雙河洞放線菌多樣性和抗菌活性的初步研究——以陰河洞和杉林洞為例
本文選題:洞穴 切入點:放線菌 出處:《中國巖溶》2015年06期
【摘要】:放線菌是微生物中重要的藥用菌,其產(chǎn)生的抗生素是20世紀(jì)醫(yī)學(xué)皇冠上最耀眼的明珠,但隨著抗生素濫用,抗生素耐藥現(xiàn)象日趨嚴(yán)重,因此從特殊生態(tài)環(huán)境中發(fā)現(xiàn)新放線菌物種和新抗生素克服耐藥是科研人員正在嘗試的途徑之一,文章初步探究雙河洞系統(tǒng)中陰河洞和杉林洞兩個支洞的放線菌多樣性,并對分離菌株的抗菌活性進行篩選。以純培養(yǎng)方法獲得放線菌,以16SrRNA基因序列比對,分析菌株類別,獲得的菌株進行液體發(fā)酵,紙片瓊脂擴散法測定其發(fā)酵產(chǎn)物對真菌和細菌的抗菌活性,同時用PCR技術(shù)進行NRPS、PKS I和PKS II抗生素生物合成基因的探測。從兩個支洞樣品中分離到的放線菌分布于7個科10個屬,兩個洞共66株放線菌中有32株的發(fā)酵產(chǎn)物在至少一個抗菌活性篩選中顯示陽性,總陽性率為48.5%?股厣锖铣苫虻某醪教綔y結(jié)果顯示,31株菌存在至少一個生物合成基因,NRPS 28株,PKS I17株,PKS II 21株,其中12株同時具有3種生物合成基因。初步顯示了雙河洞系統(tǒng)蘊含豐富的放線菌資源,值得深入研究。
[Abstract]:Actinomycetes is one of the most important pharmaceutical bacteria in microbes. The antibiotics produced by actinomycetes are the most dazzling pearl in the medical crown of the 20th century. However, with the abuse of antibiotics, the phenomenon of antibiotic resistance is becoming more and more serious.Therefore, the discovery of new actinomycetes species and new antibiotics to overcome drug resistance is one of the ways that researchers are trying to find new actinomycetes from special ecological environment. This paper preliminarily explores the diversity of actinomycetes in two branch caves in Shuanghe Cave system: Yinhe Cave and Cunninghamia lanceolata Cave.The antimicrobial activity of the isolated strain was screened.Actinomycetes were obtained by pure culture, 16SrRNA gene sequence alignment was used to analyze the strain types, the obtained strains were fermented in liquid, and the antibacterial activity of the fermentation products against fungi and bacteria was determined by disk Agar diffusion method.At the same time, PCR technique was used to detect the antibiotic biosynthesis genes of NRPSN PKS I and PKS II.The preliminary detection results of antibiotic biosynthesis genes showed that at least one biosynthesis gene was found in 31 strains of bacteria, including at least one biosynthesis gene, PKS I17 strain and PKS II 21 strain, among which 12 strains had 3 biosynthesis genes.The results show that the Shuanghe Cave system contains abundant actinomycetes, which is worthy of further study.
【作者單位】: 中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院&北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院醫(yī)藥生物技術(shù)研究所;貴州省山地資源研究所;貴州省喀斯特洞穴資源開發(fā)利用工程技術(shù)研究中心;
【基金】:2014年度中央級公益性科研院所基本科研業(yè)務(wù)專項(IMBF201407) 國家自然科學(xué)基金(81172963,81321004) 十二五“重大新藥創(chuàng)制”科技重大專項(2012ZX09301-002-001-018) 貴州省科技計劃(黔科合G字[2014]4004)
【分類號】:Q939.132;R915
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