一、研究背景及目的本課題采用MOE2011,從期刊文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫,化學(xué)信息學(xué)數(shù)據(jù)庫等收集MDCK細(xì)胞滲透性數(shù)據(jù),計(jì)算并篩選分子描述符,進(jìn)行MDCK細(xì)胞滲透性模型的建立并評價(jià)。本課題旨在建立一個(gè)穩(wěn)健、可靠的MDCK細(xì)胞滲透性模型,為藥物早期發(fā)現(xiàn)過程中篩選提供一個(gè)MDCK細(xì)胞滲透性數(shù)據(jù)評價(jià)的有力工具。二、方法與結(jié)果1.MDCK細(xì)胞滲透性性模型的建立本章通過網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行MDCK細(xì)胞滲透性數(shù)據(jù)收集,并進(jìn)行格式轉(zhuǎn)換,并輸入。采用MOE2011進(jìn)行分子能量優(yōu)化,分子描述符（包括2D分子描述符和3D分子描述符）的計(jì)算,并隨機(jī)劃分為訓(xùn)練集和測試集。去除重復(fù),或相關(guān)性較大的描述符,或?yàn)槌Ａ康姆肿用枋龇?后采用GA-PLA進(jìn)行分子描述符的篩選,最終獲得10個(gè)分子描述符。采用MLR進(jìn)行線性模型的建立。模型的均方根誤差（RMSE）為0.43207,相關(guān)系數(shù)R2為0.86628。2.MDCK細(xì)胞滲透性模型的評價(jià)本章采用MDE2011AutoQS/AR模塊,用LOO驗(yàn)證法,5折交叉驗(yàn)證法,Y隨機(jī)化法,測試集驗(yàn)證法,模型應(yīng)用域等進(jìn)行MDCK細(xì)胞滲透性模型的評價(jià)。LOO RMSE為0.52019,LOO R2為0.80768... 

【文章來源】：中南大學(xué)湖南省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：88 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

藥物研發(fā)中主要失敗原因的分析

藥物口服生物利用的屏障

圖1-4分子描述符連接化學(xué)結(jié)構(gòu)和生物活性示意圖

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]QSAR模型內(nèi)部和外部驗(yàn)證方法綜述[J]. 覃禮堂,劉樹深,肖乾芬,吳慶生.  環(huán)境化學(xué). 2013(07)



本文編號：3025573