p53突變體Y220C小分子穩(wěn)定劑的虛擬篩選
發(fā)布時(shí)間:2017-08-15 23:27
本文關(guān)鍵詞:p53突變體Y220C小分子穩(wěn)定劑的虛擬篩選
更多相關(guān)文章: 癌癥 蛋白質(zhì)穩(wěn)定劑 分子對(duì)接 分子動(dòng)力學(xué)模擬 p 他克林
【摘要】:為了獲得p53突變體的穩(wěn)定劑,依次利用利賓斯基五原則,通過2次分子對(duì)接和全原子分子動(dòng)力學(xué)(MD)模擬從Drug Bank 4.0數(shù)據(jù)庫中篩選獲得了潛在的穩(wěn)定劑他克林.利用MD模擬進(jìn)一步驗(yàn)證他克林和目標(biāo)蛋白質(zhì)之間的親和作用.結(jié)果表明,他克林能夠緊密結(jié)合到Y(jié)220C突變所形成的疏水空腔之中;他克林和目標(biāo)蛋白質(zhì)之間的主要作用力為疏水和靜電相互作用,其中疏水相互作用占主導(dǎo)地位.此外,他克林分別與目標(biāo)蛋白質(zhì)的殘基Leu145,Val147和Asp228形成3個(gè)氫鍵.基于MD模擬軌跡分析了他克林與p53CY220C的結(jié)合過程.由硫黃素T熒光光譜進(jìn)一步證明他克林能夠提高p53C-Y220C突變體的穩(wěn)定性.
【作者單位】: 天津大學(xué)化工學(xué)院生物工程系系統(tǒng)生物工程教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【關(guān)鍵詞】: 癌癥 蛋白質(zhì)穩(wěn)定劑 分子對(duì)接 分子動(dòng)力學(xué)模擬 p 他克林
【基金】:國家自然科學(xué)基金(批準(zhǔn)號(hào):21576199) 中國博士后科學(xué)基金(批準(zhǔn)號(hào):2013M530115;2012T50241)資助~~
【分類號(hào)】:TP311.13;R91
【正文快照】: p53是一種重要的腫瘤抑制蛋白質(zhì),具有阻滯腫瘤細(xì)胞生長、促進(jìn)腫瘤細(xì)胞凋亡以及抑制腫瘤血管生成等多種生物學(xué)功能[1].p53含有5個(gè)結(jié)構(gòu)域,分別為N末端反式激活結(jié)構(gòu)域、脯氨酸富集域、核心DNA結(jié)合域、四聚體區(qū)域和C末端區(qū)域.p53共含有393個(gè)氨基酸,其中94~292位氨基酸為該蛋白質(zhì)的
【相似文獻(xiàn)】
中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條
1 張惠斌,周金培,黃文龍;他克林的合成研究[J];中國現(xiàn)代應(yīng)用藥學(xué);2001年01期
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7 蔣煜,張志榮,吳勇,付R,
本文編號(hào):680420
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