焦磷酸測(cè)序技術(shù)對(duì)阿司匹林個(gè)體化用藥相關(guān)SNP位點(diǎn)分型
本文選題:阿司匹林 + 焦磷酸測(cè)序技術(shù) ; 參考:《中國(guó)藥科大學(xué)學(xué)報(bào)》2017年05期
【摘要】:阿司匹林的抗血小板作用在臨床存在顯著的個(gè)體差異,而rs5918、rs12041331和rs730012 3個(gè)單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)與阿司匹林的藥效和不良反應(yīng)有著密切的聯(lián)系。本文基于PCR結(jié)合焦磷酸測(cè)序技術(shù),建立了阿司匹林相關(guān)SNP位點(diǎn)的基因分型方法。自主設(shè)計(jì)擴(kuò)增引物和測(cè)序引物;優(yōu)化PCR擴(kuò)增條件,使3個(gè)位點(diǎn)能夠在相同的條件下擴(kuò)增并通過(guò)梯度稀釋基因組DNA檢測(cè)方法的靈敏度;最后,分別基于本文建立的新方法和Sanger測(cè)序技術(shù)對(duì)20例臨床樣本進(jìn)行3個(gè)位點(diǎn)的基因分型,驗(yàn)證該方法的準(zhǔn)確性。結(jié)果顯示,本文成功建立了阿司匹林個(gè)體化用藥相關(guān)SNP位點(diǎn)的基因分型方法,檢測(cè)下限低至0.4 ng基因組DNA,用兩種方法對(duì)20例臨床樣本進(jìn)行3個(gè)位點(diǎn)的基因分型,結(jié)果完全一致,說(shuō)明該方法有較高的準(zhǔn)確性。
[Abstract]:There were significant individual differences in the antiplatelet effects of aspirin, and three single nucleotide polymorphisms (SNPs) of rs5918, rs12041331 and rs730012 were closely related to the pharmacodynamics and adverse reactions of aspirin. Based on PCR and pyrosequencing techniques, a genotyping method for aspirin associated SNP loci was established. The amplification primers and sequencing primers were designed independently; the PCR amplification conditions were optimized so that the three loci could be amplified under the same conditions and the sensitivity of the method was determined by gradient dilution of genomic DNA. Based on the new method established in this paper and Sanger sequencing technique, the three loci of 20 clinical samples were genotyped to verify the accuracy of the method. The results showed that the genotyping method of SNP loci associated with individual aspirin use was successfully established. The detection limit was as low as 0.4 ng genomic DNA.Twenty clinical samples were genotyped with three loci by two methods, and the results were consistent with each other. It shows that this method has high accuracy.
【作者單位】: 中國(guó)藥科大學(xué)藥物質(zhì)量與安全預(yù)警教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;河北省人民醫(yī)院藥學(xué)部;南京軍區(qū)南京總醫(yī)院藥理科;
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(No.81673390) 江蘇省重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃資助項(xiàng)目(No.BE2016745) 江蘇省自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(No.BK20151445) 藥物質(zhì)量與安全預(yù)警教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室資助項(xiàng)目(No.DQCP2015MS02) 中國(guó)藥科大學(xué)藥學(xué)基地科研訓(xùn)練及科研能力提高資助項(xiàng)目(No.J1310032) 江蘇省“青藍(lán)工程”資助項(xiàng)目~~
【分類號(hào)】:R96
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本文編號(hào):1921897
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