一種新氨基酸描述符用于ACE抑制肽QSAR研究
本文關(guān)鍵詞:一種新氨基酸描述符用于ACE抑制肽QSAR研究 出處:《精細化工》2016年05期 論文類型:期刊論文
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【摘要】:從20種天然氨基酸的41個分子輪廓指數(shù)(randic molecular profiles,R)、44個分子特征值指數(shù)(eigenvalue based indices,E)和47個分子運轉(zhuǎn)路徑數(shù)目(walk and path counts,W)分別進行主成分分析,得出1種新的氨基酸描述符(scores vector of R,E,W-SVREW)。將其應(yīng)用于血管緊張素轉(zhuǎn)化酶(ACE)抑制二肽、三肽、四肽、九肽結(jié)構(gòu)表征,應(yīng)用多元線性回歸建立定量構(gòu)效關(guān)系模型,同時采用內(nèi)部與外部雙重驗證的方法驗證模型的穩(wěn)定性。所建ACE抑制二肽、三肽、四肽、九肽的模型復(fù)相關(guān)系數(shù)(R_(cum)~2)、留一法(LOO)交互校驗復(fù)相關(guān)系數(shù)(R_(cv)~2)和外部樣本校驗相關(guān)系數(shù)(Q_(ext)~2)分別為:0.907、0.791、0.633;0.831、0.603、0.723;0.834、0.668、0.718;0.964、0.853、0.948。經(jīng)研究表明:SVREW描述符應(yīng)用于ACE抑制肽結(jié)構(gòu)表征所建模型穩(wěn)定性與預(yù)測能力均較好。
[Abstract]:A total of 41 molecular contours of 20 natural amino acids were obtained from the molecular profile index (molecular). 44 molecular eigenvalue indices (eigenvalue based indices). E) and the number of the 47 molecular pathways walk and path counts W) for principal component analysis, respectively. A new amino acid descriptor, scores vector of Rhizoma VREWN, was obtained. It was applied to angiotensin converting enzyme (ACE-ACE) to inhibit dipeptide and tripeptide. The quantitative structure-activity relationship model was established by multiple linear regression. The stability of the model was verified by internal and external double validation. The ACE was used to inhibit dipeptide, tripeptide and tetrapeptide. The complex correlation coefficient of the model of nine peptides is 2). The correlation coefficient of cross check and external sample verification is 0. 907 / 0.791, and that of external sample is 0. 907 / 0.791, respectively. 0.633; 0.831C 0.603U 0.723; 0.834-0. 668, 0.718; The results showed that the structure of the ACE inhibitory peptide was characterized by using the w / SVREW descriptor, and the stability and prediction ability of the model were good.
【作者單位】: 陜西科技大學(xué)化學(xué)與化工學(xué)院;
【基金】:國家自然科學(xué)基金(21475081) 陜西省自然科學(xué)基礎(chǔ)研究計劃(2015JM2057) 陜西科技大學(xué)研究生創(chuàng)新基金~~
【分類號】:R943
【正文快照】: 據(jù)調(diào)查,2000年全球約有26.4%的成年人患有高血壓,到2025年全球?qū)⒖赡苡?9.2%的成年高血壓病患者。我國大約有2億高血壓患者,而且居民的高血壓患病率還在不斷升高,每年新增的高血壓病人多達1000萬[1]。在體內(nèi)升壓調(diào)節(jié)系統(tǒng)腎素-血管緊張素系統(tǒng)(Renin-Angiotensin System,RAS)和
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,本文編號:1407443
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