發(fā)布時間：2018-06-07 08:38

  本文選題：藥物設(shè)計(jì) + 分子對接��； 參考：《中國抗生素雜志》2015年03期

【摘要】：近10年來,隨著X-射線晶體學(xué)和高通量測序等技術(shù)的不斷發(fā)展,越來越多的蛋白晶體結(jié)構(gòu)得到確證,其相應(yīng)的基因信息也隨之公布。蛋白質(zhì)等生物大分子結(jié)構(gòu)和功能信息的"井噴",產(chǎn)生了愈來愈多的藥物靶標(biāo),加之計(jì)算科學(xué)的蓬勃發(fā)展亦極大地促進(jìn)了分子對接和虛擬篩選技術(shù)在藥物設(shè)計(jì)領(lǐng)域的應(yīng)用推廣。如今,計(jì)算技術(shù)已成為藥物設(shè)計(jì)領(lǐng)域的重要手段之一,通過計(jì)算機(jī)模擬的分子對接運(yùn)算,研究人員能快速準(zhǔn)確地描述藥物與靶標(biāo)間的相互作用,從而縮短了藥物研發(fā)周期。本文簡要介紹了分子對接化學(xué)機(jī)理、分子表征方法以及3種分子對接機(jī)制。同時著重介紹了一些在藥物設(shè)計(jì)中廣泛使用的分子對接軟件,包括Auto Dock、SLIDE、DOCK以及Auto Dock Vina。這些軟件分別采用不同的搜索算法以及打分函數(shù),但其功能較為相似且囊括了分子對接領(lǐng)域的最近研究進(jìn)展。為了使分子對接過程更為方便快捷,研究者們不斷更新計(jì)算技術(shù),推出各種圖形分析工具。最后,以G蛋白偶聯(lián)受體和蛋白激酶為例,簡要說明分子對接及虛擬篩選領(lǐng)域的部分研究成果。
[Abstract]:In the past 10 years, with the development of X-ray crystallography and high-throughput sequencing, more and more protein crystal structures have been confirmed, and the corresponding gene information has been published. The "blowout" of structural and functional information of biological macromolecules, such as proteins, has produced more and more drug targets. In addition, the vigorous development of computational science has greatly promoted the application of molecular docking and virtual screening techniques in drug design. Nowadays, computational technology has become one of the most important methods in the field of drug design. With the molecular docking operation simulated by computer, researchers can describe the interaction between drug and target quickly and accurately, thus shortening the period of drug development. In this paper, the molecular docking mechanism, molecular characterization and three molecular docking mechanisms are briefly introduced. Some molecular docking software which are widely used in drug design, including Auto Dockl Sidedock and Auto Dock Vina., are also introduced in this paper. These softwares use different search algorithms and scoring functions, but their functions are similar and include the recent research progress in molecular docking. In order to make the molecular docking process more convenient, researchers constantly update the computing technology and develop various graphic analysis tools. Finally, taking G protein coupled receptors and protein kinases as examples, some research results in molecular docking and virtual screening are briefly described.
【作者單位】： 成都大學(xué)四川抗菌素工業(yè)研究所;正大天晴藥業(yè)集團(tuán)股份有限公司;
【基金】：四川省科技廳杰出青年基金項(xiàng)目(No.2013JQ0050) 成都大學(xué)校青年基金項(xiàng)目(No.2014XQCKS08)
【分類號】：R91

【共引文獻(xiàn)】

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8 李，

本文編號：1990556