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基于高速離心和去污劑抽提的膜蛋白樣品制備方法的建立與優(yōu)化

發(fā)布時(shí)間:2020-07-20 12:29
【摘要】:膜蛋白可作為轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白、受體、酶及粘附-錨定蛋白,參與信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、亞細(xì)胞區(qū)室化、膜運(yùn)輸以及蛋白質(zhì)分泌等生物學(xué)過程,并可參與和維持細(xì)胞膜的完整結(jié)構(gòu)。目前已知約70%的藥物靶標(biāo)為膜蛋白,因此對膜蛋白的結(jié)構(gòu)與功能研究有助于加快新藥設(shè)計(jì)與研發(fā)。然而,由于膜蛋白的疏水性強(qiáng)及豐度低等理化性質(zhì)使其成為蛋白質(zhì)組學(xué)研究中有待解決的難點(diǎn)。本文建立了能夠提高膜蛋白檢出率的樣品制備方法,通過結(jié)合高速離心與去污劑抽提使得樣品處理過程相對簡便省時(shí),在提高樣品制備效率的同時(shí)又具有良好的重復(fù)性。我們通過液相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用方法(LC-MS/MS)在分離純化的膜蛋白組分中鑒定到更高比例的膜蛋白、整合膜蛋白和跨膜蛋白(76.6%、48.1%和40.6%),而總蛋白樣品中的對應(yīng)鑒定率分別為41.6%、16.4%和13.5%。本文建立的方法也利于高疏水性和含多次跨膜區(qū)的膜蛋白的鑒定,在膜蛋白組分鑒定到的2106個(gè)蛋白質(zhì)中,GRAVY值0的蛋白質(zhì)為486個(gè)(占23.0%),跨膜區(qū)數(shù)量≥2的蛋白質(zhì)為488個(gè)(占23.1%);通過對膜蛋白組分和總蛋白樣品中共同鑒定到的膜蛋白進(jìn)行分析,我們發(fā)現(xiàn)60.6%的蛋白質(zhì)在膜蛋白組分中具有更高的序列覆蓋率。因此,本文建立了無需依賴超高速離心機(jī)設(shè)備的膜蛋白樣品制備方法,為膜蛋白研究提供了更簡便快速的分析手段。
【學(xué)位授予單位】:華東理工大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號】:R943

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本文編號:2763442

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