β-內(nèi)酰胺類藥物是目前臨床使用最廣泛的抗菌藥物之一,其抗菌作用機制是抑制胞壁粘肽合成酶,即青霉素結(jié)合蛋白（penicillin binding proteins, PBPs）。由于當前抗生素的過量使用,導致PBPs新的突變體不斷出現(xiàn),使細菌出現(xiàn)很多新的耐藥菌,同時細菌也更容易產(chǎn)生耐藥性。在臨床細菌感染的治療中,如果初始抗生素的選擇不夠敏感,菌株會很快產(chǎn)生耐藥性,正確選用初始抗菌藥物對治愈率的影響很大�？股貙甑男Ч饕啥鄠�方面決定,其中很重要的一點就是作用靶點與抗生素的親和力大小。因此,本課題致力于通過生物信息學手段,構(gòu)建出一種能準確、快速且廉價的預測p-內(nèi)酰胺類藥物對不同的$-內(nèi)酰胺類藥物靶點蛋白的親和力方法,從一個側(cè)面反映出抗菌藥物的抑菌效果,從而為新藥設(shè)計提供分子水平上親和力方面的參考。本文從rscb pdb （http://www.rcsb.org/pdb）網(wǎng)站下載了來源于大腸桿菌,鮑氏不動桿菌,肺炎克雷伯菌,肺炎鏈球菌,金黃色葡萄球菌,MRSA,銅綠假單胞菌,銅綠假單胞菌,流感嗜血桿菌等多種臨床常見致病細菌的56種pdb格式的青霉素結(jié)合蛋白和其他相關(guān)的酶蛋白以及部分蛋白... 

【文章來源】：西南大學重慶市 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：67 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖１．３分子對接的誘導契合模型??Ｆｉｇ?１．３．?Ｍｏｄｅｌ?ｏｆ?ｉｎｄｕｃｅｄ?ｆｉｔ??配體與受體的結(jié)合過程是一個很復雜的過程，涉及到配體和受體的去溶劑化、??

?Ｊ?Ｌｉｓｔ??Ｐｏｓｔｐｒｏｃｅｓｓｉｎｇ??圖１．１目前常用的藥物設(shè)計手段：虛擬蹄選的流程圖??Ｆｉｇｕｒｅ?１．１?ｔｈｅ?ｃｏｍｍｏｎ?ｍｅｔｈｏｄｓ?ｆｏｒ?ｄｒｕｇ?ｄｅｓｉｇｎ，?ｆｌｏｗｃｈａｒｔ?ｏｆ?ｖｉｒｔｕａｌ?ｓｃｒｅｅｎｉｎｇ??１．２．１分子對接的基本原理??分子對接最初思想起源于德國著名有機化學家Ｆｉｓｃｈｅｒ?Ｅ在１８９４年提出的“鎖??和明匙模型”，認為“鎖”和“朗匙”的相識別的首要條件是他們在空間形狀上要??互相匹配。??？????丨找?ｓｉｔｅ）??ａｉｉ４??ｆ—）?￣?ｈｓｍ??ｊ｜??ｍｏｄｖｌ??（３）??圖１．２分子對接的鎖和朗匙模型??Ｆｉｇ?１．２．?Ｍｏｄｅｌ?ｏｆ?ｔｈｅ?ｌｏｃｋ?ａｎｄ?ｋｅｙ??但事實上

【參考文獻】：
期刊論文
[1]反向分子對接-藥物靶點發(fā)現(xiàn)和確認的新途徑[J]. 范勝軍,李學軍.  生理科學進展. 2012(05)



本文編號：3471697