發(fā)布時(shí)間：2017-11-06 02:34

  本文關(guān)鍵詞：HIV-1非核苷類(lèi)逆轉(zhuǎn)錄酶抑制劑藥效團(tuán)模型構(gòu)建及新抑制劑的搜索

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【摘要】：【目的】構(gòu)建I型人類(lèi)免疫缺陷病毒(human immunodeficiency virus type 1,HIV-1)非核苷類(lèi)逆轉(zhuǎn)錄酶抑制劑(nonnucleoside reverse transcriptase inhibitors,NNRTIs)的藥效團(tuán)模型,通過(guò)對(duì)中藥化學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)(traditional Chinese medicine database,TCMD)的搜索,在中藥中尋找新型抗耐藥的NNRTIs�！痉椒ā繌囊阎腘NRTIs與逆轉(zhuǎn)錄酶復(fù)合物的晶體結(jié)構(gòu)出發(fā),通過(guò)構(gòu)象分析和藥效團(tuán)識(shí)別等方法,構(gòu)建NNRTIs的藥效團(tuán)模型并檢驗(yàn)其可靠性;基于藥效團(tuán)模型對(duì)TCMD進(jìn)行數(shù)據(jù)庫(kù)搜索,發(fā)現(xiàn)新型潛在的NNRTIs�！窘Y(jié)果】從PDB中檢索出2010年至2014年RT與NNRTIs復(fù)合物的晶體結(jié)構(gòu)30個(gè),從中抽提出其活性配體,建立了一個(gè)包含30個(gè)活性配體的小分子數(shù)據(jù)庫(kù);通過(guò)對(duì)上市藥物TMC278和TMC125及高活性抑制劑DJZ的構(gòu)象疊合和藥效特征基團(tuán)分析構(gòu)建了新的NNRTIs藥效團(tuán)模型,該模型包含了5個(gè)藥效特征基團(tuán);以符合這5個(gè)藥效特征基團(tuán)中任意4個(gè)為條件,在活性配體小分子數(shù)據(jù)庫(kù)中驗(yàn)證性搜索出18個(gè)化合物,檢出率為60.0%;基于五點(diǎn)藥效團(tuán)模型對(duì)TCMD進(jìn)行數(shù)據(jù)庫(kù)搜索得到272個(gè)化合物�！窘Y(jié)論】以TMC278、TMC125和DJZ構(gòu)建的五點(diǎn)藥效團(tuán)模型,以符合其中任意4個(gè)為條件,在活性配體小分子數(shù)據(jù)庫(kù)中的檢出率達(dá)到60.0%,表明所建藥效團(tuán)模型是可靠的。
【作者單位】： 武警后勤學(xué)院基礎(chǔ)部藥物設(shè)計(jì)實(shí)驗(yàn)室;天津市職業(yè)與環(huán)境危害生物標(biāo)志物重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;武警后勤學(xué)院訓(xùn)練部教保處;武警后勤學(xué)院附屬醫(yī)院藥劑科;
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(81241114;30472166) 天津市科技攻關(guān)計(jì)劃重點(diǎn)科技攻關(guān)專項(xiàng)基金資助項(xiàng)目(06YFGZSH07000)
【分類(lèi)號(hào)】：R91
【正文快照】： 艾滋病(acquired immune deficiency syndrome,AIDS)即獲得性免疫缺陷綜合征,是一種由人類(lèi)免疫缺陷病毒(human immunodeficiency virus,HIV)感染而導(dǎo)致一系列條件致病微生物感染和腫瘤發(fā)生的致命性綜合征[1]。HIV屬于逆轉(zhuǎn)錄病毒科慢病毒屬中的靈長(zhǎng)類(lèi)免疫缺陷病毒亞屬,分為HIV-

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