精準(zhǔn)醫(yī)療是治療癌癥的必然趨勢(shì)。如何從龐大的數(shù)據(jù)中挖掘關(guān)鍵信息,根據(jù)遺傳信息等特性預(yù)測(cè)抗癌藥物的治療效果或毒副作用,及時(shí)為患者提供最合適的治療方案,是精準(zhǔn)醫(yī)療的意義所在。實(shí)際上,抗癌藥物敏感性數(shù)據(jù)（通過(guò)實(shí)驗(yàn)檢測(cè)的細(xì)胞系藥物藥理學(xué)反應(yīng)數(shù)據(jù)）往往有空缺元素、大的誤差甚至是損毀等現(xiàn)象,使得數(shù)據(jù)在分析處理時(shí)難度加大。聚焦上述問(wèn)題,本文基于癌癥藥物敏感性基因組學(xué)（GDSC）和癌細(xì)胞系百科全書（CCLE）兩大經(jīng)典數(shù)據(jù)庫(kù),建立矩陣填充、嶺回歸以及矩陣填充—嶺回歸加權(quán)預(yù)測(cè)模型,對(duì)抗癌藥物的敏感性進(jìn)行有效預(yù)測(cè),為抗癌藥物的篩選提供理論依據(jù)。首先綜合考慮藥物敏感性數(shù)據(jù)之間的關(guān)系,將抗癌藥物敏感性預(yù)測(cè)問(wèn)題轉(zhuǎn)化為矩陣填充問(wèn)題,建立矩陣填充預(yù)測(cè)模型。采用OptSpace算法,結(jié)合十折交叉驗(yàn)證方法,通過(guò)計(jì)算預(yù)測(cè)值與觀測(cè)值之間的皮爾森相關(guān)系數(shù)確定模型的最優(yōu)參數(shù)。矩陣填充模型取得了很好的預(yù)測(cè)效果,結(jié)果均高于流行的“細(xì)胞系網(wǎng)絡(luò)模型”、“藥物網(wǎng)絡(luò)模型”和“細(xì)胞系—藥物雙層網(wǎng)絡(luò)模型（即細(xì)胞系網(wǎng)絡(luò)模型和藥物網(wǎng)絡(luò)模型的加權(quán)組合）”�；诩僭O(shè)“基因表達(dá)譜與藥物敏感性數(shù)據(jù)之間存在線性關(guān)系”,論文接下來(lái)將基因的表達(dá)譜數(shù)據(jù)作為輸入特征,... 

【文章來(lái)源】：燕山大學(xué)河北省

【文章頁(yè)數(shù)】：68 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

藥物敏感性測(cè)量指標(biāo)


本文編號(hào)：3065425