隨著大數(shù)據(jù)技術(shù)的發(fā)展,現(xiàn)實(shí)中應(yīng)用到的數(shù)據(jù)量越來(lái)越龐大,數(shù)據(jù)種類也日漸豐富,多種數(shù)據(jù)所構(gòu)成的異構(gòu)網(wǎng)絡(luò)的應(yīng)用更加廣泛,比如文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫(kù)、社交網(wǎng)絡(luò)、商品推薦系統(tǒng)、生物信息等,這些數(shù)據(jù)庫(kù)系統(tǒng)都是由不同種類的數(shù)據(jù)所構(gòu)成的異構(gòu)信息網(wǎng)絡(luò)。在這些異構(gòu)數(shù)據(jù)中,我們要有效地篩選出可用數(shù)據(jù),并且從中挖掘出有意義的信息,才能充分實(shí)現(xiàn)數(shù)據(jù)的價(jià)值。因此,在異構(gòu)信息網(wǎng)絡(luò)上進(jìn)行數(shù)據(jù)挖掘任務(wù)就具有極其重要的研究?jī)r(jià)值。其中,生物信息異構(gòu)網(wǎng)絡(luò)的應(yīng)用意義尤其突出,由藥物和人類基因構(gòu)成的異構(gòu)網(wǎng)絡(luò)揭露了藥物與基因之間的相互作用關(guān)系,研究該網(wǎng)絡(luò)中節(jié)點(diǎn)之間的相關(guān)性并對(duì)未知的作用關(guān)系進(jìn)行預(yù)測(cè)不僅可以有效地解釋藥物如何影響人類基因的表達(dá),也可以通過(guò)檢測(cè)人類基因表達(dá)的擾動(dòng)水平來(lái)對(duì)藥物性能進(jìn)行評(píng)估。出于這樣的目的,本文著重研究了針對(duì)藥物和基因組成的生物信息異構(gòu)網(wǎng)絡(luò)的預(yù)測(cè)算法,并對(duì)新提出的方法和傳統(tǒng)預(yù)測(cè)方法進(jìn)行了性能對(duì)比。具體地,我們做了如下三項(xiàng)工作和創(chuàng)新:（1）在藥物-基因網(wǎng)絡(luò)的基礎(chǔ)上加入副作用數(shù)據(jù),擴(kuò)展藥物-副作用之間的關(guān)系。并創(chuàng)新性地在藥物-基因生物異構(gòu)信息網(wǎng)絡(luò)上運(yùn)用表示學(xué)習(xí)的方法提取網(wǎng)絡(luò)中的結(jié)構(gòu)特征,運(yùn)用兩種表示學(xué)習(xí)算法,把網(wǎng)絡(luò)中的結(jié)構(gòu)... 

【文章來(lái)源】：廈門大學(xué)福建省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁(yè)數(shù)】：81 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

圖１．３藥物－基因－副作用異構(gòu)信息網(wǎng)絡(luò)實(shí)例??

詼嗖鬩旃股?锿?緄囊┪錚??蜆叵翟げ夥椒ㄑ繡常崳?２．１．２數(shù)據(jù)介紹??在本文實(shí)驗(yàn)中，我們所使用的生物異構(gòu)信息網(wǎng)絡(luò)可以用圖２．１所示的簡(jiǎn)單圖??例概括。其中，藍(lán)色節(jié)點(diǎn)表示藥物，紅色節(jié)點(diǎn)表示基因，綠色節(jié)點(diǎn)則表示副作用。??而在這樣的網(wǎng)絡(luò)中，還包含了多個(gè)小的子網(wǎng)絡(luò)，比如由藍(lán)色實(shí)線相連接的藍(lán)色節(jié)??點(diǎn)，表示藥物之間的相似性網(wǎng)絡(luò)；而由粉紅色實(shí)線連接的紅色節(jié)點(diǎn)組成了基因相??似性網(wǎng)絡(luò)。此外，我們的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)中還包含了藥物影響基因表達(dá)、藥物引發(fā)副作??用兩種作用關(guān)系，在圖２．１所示的圖例中分別由橙色虛線和綠色虛線表示。這些??數(shù)據(jù)我們可以分別來(lái)進(jìn)行分析：??德４??Ａ??會(huì)?參??參１?Ａ??令會(huì)＾丨?＾??？修??一Ａ?Ｇ？２??？一臀?？??圖２．１藥物－基

詼嗖鬩旃股?锿?緄囊┪錚??蜆叵翟げ夥椒ㄑ繡常崳?２．１．２數(shù)據(jù)介紹??在本文實(shí)驗(yàn)中，我們所使用的生物異構(gòu)信息網(wǎng)絡(luò)可以用圖２．１所示的簡(jiǎn)單圖??例概括。其中，藍(lán)色節(jié)點(diǎn)表示藥物，紅色節(jié)點(diǎn)表示基因，綠色節(jié)點(diǎn)則表示副作用。??而在這樣的網(wǎng)絡(luò)中，還包含了多個(gè)小的子網(wǎng)絡(luò)，比如由藍(lán)色實(shí)線相連接的藍(lán)色節(jié)??點(diǎn)，表示藥物之間的相似性網(wǎng)絡(luò)；而由粉紅色實(shí)線連接的紅色節(jié)點(diǎn)組成了基因相??似性網(wǎng)絡(luò)。此外，我們的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)中還包含了藥物影響基因表達(dá)、藥物引發(fā)副作??用兩種作用關(guān)系，在圖２．１所示的圖例中分別由橙色虛線和綠色虛線表示。這些??數(shù)據(jù)我們可以分別來(lái)進(jìn)行分析：??德４??Ａ??會(huì)?參??參１?Ａ??令會(huì)＾丨?＾??？修??一Ａ?Ｇ？２??？一臀?？??圖２．１藥物－基

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]Meta-Path-Based Search and Mining in Heterogeneous Information Networks[J]. Yizhou Sun,Jiawei Han.  Tsinghua Science and Technology. 2013(04)



本文編號(hào)：3106404