JAK激酶抑制劑抗腫瘤作用的分子對(duì)接研究
本文關(guān)鍵詞:JAK激酶抑制劑抗腫瘤作用的分子對(duì)接研究
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【摘要】:近年來(lái)惡性腫瘤的發(fā)病率持續(xù)攀升,死亡率居高不下,對(duì)人類(lèi)健康構(gòu)成了嚴(yán)重的威脅,攻克腫瘤已成為醫(yī)藥領(lǐng)域重點(diǎn)研究的課題之一。目前的研究思路是先確定合適的抗腫瘤靶點(diǎn),然后針對(duì)該靶點(diǎn)尋找高效低毒的抗腫瘤活性成分。在眾多的抗腫瘤靶點(diǎn)中,細(xì)胞信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)的JAK激酶是研究比較熱門(mén)的靶點(diǎn)之一。JAK激酶包含了4個(gè)家族成員:JAK1蛋白、JAK2蛋白、JAK3蛋白和TYK2蛋白;谠摪悬c(diǎn)上市的抗腫瘤藥物也不少,但大部分研究的JAK激酶抑制劑選擇性不高,對(duì)蛋白的抑制作用不強(qiáng),也可能產(chǎn)生不少的毒性反應(yīng)。原因可能是對(duì)這些抑制劑分子具體的作用機(jī)制研究還不夠深入,很多JAK激酶抑制劑分子往往不能與相應(yīng)靶蛋白的活性位點(diǎn)在空間上完全匹配,因而不能發(fā)揮更強(qiáng)的生物效應(yīng),甚至產(chǎn)生一定的毒性;诖,本論文在參考文獻(xiàn)的基礎(chǔ)上,利用分子對(duì)接的方法模擬了已上市或處在臨床研究中的11個(gè)JAK激酶抑制劑分子與4個(gè)JAK激酶家族成員蛋白的結(jié)合模式和相互作用,從分子水平探討了JAK激酶抑制劑分子對(duì)靶蛋白產(chǎn)生抑制作用的主要機(jī)制,分析各抑制劑分子選擇性不高或活性低的原因,并對(duì)抑制劑分子可能的結(jié)構(gòu)修飾方向提出設(shè)想。實(shí)驗(yàn)研究表明:JAK激酶家族的4個(gè)成員蛋白雖屬同一家族,但活性位點(diǎn)存在一定差異,每個(gè)活性位點(diǎn)均發(fā)揮相應(yīng)的生物效應(yīng),抑制劑分子只有占據(jù)活性腔中的所有結(jié)合位點(diǎn),才能表現(xiàn)出對(duì)該靶蛋白較強(qiáng)的結(jié)合能力和較強(qiáng)的抑制活性。JAK1蛋白和JAK2蛋白的晶體結(jié)構(gòu)相似,活性位點(diǎn)均由P-loop區(qū)域、Hinge區(qū)域和A-loop區(qū)域構(gòu)成,抑制劑分子對(duì)這兩種蛋白的選擇性較差,結(jié)合能力相當(dāng);JAK3蛋白的活性區(qū)域是由富含甘氨酸的區(qū)域(Gly-loop)和“鉸鏈區(qū)”(Hinge region)構(gòu)成,抑制劑分子只有同時(shí)占據(jù)這兩個(gè)位點(diǎn)方能發(fā)揮最大的效應(yīng);TYK2蛋白活性位點(diǎn)是由一個(gè)large pocket和一個(gè)開(kāi)放區(qū)域P-loop區(qū)域構(gòu)成,抑制劑分子只要牢牢占據(jù)這兩個(gè)位點(diǎn),均能發(fā)揮出很強(qiáng)的TYK2蛋白抑制活性。通過(guò)對(duì)接構(gòu)象分析,我們發(fā)現(xiàn)類(lèi)似平面結(jié)構(gòu)的多環(huán)分子對(duì)JAK1蛋白、JAK2蛋白和JAK3蛋白的選擇性較高,而對(duì)TYK2蛋白的選擇性較差。
【關(guān)鍵詞】:JAK激酶 抑制劑 腫瘤 分子對(duì)接
【學(xué)位授予單位】:南昌大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類(lèi)號(hào)】:R979.1
【目錄】:
- 摘要3-4
- ABSTRACT4-8
- 第1章 緒論8-16
- 1.1 JAK激酶家族成員8-10
- 1.1.1 JAK1蛋白、JAK2蛋白8-9
- 1.1.2 JAK3蛋白9-10
- 1.1.3 TYK2蛋白10
- 1.2 抗腫瘤JAK激酶抑制劑的研究進(jìn)展10-14
- 1.2.1 已申請(qǐng)上市的JAK激酶抑制劑10-11
- 1.2.1.1 Lestaurtinib10-11
- 1.2.1.2 SAR30250311
- 1.2.1.3 Ruxolitibib11
- 1.2.2 早期臨床研究的JAK激酶抑制劑11-13
- 1.2.2.1 CYT38712
- 1.2.2.2 AZD148012
- 1.2.2.3 BMS911543、Pacritinib12-13
- 1.2.3 臨床前研究的JAK激酶抑制劑13-14
- 1.3 分子對(duì)接14
- 1.4 本論文的研究?jī)?nèi)容及研究意義14-16
- 第2章 分子對(duì)接研究16-23
- 2.1 分子對(duì)接簡(jiǎn)介16-17
- 2.1.1 分子對(duì)接的概念16
- 2.1.2 分子對(duì)接的基本方法16
- 2.1.3 配體與受體之間的作用16-17
- 2.2 分子對(duì)接平臺(tái)的建立及分子對(duì)接配體分子和受體分子的預(yù)處理17-21
- 2.2.1 硬件平臺(tái)及軟件平臺(tái)17
- 2.2.2 配體分子三維模型的構(gòu)建17-19
- 2.2.3 受體分子三維模型的構(gòu)建19-20
- 2.2.4 計(jì)算網(wǎng)格和對(duì)接參數(shù)的設(shè)置20-21
- 2.3 配體分子與受體分子的分子對(duì)接21-23
- 第3章 結(jié)果與討論23-29
- 3.1 分子對(duì)接結(jié)果23
- 3.2 分子對(duì)接數(shù)據(jù)分析與構(gòu)象分析23-29
- 3.2.1 分子對(duì)接數(shù)據(jù)分析23-24
- 3.2.2 分子對(duì)接構(gòu)像分析24-29
- 3.2.2.1 化合物 7,化合物3與JAK1蛋白分子對(duì)接構(gòu)象分析24-25
- 3.2.2.2 化合物 1,化合物2與JAK2蛋白分子對(duì)接構(gòu)象分析25-26
- 3.2.2.3 化合物 1、化合物 7,化合物4與JAK3蛋白分子對(duì)接構(gòu)象分析26-27
- 3.2.2.4 化合物 9、化合物11與TYK2蛋白分子對(duì)接構(gòu)象分析27
- 3.2.2.5 化合物 5 與各靶蛋白分子對(duì)接構(gòu)象分析27-29
- 第4章 結(jié)語(yǔ)29-30
- 致謝30-31
- 參考文獻(xiàn)31-32
【相似文獻(xiàn)】
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本文編號(hào):1041266
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