本文關(guān)鍵詞：HIV-1非核苷類逆轉(zhuǎn)錄酶抑制劑藥效團模型構(gòu)建及新抑制劑的搜索

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【摘要】：【目的】構(gòu)建I型人類免疫缺陷病毒(human immunodeficiency virus type 1,HIV-1)非核苷類逆轉(zhuǎn)錄酶抑制劑(nonnucleoside reverse transcriptase inhibitors,NNRTIs)的藥效團模型,通過對中藥化學數(shù)據(jù)庫(traditional Chinese medicine database,TCMD)的搜索,在中藥中尋找新型抗耐藥的NNRTIs。【方法】從已知的NNRTIs與逆轉(zhuǎn)錄酶復合物的晶體結(jié)構(gòu)出發(fā),通過構(gòu)象分析和藥效團識別等方法,構(gòu)建NNRTIs的藥效團模型并檢驗其可靠性;基于藥效團模型對TCMD進行數(shù)據(jù)庫搜索,發(fā)現(xiàn)新型潛在的NNRTIs�！窘Y(jié)果】從PDB中檢索出2010年至2014年RT與NNRTIs復合物的晶體結(jié)構(gòu)30個,從中抽提出其活性配體,建立了一個包含30個活性配體的小分子數(shù)據(jù)庫;通過對上市藥物TMC278和TMC125及高活性抑制劑DJZ的構(gòu)象疊合和藥效特征基團分析構(gòu)建了新的NNRTIs藥效團模型,該模型包含了5個藥效特征基團;以符合這5個藥效特征基團中任意4個為條件,在活性配體小分子數(shù)據(jù)庫中驗證性搜索出18個化合物,檢出率為60.0%;基于五點藥效團模型對TCMD進行數(shù)據(jù)庫搜索得到272個化合物�！窘Y(jié)論】以TMC278、TMC125和DJZ構(gòu)建的五點藥效團模型,以符合其中任意4個為條件,在活性配體小分子數(shù)據(jù)庫中的檢出率達到60.0%,表明所建藥效團模型是可靠的。
【作者單位】： 武警后勤學院基礎(chǔ)部藥物設(shè)計實驗室;天津市職業(yè)與環(huán)境危害生物標志物重點實驗室;武警后勤學院訓練部教保處;武警后勤學院附屬醫(yī)院藥劑科;
【基金】：國家自然科學基金項目(81241114;30472166) 天津市科技攻關(guān)計劃重點科技攻關(guān)專項基金資助項目(06YFGZSH07000)
【分類號】：R91
【正文快照】： 艾滋病(acquired immune deficiency syndrome,AIDS)即獲得性免疫缺陷綜合征,是一種由人類免疫缺陷病毒(human immunodeficiency virus,HIV)感染而導致一系列條件致病微生物感染和腫瘤發(fā)生的致命性綜合征[1]。HIV屬于逆轉(zhuǎn)錄病毒科慢病毒屬中的靈長類免疫缺陷病毒亞屬,分為HIV-

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本文編號：1146998