早、更準確的進行藥物-藥物相互作用(drug-drug interaction,DDI)的監(jiān)測評估至關重要。近年來,有一些基于相似性的DDI預測方法[1-3],其基本
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,本文編號:998896
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