木脂素類化合物中組蛋白去乙;敢种苿┑奶摂M篩選
本文關(guān)鍵詞:木脂素類化合物中組蛋白去乙;敢种苿┑奶摂M篩選
更多相關(guān)文章: 木脂素 組蛋白去乙; 虛擬篩選 分子對(duì)接
【摘要】:目的:虛擬篩選具有組蛋白去乙酰化酶(HDAC)抑制作用的木脂素類化合物。方法:以"木酯素""Lignanoid"為關(guān)鍵詞,查詢中國知網(wǎng)、維普、Pub Med等中外文數(shù)據(jù)庫中相關(guān)文獻(xiàn),收集木脂素類化合物作為配體構(gòu)建配體庫,從蛋白質(zhì)晶體數(shù)據(jù)庫(PDB)中選取兩個(gè)HDAC受體HDAC2(PDB code:4LXZ)和HDAC8(PDB code:1T69),運(yùn)用SYBYL-X 2.0軟件將配體和受體三維結(jié)構(gòu)的活性位點(diǎn)進(jìn)行對(duì)接,用總得分來反映配體與受體的親和力大小。結(jié)果:將收集的345個(gè)木質(zhì)素類化合物與4LXZ、1T69原配體一起構(gòu)建了有347種配體的配體庫,其中編號(hào)為275、271、110、200、056、258、181、129、037、270、187的配體與HDAC2和HDAC8受體有較好的親和力,配體與受體的殘基以氫鍵的方式結(jié)合。結(jié)論:木脂素類化合物具有抑制HDAC的作用;虛擬篩選方法可作為預(yù)測天然產(chǎn)物潛在活性的有效手段,為木脂素類化合物新的藥理活性研究提供了快捷途徑和理論指導(dǎo)。
【作者單位】: 重慶理工大學(xué)藥學(xué)與生物工程學(xué)院;
【關(guān)鍵詞】: 木脂素 組蛋白去乙; 虛擬篩選 分子對(duì)接
【分類號(hào)】:R91
【正文快照】: *碩士研究生。研究方向:天然藥物化學(xué)。E-mail:372941719@qq.com組蛋白去乙;敢种苿(Histone deacetylase inhibitor,HDACI)是通過抑制組蛋白去乙酰化酶(Histone deacetylase,HDAC)的活性而促進(jìn)目標(biāo)蛋白質(zhì)的高度乙;,抑制細(xì)胞增殖,誘導(dǎo)大量包括成神經(jīng)細(xì)胞瘤[1]、乳腺癌[
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,本文編號(hào):1042850
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