本文選題：-羥甲基胞嘧啶(hm + C)��； 參考：《質(zhì)譜學(xué)報(bào)》2015年03期

【摘要】：5-羥甲基胞嘧啶(5-hydroxymethylcytosine,5hm C)是由TET蛋白家族催化氧化5-甲基胞嘧啶(5-methylcytosine,5m C)生成的,對(duì)哺乳動(dòng)物的基因轉(zhuǎn)錄和表達(dá)發(fā)揮著重要的調(diào)控作用。本研究建立了血液樣品中5hm C的液相色譜-串聯(lián)質(zhì)譜(LC-MS/MS)測(cè)定方法,采用試劑盒法提取血液基因組DNA,在甲酸環(huán)境下加熱裂解,采用HILIC色譜柱分離,電噴霧電離和多反應(yīng)監(jiān)測(cè)模式定量。結(jié)果表明:5hm C在0.1~50μg/L范圍內(nèi)線性關(guān)系良好,相關(guān)系數(shù)為0.999 4;高、中、低3個(gè)加標(biāo)水平的平均回收率為95.87%,日內(nèi)和日間的相對(duì)標(biāo)準(zhǔn)偏差分別為3.42%和4.12%;5hm C的檢出限(LOD,S/N=3)為0.050μg/L,定量限(LOQ,S/N=10)為0.100μg/L。該方法準(zhǔn)確、快速、穩(wěn)定、靈敏,可用于血液樣品全基因組中5-羥甲基胞嘧啶的檢測(cè)分析。
[Abstract]:5-hydroxycytosine 5-hydroxycytosine (5HMC) is produced by the TET protein family catalyzing the oxidation of 5-methylcytosine (5-methylcytosine) 5Hc, which plays an important role in the regulation of mammalian gene transcription and expression. A method for the determination of 5hm C in blood samples by liquid chromatography-tandem mass spectrometry (LC-MS / MS) was established in this paper. The genomic DNA was extracted by kit method, then heated and cracked in formic acid environment, and separated by HILIC chromatographic column. Quantitative analysis of electrospray ionization and multi-reaction monitoring model. The results showed that the linear relationship was good in the range of 0.1 渭 g / L, the correlation coefficient was 0.999 4, and the average recovery rate of high, middle and low standard addition levels was 95.87. The relative standard deviations between day and day were 3.42% and 4.12 渭 g / L, respectively. The detection limit of LOQS / N3 was 0.050 渭 g / L, and the quantitative limit was 0.100 渭 g / L. The method is accurate, rapid, stable and sensitive. It can be used for the detection and analysis of 5-hydroxymethyl cytosine in the whole genome of blood samples.
【作者單位】： 廣東醫(yī)學(xué)院分析中心;四川大學(xué)華西藥學(xué)院;
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金(21375029) 廣東省學(xué)科建設(shè)基金(2013CXZDA018)資助
【分類號(hào)】：O657.63;R927.2

【參考文獻(xiàn)】

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【共引文獻(xiàn)】

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【二級(jí)參考文獻(xiàn)】

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【相似文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：1974920