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基于藥物基因組學的個性化用藥探究及相關(guān)平臺的構(gòu)建

發(fā)布時間:2021-02-25 16:01
  隨著測序技術(shù)的進步,藥物基因組學在探究個性化用藥中扮演著越來越重要的角色。圍繞藥物基因組學,我們需要思考如何減少藥物副作用并最大限度地增加疾病治愈效果。單核苷酸多態(tài)性(SNPs)影響個體用藥效果。通過利用gnomAD中的全基因組測序數(shù)據(jù),我們評估了嚴重藥物不良反應在不同種族/民族的遺傳傾向。從5個流行的數(shù)據(jù)庫以及Wang的論文中,我們一共收集了5588個點突變-藥物對,涉及356個基因中的2950個變異體,以及383個藥物。其中,有575對與嚴重不良事件有關(guān),包含79個基因中的372個變異體,以及103個藥物。在這些與嚴重不良藥物反應相關(guān)的SNPs中,大約90%的SNPs其最小等位基因頻率(MAF)在每個人種中均小于1‰。嚴重藥物不良反應的遺傳因素因種族而異,因個體而異,這充分說明了個性化用藥的重要性。組合用藥能夠提高疾病的治療效果,并可以減少用藥劑量。當前,藥理學的一個廣泛研究的問題是如何預測有效的藥物組合,以提高臨床實踐效果。為達到預測藥物組合效果的目的,我們使用藥物屬性特征以及生物分子網(wǎng)絡構(gòu)造了預測模型。測試集的AUC值達0.84,優(yōu)于先前的預測方法,并具有良好的魯棒性以及廣泛的... 

【文章來源】:華東師范大學上海市 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】:82 頁

【學位級別】:碩士

【部分圖文】:

基于藥物基因組學的個性化用藥探究及相關(guān)平臺的構(gòu)建


圖1-1個性化醫(yī)療的基本框架

癌癥,靶點,基因


發(fā)現(xiàn)僅重疊 30 個蛋白(圖1-2)。關(guān)于這種小部分重疊有如下幾個原因:a.盡管大量的病人參與這些研究,但被用于挑選驅(qū)動基因的統(tǒng)計方法可能存在偏差,以至于一個基因可能因達不到閾值而被漏掉;b.許多驅(qū)動基因都是新發(fā)現(xiàn)的癌癥相關(guān)的基因,但幾乎沒有生物學的系統(tǒng)性研究。因此,時間會告訴我們這些驅(qū)動基因是否為有用的藥物靶點。圖 1-2 癌癥藥物靶點與癌癥驅(qū)動基因的重疊(Rita Santos, Oleg Ursu,Anna Gaulton et al, 2017[25])許多數(shù)據(jù)庫現(xiàn)在試圖收集和組織已有或潛在的藥物靶點信息,包括其化學結(jié)構(gòu)以及多樣性信息。其目的是創(chuàng)建包含相關(guān)信息的物質(zhì)“庫”,包括新靶點可能的配體信息(例如酶或受體)。更重要的是,需要理解分子識別的系統(tǒng)誤差。分子靶向

系統(tǒng)生物學,流程


合理的癌癥藥物治療流程:從系統(tǒng)生物學到臨床整合


本文編號:3051210

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