精準(zhǔn)醫(yī)療是治療癌癥的必然趨勢。如何從龐大的數(shù)據(jù)中挖掘關(guān)鍵信息,根據(jù)遺傳信息等特性預(yù)測抗癌藥物的治療效果或毒副作用,及時為患者提供最合適的治療方案,是精準(zhǔn)醫(yī)療的意義所在。實際上,抗癌藥物敏感性數(shù)據(jù)（通過實驗檢測的細胞系藥物藥理學(xué)反應(yīng)數(shù)據(jù)）往往有空缺元素、大的誤差甚至是損毀等現(xiàn)象,使得數(shù)據(jù)在分析處理時難度加大。聚焦上述問題,本文基于癌癥藥物敏感性基因組學(xué)（GDSC）和癌細胞系百科全書（CCLE）兩大經(jīng)典數(shù)據(jù)庫,建立矩陣填充、嶺回歸以及矩陣填充—嶺回歸加權(quán)預(yù)測模型,對抗癌藥物的敏感性進行有效預(yù)測,為抗癌藥物的篩選提供理論依據(jù)。首先綜合考慮藥物敏感性數(shù)據(jù)之間的關(guān)系,將抗癌藥物敏感性預(yù)測問題轉(zhuǎn)化為矩陣填充問題,建立矩陣填充預(yù)測模型。采用OptSpace算法,結(jié)合十折交叉驗證方法,通過計算預(yù)測值與觀測值之間的皮爾森相關(guān)系數(shù)確定模型的最優(yōu)參數(shù)。矩陣填充模型取得了很好的預(yù)測效果,結(jié)果均高于流行的“細胞系網(wǎng)絡(luò)模型”、“藥物網(wǎng)絡(luò)模型”和“細胞系—藥物雙層網(wǎng)絡(luò)模型（即細胞系網(wǎng)絡(luò)模型和藥物網(wǎng)絡(luò)模型的加權(quán)組合）”�；诩僭O(shè)“基因表達譜與藥物敏感性數(shù)據(jù)之間存在線性關(guān)系”,論文接下來將基因的表達譜數(shù)據(jù)作為輸入特征,... 

【文章來源】：燕山大學(xué)河北省

【文章頁數(shù)】：68 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

藥物敏感性測量指標(biāo)


本文編號：3065425