本文關鍵詞：基于藥效團模型及虛擬篩選方法發(fā)現(xiàn)EphB4全新抑制劑

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【摘要】：采用計算機模擬手段,通過建立3D-QSAR模型、虛擬篩選及分子對接方法發(fā)現(xiàn)惡性腫瘤治療靶標EphB4潛在的抑制劑。首先,通過Catalyst/HypoGen算法建立藥效團模型。其中最好的模型Hypo1具有最高的科雷爾值(Correl值):0.96,最低的RMS值:0.89,與固定消耗值(fixed cost):89.20最接近的總消耗值(total cost):101.26,和最高的Δ消耗值(Δcost值):89.14。隨后,Hypo1經(jīng)過測試集驗證及Fischer隨機驗證,并用于篩選化合物數(shù)據(jù)庫。然后利用類藥性篩選及分子對接手段進一步減少分子數(shù)量。最終,根據(jù)預測活性分析、對接得分值及結(jié)合模式分析,得到23個具有全新骨架的化合物作為Eph B4的潛在抑制劑可用于后續(xù)研究。
【作者單位】： 四川大學生命科學學院;四川大學化學工程學院;
【基金】：四川省科技支撐計劃資助項目(No.2011SZ0116)~~
【分類號】：R91
【正文快照】： 引用本文邵鑫,衣倩穎,楊春蕾.基于藥效團模型及虛擬篩選方法發(fā)現(xiàn)Eph B4全新抑制劑[J].中國藥科大學學報,2016,47(1):38-47.Cite this article as:SHAO Xin,YI Qianying,YANG Chunlei.Discovery of novel Eph B4 inhibitors based on pharmacophore modeling and virtualscreen

【相似文獻】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 V．Leroux;B．Maigret;;基于結(jié)構(gòu)的虛擬篩選技術能更廣泛應用于現(xiàn)代藥物發(fā)現(xiàn)?(英文)[J];計算機與應用化學;2007年01期

2 董國霞;姜威;司書毅;易紅;張月琴;;基于結(jié)構(gòu)的肽脫甲�；敢种苿┑奶摂M篩選及活性研究[J];中國抗生素雜志;2012年01期

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本文編號：1195112