本文選題：-羥甲基胞嘧啶(hm + C)��； 參考：《質譜學報》2015年03期

【摘要】：5-羥甲基胞嘧啶(5-hydroxymethylcytosine,5hm C)是由TET蛋白家族催化氧化5-甲基胞嘧啶(5-methylcytosine,5m C)生成的,對哺乳動物的基因轉錄和表達發(fā)揮著重要的調控作用。本研究建立了血液樣品中5hm C的液相色譜-串聯(lián)質譜(LC-MS/MS)測定方法,采用試劑盒法提取血液基因組DNA,在甲酸環(huán)境下加熱裂解,采用HILIC色譜柱分離,電噴霧電離和多反應監(jiān)測模式定量。結果表明:5hm C在0.1~50μg/L范圍內(nèi)線性關系良好,相關系數(shù)為0.999 4;高、中、低3個加標水平的平均回收率為95.87%,日內(nèi)和日間的相對標準偏差分別為3.42%和4.12%;5hm C的檢出限(LOD,S/N=3)為0.050μg/L,定量限(LOQ,S/N=10)為0.100μg/L。該方法準確、快速、穩(wěn)定、靈敏,可用于血液樣品全基因組中5-羥甲基胞嘧啶的檢測分析。
[Abstract]:5-hydroxycytosine 5-hydroxycytosine (5HMC) is produced by the TET protein family catalyzing the oxidation of 5-methylcytosine (5-methylcytosine) 5Hc, which plays an important role in the regulation of mammalian gene transcription and expression. A method for the determination of 5hm C in blood samples by liquid chromatography-tandem mass spectrometry (LC-MS / MS) was established in this paper. The genomic DNA was extracted by kit method, then heated and cracked in formic acid environment, and separated by HILIC chromatographic column. Quantitative analysis of electrospray ionization and multi-reaction monitoring model. The results showed that the linear relationship was good in the range of 0.1 渭 g / L, the correlation coefficient was 0.999 4, and the average recovery rate of high, middle and low standard addition levels was 95.87. The relative standard deviations between day and day were 3.42% and 4.12 渭 g / L, respectively. The detection limit of LOQS / N3 was 0.050 渭 g / L, and the quantitative limit was 0.100 渭 g / L. The method is accurate, rapid, stable and sensitive. It can be used for the detection and analysis of 5-hydroxymethyl cytosine in the whole genome of blood samples.
【作者單位】： 廣東醫(yī)學院分析中心;四川大學華西藥學院;
【基金】：國家自然科學基金(21375029) 廣東省學科建設基金(2013CXZDA018)資助
【分類號】：O657.63;R927.2

【參考文獻】

相關期刊論文 前1條

1 陳麗宇;張立堅;張良滔;蔡春;;液相色譜-串聯(lián)質譜分析組織中基因組脫氧核糖核酸羥甲基胞嘧啶水平[J];色譜;2012年05期

【共引文獻】

相關期刊論文 前2條

1 木曉麗;張潔;彭思遠;王曉雪;申河清;;液相色譜-串聯(lián)質譜法同時測定生物組織全基因組DNA甲基化和羥甲基化水平[J];色譜;2014年07期

2 葛苗苗;蔡春;;表觀遺傳新標志物5hmC的研究進展[J];生物化學與生物物理進展;2014年09期

相關會議論文 前1條

1 陳光照;張立堅;文娟;蔡春;;DNA甲基化及其氧化產(chǎn)物的質譜分析[A];中國化學會首屆全國質譜分析學術研討會會議論文集[C];2014年

相關博士學位論文 前2條

1 蔣學慧;色譜—質譜聯(lián)用儀數(shù)據(jù)處理關鍵技術的研究[D];天津大學;2013年

2 馬紅;基于代謝組學技術的新疆哈薩克族食管鱗癌血漿特征代謝物及臨床意義研究[D];新疆醫(yī)科大學;2014年

相關碩士學位論文 前4條

1 陳曦;飛機草（Eupatorium odoratum L.）DNA甲基化多態(tài)性分析[D];哈爾濱師范大學;2013年

2 李莉;環(huán)境中苯系污染物與人類腫瘤相關DNA的相互作用研究[D];南京師范大學;2013年

3 鄭曉霞;電化學傳感器在DNA甲基化及HIV-1檢測中的應用[D];華南理工大學;2014年

4 解瓊玉;北京城區(qū)典型地表水中有機鹵素污染物的測定及其種態(tài)分布的研究[D];成都理工大學;2014年

【二級參考文獻】

相關期刊論文 前1條

1 張良滔;張立堅;張俊杰;劉春安;蔡春;;親水作用色譜法測定組織中全基因組DNA甲基化水平[J];色譜;2011年04期

【相似文獻】

相關期刊論文 前8條

1 謝如剛;鄢家明;張祝君;韓明成;;雌甾的雙羥甲基化和雙咪唑甲基化反應[J];有機化學;1992年04期

2 劉長路,蔣宗林,張林,蘇曉渝,謝如剛;雙咪唑、三咪唑的選擇性2-位羥甲基化反應[J];四川大學學報(自然科學版);1998年05期

3 木曉麗;張潔;彭思遠;王曉雪;申河清;;液相色譜-串聯(lián)質譜法同時測定生物組織全基因組DNA甲基化和羥甲基化水平[J];色譜;2014年07期

4 楊植;陳小華;劉云泉;陳憲宏;陳傳盛;李文華;許龍山;;碳納米管的羥甲基化及其馬來酸酐接枝研究[J];化學學報;2006年03期

5 杜焰,謝昌琮,廖維林;9,9-雙(羥甲基)芴的合成工藝研究[J];化工技術與開發(fā);2003年05期

6 武素麗,張淑芬,楊錦宗;尼龍-66的N-羥甲基化和N-甲氧甲基化改性及性能[J];高分子材料科學與工程;2000年06期

7 徐祖順,程時遠,沈超平;N—(羥甲基)丙烯酰胺的合成研究[J];湖北大學學報(自然科學版);1993年04期

8 ;[J];;年期

，

本文編號：1974920