基于構(gòu)效關(guān)系的CCR5受體抑制劑的虛擬篩選及體外活性評(píng)價(jià)
發(fā)布時(shí)間：2021-04-08 18:21
一、目的本文旨在探討CCR5受體抑制劑的構(gòu)效關(guān)系,并在其基礎(chǔ)上進(jìn)行計(jì)算機(jī)虛擬篩選,將篩選出的化合物進(jìn)行體外活性驗(yàn)證,以期得到新的具有抗HIV活性的先導(dǎo)化合物。二、方法（1）3D-QSAR模型構(gòu)建從文獻(xiàn)中收集了48個(gè)CCR5受體抑制劑,采用基于公共骨架的疊合,構(gòu)建CoMFA和CoMSIA模型,評(píng)估模型的預(yù)測(cè)和擬合能力,并分析三維等勢(shì)圖。（2）藥效模型構(gòu)建構(gòu)建HipHop和HypoGen藥效團(tuán)模型,并根據(jù)藥效團(tuán)的統(tǒng)計(jì)學(xué)指標(biāo)和篩選能力選出最優(yōu)藥效團(tuán)模型,用于虛擬篩選。（3）分子對(duì)接模型構(gòu)建構(gòu)建Surflex-Dock和CDOCKER分子對(duì)接模型,分析CCR5受體抑制劑與受體之間的關(guān)鍵相互作用和關(guān)鍵氨基酸殘基,為虛擬篩選奠定基礎(chǔ)。（4）虛擬篩選采用多級(jí)篩選的策略,運(yùn)用“類藥五原則”、藥效團(tuán)模型和分子對(duì)接模型進(jìn)行逐級(jí)篩選。（5）化合物體外活性評(píng)價(jià)通過(guò)檢測(cè)HIV-1克隆病毒感染的TZM-b1細(xì)胞中熒光素酶報(bào)告基因的表達(dá)情況來(lái)判斷化合物的抗HIV-1活性。MTT實(shí)驗(yàn)考查化合物的細(xì)胞毒性。采用流式細(xì)胞術(shù)分析化合物對(duì)CCR5受體內(nèi)在化的影響。三、結(jié)果（1）3D-QSAR模型CoMFA模型的交叉驗(yàn)證系數(shù)值...
【文章來(lái)源】：南方醫(yī)科大學(xué)廣東省
【文章頁(yè)數(shù)】：90 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【部分圖文】：
圖１?ＨＩＶ－ｌ病毒入侵細(xì)胞的過(guò)程［１３］??Ｆｉ．?１?Ｔｈｅｒｏｃｅｓｓ?ｏｆ?ＨＩＶ－１?ｖｉｒｕｓ?ｉｎｖａｄｉｎｃｅｌｌｓ?［丨■’】??
項(xiàng)士學(xué)位論文???２個(gè)氨基酸，具有七次跨膜結(jié)構(gòu)，其三維結(jié)構(gòu)如Ｈｇ．?２所示，是細(xì)胞內(nèi)Ｐ趨??因子（ＲＡＮＴＥＳ、ＭＩＰ－ｌａ和ＭＩＰ－ｌｐ）的受體［１７］，可在多種細(xì)胞的表面表達(dá)，??ＮＫ細(xì)胞、小膠質(zhì)細(xì)胞、樹(shù)突狀細(xì)胞，但主要表達(dá)于記憶型Ｔ細(xì)胞表面，并??與炎癥反應(yīng)。??
項(xiàng)士學(xué)位論文???２個(gè)氨基酸，具有七次跨膜結(jié)構(gòu)，其三維結(jié)構(gòu)如Ｈｇ．?２所示，是細(xì)胞內(nèi)Ｐ趨??因子（ＲＡＮＴＥＳ、ＭＩＰ－ｌａ和ＭＩＰ－ｌｐ）的受體［１７］，可在多種細(xì)胞的表面表達(dá)，??ＮＫ細(xì)胞、小膠質(zhì)細(xì)胞、樹(shù)突狀細(xì)胞，但主要表達(dá)于記憶型Ｔ細(xì)胞表面，并??與炎癥反應(yīng)。??
