蛋白質(zhì)作為一種重要的有機大分子,在生命活動中承擔著重要作用。隨著生命科學(xué)領(lǐng)域研究的不斷深入,越來越多的蛋白基因序列被解析出來,以此為基礎(chǔ)發(fā)展的以探究蛋白質(zhì)組和功能基因組為主的生命科學(xué)進入了新的篇章。隨著計算機計算能力的提升以及模擬方法理論逐漸完善,以物理、數(shù)學(xué)和化學(xué)等學(xué)科綜合發(fā)展而來的分子動力學(xué)作為一種新型的理論指導(dǎo)工具,在蛋白-底物的相互作用、底物傳遞與釋放等過程的機制研究中發(fā)揮著越來越重要的作用,它能夠從動態(tài)角度探究蛋白質(zhì)瞬時構(gòu)象變化,對實驗進行解釋及預(yù)測。同時,在以構(gòu)象契合理念為基礎(chǔ)的藥物設(shè)計中,動力學(xué)模擬可以在微觀層面探究分子的生物作用機制,結(jié)合同源建模,分子對接等計算機輔助藥物設(shè)計工具,可以驗證藥物分子的藥效模型,并指導(dǎo)藥物的改造設(shè)計。本論文主要采用分子動力學(xué)模擬的方法,結(jié)合傘形采樣等多種技術(shù),對熱點蛋白的底物釋放及作用機制進行研究,并結(jié)合3D-QSAR,對相關(guān)抑制劑進行設(shè)計,主要研究內(nèi)容如下:1:組蛋白賴氨酸特異性去甲基化酶1（Lysine-specific demethylase 1,LSD1）是一種典型的組蛋白特異性去甲基化酶,對于探究組蛋白甲基化修飾有著重要意義。以苯... 

【文章來源】：河南大學(xué)河南省

【文章頁數(shù)】：109 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

LSD1蛋白不同結(jié)構(gòu)域部位cartoon示意圖

簡化前后的動力學(xué)模擬熵變模型示意圖

圖 3-3 3D-QSAR 分子疊合圖及疊合骨架示意圖 3-1 苯環(huán)丙胺類 LSD1 抑制劑 Training Set 結(jié)構(gòu)，實驗活性數(shù)據(jù)及 3D-QSAR 結(jié)The structures，actual and predicted pIC50values of the Training SetibitorstructBioactivity (pIC50)RRRRActual Predicted


本文編號：3515945