基于藥物基因組學(xué)的個(gè)性化用藥探究及相關(guān)平臺(tái)的構(gòu)建
發(fā)布時(shí)間:2021-02-25 16:01
隨著測(cè)序技術(shù)的進(jìn)步,藥物基因組學(xué)在探究個(gè)性化用藥中扮演著越來(lái)越重要的角色。圍繞藥物基因組學(xué),我們需要思考如何減少藥物副作用并最大限度地增加疾病治愈效果。單核苷酸多態(tài)性(SNPs)影響個(gè)體用藥效果。通過(guò)利用gnomAD中的全基因組測(cè)序數(shù)據(jù),我們?cè)u(píng)估了嚴(yán)重藥物不良反應(yīng)在不同種族/民族的遺傳傾向。從5個(gè)流行的數(shù)據(jù)庫(kù)以及Wang的論文中,我們一共收集了5588個(gè)點(diǎn)突變-藥物對(duì),涉及356個(gè)基因中的2950個(gè)變異體,以及383個(gè)藥物。其中,有575對(duì)與嚴(yán)重不良事件有關(guān),包含79個(gè)基因中的372個(gè)變異體,以及103個(gè)藥物。在這些與嚴(yán)重不良藥物反應(yīng)相關(guān)的SNPs中,大約90%的SNPs其最小等位基因頻率(MAF)在每個(gè)人種中均小于1‰。嚴(yán)重藥物不良反應(yīng)的遺傳因素因種族而異,因個(gè)體而異,這充分說(shuō)明了個(gè)性化用藥的重要性。組合用藥能夠提高疾病的治療效果,并可以減少用藥劑量。當(dāng)前,藥理學(xué)的一個(gè)廣泛研究的問(wèn)題是如何預(yù)測(cè)有效的藥物組合,以提高臨床實(shí)踐效果。為達(dá)到預(yù)測(cè)藥物組合效果的目的,我們使用藥物屬性特征以及生物分子網(wǎng)絡(luò)構(gòu)造了預(yù)測(cè)模型。測(cè)試集的AUC值達(dá)0.84,優(yōu)于先前的預(yù)測(cè)方法,并具有良好的魯棒性以及廣泛的...
【文章來(lái)源】:華東師范大學(xué)上海市 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:82 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖1-1個(gè)性化醫(yī)療的基本框架
發(fā)現(xiàn)僅重疊 30 個(gè)蛋白(圖1-2)。關(guān)于這種小部分重疊有如下幾個(gè)原因:a.盡管大量的病人參與這些研究,但被用于挑選驅(qū)動(dòng)基因的統(tǒng)計(jì)方法可能存在偏差,以至于一個(gè)基因可能因達(dá)不到閾值而被漏掉;b.許多驅(qū)動(dòng)基因都是新發(fā)現(xiàn)的癌癥相關(guān)的基因,但幾乎沒(méi)有生物學(xué)的系統(tǒng)性研究。因此,時(shí)間會(huì)告訴我們這些驅(qū)動(dòng)基因是否為有用的藥物靶點(diǎn)。圖 1-2 癌癥藥物靶點(diǎn)與癌癥驅(qū)動(dòng)基因的重疊(Rita Santos, Oleg Ursu,Anna Gaulton et al, 2017[25])許多數(shù)據(jù)庫(kù)現(xiàn)在試圖收集和組織已有或潛在的藥物靶點(diǎn)信息,包括其化學(xué)結(jié)構(gòu)以及多樣性信息。其目的是創(chuàng)建包含相關(guān)信息的物質(zhì)“庫(kù)”,包括新靶點(diǎn)可能的配體信息(例如酶或受體)。更重要的是,需要理解分子識(shí)別的系統(tǒng)誤差。分子靶向
合理的癌癥藥物治療流程:從系統(tǒng)生物學(xué)到臨床整合
本文編號(hào):3051210
【文章來(lái)源】:華東師范大學(xué)上海市 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:82 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖1-1個(gè)性化醫(yī)療的基本框架
發(fā)現(xiàn)僅重疊 30 個(gè)蛋白(圖1-2)。關(guān)于這種小部分重疊有如下幾個(gè)原因:a.盡管大量的病人參與這些研究,但被用于挑選驅(qū)動(dòng)基因的統(tǒng)計(jì)方法可能存在偏差,以至于一個(gè)基因可能因達(dá)不到閾值而被漏掉;b.許多驅(qū)動(dòng)基因都是新發(fā)現(xiàn)的癌癥相關(guān)的基因,但幾乎沒(méi)有生物學(xué)的系統(tǒng)性研究。因此,時(shí)間會(huì)告訴我們這些驅(qū)動(dòng)基因是否為有用的藥物靶點(diǎn)。圖 1-2 癌癥藥物靶點(diǎn)與癌癥驅(qū)動(dòng)基因的重疊(Rita Santos, Oleg Ursu,Anna Gaulton et al, 2017[25])許多數(shù)據(jù)庫(kù)現(xiàn)在試圖收集和組織已有或潛在的藥物靶點(diǎn)信息,包括其化學(xué)結(jié)構(gòu)以及多樣性信息。其目的是創(chuàng)建包含相關(guān)信息的物質(zhì)“庫(kù)”,包括新靶點(diǎn)可能的配體信息(例如酶或受體)。更重要的是,需要理解分子識(shí)別的系統(tǒng)誤差。分子靶向
合理的癌癥藥物治療流程:從系統(tǒng)生物學(xué)到臨床整合
本文編號(hào):3051210
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