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用于自動(dòng)反向?qū)拥摩?內(nèi)酰胺類藥物靶點(diǎn)蛋白結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)的構(gòu)建

發(fā)布時(shí)間:2021-11-02 08:34
  β-內(nèi)酰胺類藥物是目前臨床使用最廣泛的抗菌藥物之一,其抗菌作用機(jī)制是抑制胞壁粘肽合成酶,即青霉素結(jié)合蛋白(penicillin binding proteins, PBPs)。由于當(dāng)前抗生素的過(guò)量使用,導(dǎo)致PBPs新的突變體不斷出現(xiàn),使細(xì)菌出現(xiàn)很多新的耐藥菌,同時(shí)細(xì)菌也更容易產(chǎn)生耐藥性。在臨床細(xì)菌感染的治療中,如果初始抗生素的選擇不夠敏感,菌株會(huì)很快產(chǎn)生耐藥性,正確選用初始抗菌藥物對(duì)治愈率的影響很大?股貙(duì)菌株的效果主要由多個(gè)方面決定,其中很重要的一點(diǎn)就是作用靶點(diǎn)與抗生素的親和力大小。因此,本課題致力于通過(guò)生物信息學(xué)手段,構(gòu)建出一種能準(zhǔn)確、快速且廉價(jià)的預(yù)測(cè)p-內(nèi)酰胺類藥物對(duì)不同的$-內(nèi)酰胺類藥物靶點(diǎn)蛋白的親和力方法,從一個(gè)側(cè)面反映出抗菌藥物的抑菌效果,從而為新藥設(shè)計(jì)提供分子水平上親和力方面的參考。本文從rscb pdb (http://www.rcsb.org/pdb)網(wǎng)站下載了來(lái)源于大腸桿菌,鮑氏不動(dòng)桿菌,肺炎克雷伯菌,肺炎鏈球菌,金黃色葡萄球菌,MRSA,銅綠假單胞菌,銅綠假單胞菌,流感嗜血桿菌等多種臨床常見(jiàn)致病細(xì)菌的56種pdb格式的青霉素結(jié)合蛋白和其他相關(guān)的酶蛋白以及部分蛋白... 

【文章來(lái)源】:西南大學(xué)重慶市 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁(yè)數(shù)】:67 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

用于自動(dòng)反向?qū)拥摩?內(nèi)酰胺類藥物靶點(diǎn)蛋白結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(kù)的構(gòu)建


圖1.3分子對(duì)接的誘導(dǎo)契合模型??Fig?1.3.?Model?of?induced?fit??配體與受體的結(jié)合過(guò)程是一個(gè)很復(fù)雜的過(guò)程,涉及到配體和受體的去溶劑化、??

流程圖,分子對(duì)接,受體,配體


?J?List??Postprocessing??圖1.1目前常用的藥物設(shè)計(jì)手段:虛擬蹄選的流程圖??Figure?1.1?the?common?methods?for?drug?design,?flowchart?of?virtual?screening??1.2.1分子對(duì)接的基本原理??分子對(duì)接最初思想起源于德國(guó)著名有機(jī)化學(xué)家Fischer?E在1894年提出的“鎖??和明匙模型”,認(rèn)為“鎖”和“朗匙”的相識(shí)別的首要條件是他們?cè)诳臻g形狀上要??互相匹配。???????丨找?site)??aii4??f—)? ̄?hsm??j|??modvl??(3)??圖1.2分子對(duì)接的鎖和朗匙模型??Fig?1.2.?Model?of?the?lock?and?key??但事實(shí)上

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]反向分子對(duì)接-藥物靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)和確認(rèn)的新途徑[J]. 范勝軍,李學(xué)軍.  生理科學(xué)進(jìn)展. 2012(05)



本文編號(hào):3471697

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