【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]中國(guó)艾滋病診療指南（2018版）[J]. AIDS and Hepatitis C Professional Group,Society of Infectious Diseases,Chinese Medical Association;Chinese Center for Disease Control and Prevention;. 協(xié)和醫(yī)學(xué)雜志. 2019(01)
[2]2018年第3季度全國(guó)艾滋病性病疫情[J]. NCAIDS,NCSTD,China CDC;. 中國(guó)艾滋病性病. 2018(11)
[3]QSAR方法的研究進(jìn)展及其應(yīng)用[J]. 趙亞玲,黃方. 毒理學(xué)雜志. 2017(03)
[4]HIV蛋白酶抑制劑的臨床應(yīng)用進(jìn)展[J]. 王昀,江振洲,張陸勇. 中國(guó)臨床藥理學(xué)與治療學(xué). 2014(10)
[5]藥物開(kāi)發(fā)軟件Catalyst及其在計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)中的應(yīng)用[J]. 化瑋,杜麗娜. 北京聯(lián)合大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2011(01)
[6]分子對(duì)接方法的應(yīng)用與發(fā)展[J]. 段愛(ài)霞,陳晶,劉宏德,劉秀輝,盧小泉. 分析科學(xué)學(xué)報(bào). 2009(04)
[7]定量構(gòu)效關(guān)系研究進(jìn)展及其應(yīng)用[J]. 安麗英,相玉紅,張卓勇,胡文祥. 首都師范大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2006(03)
[8]比較分子場(chǎng)分析方法研究的最新進(jìn)展[J]. 侯廷軍,徐筱杰. 化學(xué)進(jìn)展. 2001(06)
本文編號(hào)：3126027
【文章來(lái)源】：南方醫(yī)科大學(xué)廣東省
【文章頁(yè)數(shù)】：90 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【部分圖文】：
圖１?ＨＩＶ－ｌ病毒入侵細(xì)胞的過(guò)程［１３］??Ｆｉ．?１?Ｔｈｅｒｏｃｅｓｓ?ｏｆ?ＨＩＶ－１?ｖｉｒｕｓ?ｉｎｖａｄｉｎｃｅｌｌｓ?［丨■’】??
項(xiàng)士學(xué)位論文???２個(gè)氨基酸，具有七次跨膜結(jié)構(gòu)，其三維結(jié)構(gòu)如Ｈｇ．?２所示，是細(xì)胞內(nèi)Ｐ趨??因子（ＲＡＮＴＥＳ、ＭＩＰ－ｌａ和ＭＩＰ－ｌｐ）的受體［１７］，可在多種細(xì)胞的表面表達(dá)，??ＮＫ細(xì)胞、小膠質(zhì)細(xì)胞、樹(shù)突狀細(xì)胞，但主要表達(dá)于記憶型Ｔ細(xì)胞表面，并??與炎癥反應(yīng)。??
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【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]中國(guó)艾滋病診療指南（2018版）[J]. AIDS and Hepatitis C Professional Group,Society of Infectious Diseases,Chinese Medical Association;Chinese Center for Disease Control and Prevention;. 協(xié)和醫(yī)學(xué)雜志. 2019(01)
[2]2018年第3季度全國(guó)艾滋病性病疫情[J]. NCAIDS,NCSTD,China CDC;. 中國(guó)艾滋病性病. 2018(11)
[3]QSAR方法的研究進(jìn)展及其應(yīng)用[J]. 趙亞玲,黃方. 毒理學(xué)雜志. 2017(03)
[4]HIV蛋白酶抑制劑的臨床應(yīng)用進(jìn)展[J]. 王昀,江振洲,張陸勇. 中國(guó)臨床藥理學(xué)與治療學(xué). 2014(10)
[5]藥物開(kāi)發(fā)軟件Catalyst及其在計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)中的應(yīng)用[J]. 化瑋,杜麗娜. 北京聯(lián)合大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2011(01)
[6]分子對(duì)接方法的應(yīng)用與發(fā)展[J]. 段愛(ài)霞,陳晶,劉宏德,劉秀輝,盧小泉. 分析科學(xué)學(xué)報(bào). 2009(04)
[7]定量構(gòu)效關(guān)系研究進(jìn)展及其應(yīng)用[J]. 安麗英,相玉紅,張卓勇,胡文祥. 首都師范大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2006(03)
[8]比較分子場(chǎng)分析方法研究的最新進(jìn)展[J]. 侯廷軍,徐筱杰. 化學(xué)進(jìn)展. 2001(06)
本文編號(hào)：3126027
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