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基于CoMFA研究培氟沙星均三唑硫醚衍生物抗增殖活性與分子設(shè)計(jì)

發(fā)布時間:2021-11-23 19:36
  基于比較分子力場分析(CoMFA)方法建立24種培氟沙星均三唑硫醚衍生物對小鼠白血病細(xì)胞(L1210)抗增殖活性(pIC)的三維定量構(gòu)效關(guān)系(3D-QSAR)。訓(xùn)練集中20個化合物用于建立預(yù)測模型,測試集8個化合物(含模板分子22及新設(shè)計(jì)的3個分子)作為模型驗(yàn)證。已建立的3D-QSAR模型的交叉驗(yàn)證系數(shù)(Rcv2)、非交叉驗(yàn)證系數(shù)(R2)分別為0.659和0.926,說明所建模型具有較強(qiáng)的穩(wěn)定性和良好的預(yù)測能力。該模型中立體場、靜電場貢獻(xiàn)率依次為72.8%及27.2%,表明影響抗增殖活性(pIC)的主要因素是在苯環(huán)的4-位上引入小體積的負(fù)電性基團(tuán);谌S等勢圖,設(shè)計(jì)了3個具有較高抗增殖活性的分子,有待醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證。 

【文章來源】:湖南師范大學(xué)自然科學(xué)學(xué)報(bào). 2020,43(06)北大核心

【文章頁數(shù)】:6 頁

【部分圖文】:

基于CoMFA研究培氟沙星均三唑硫醚衍生物抗增殖活性與分子設(shè)計(jì)


培氟沙星均三唑硫醚衍生物分子的基本結(jié)構(gòu)

測試集,訓(xùn)練集,分子,構(gòu)象


2.1 化合物分子藥效構(gòu)象的確定及分子疊合使用Sketch molecule模塊構(gòu)建24個培氟沙星均三唑硫醚衍生物分子[6]和新設(shè)計(jì)3個分子的初始三維結(jié)構(gòu);對上述分子進(jìn)行分子力學(xué)能量優(yōu)化的程序?yàn)镸inimize模塊,以獲得它們能量最低構(gòu)象,即藥效構(gòu)象(亦稱生物活性構(gòu)象),用于分子疊合。

等勢圖,等勢圖,靜電場,化合物


CoMFA模型的三維等勢圖分為立體作用分布圖和靜電作用分布圖。以化合物22為模板分子的pIC的三維立體場等勢圖見圖3(a)(彩圖見封三)。在縮氨基硫脲部位有2個綠色區(qū)域,該區(qū)域引入體積較大的取代基有助于提高化合物的抗增殖活性。因此,1~12號化合物沒有縮氨基硫脲部分,其抗增殖活性都弱于相應(yīng)13~24化合物。另外,在苯環(huán)的3,4-位之間(偏4-位)有個黃色區(qū)域,該區(qū)域引入體積小的基團(tuán)會使化合物的生物活性增強(qiáng)。例如6和18號化合物的3,4-位基團(tuán)為—OCH2—,7和19號化合物的3,4-位為MeO—,它們的體積均比2~5及14~17號化合物的取代基大,因此,化合物6,7,18及19的抗增殖活性較弱。

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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本文編號:3514520

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