本文關(guān)鍵詞：布洛芬與人血白蛋白位點Ⅱ動態(tài)結(jié)合過程的分子模擬:一種結(jié)合途徑分析

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【摘要】：人血白蛋白(HSA)主要有兩個藥物結(jié)合位點,位點I和位點II,許多小分子優(yōu)先結(jié)合在位點II上,包括抗炎類藥物布洛芬。本文采用分子模擬方法研究了布洛芬小分子與HSA位點II結(jié)合的動態(tài)過程,探討了二者的結(jié)合機制。首先構(gòu)建了50個隨機分布的布洛芬與HSA復合物體系,經(jīng)50 ns分子動力學模擬,其中一個布洛芬分子穩(wěn)定結(jié)合于位點II�；谠摲肿拥倪\動軌跡分析,發(fā)現(xiàn)布洛芬的結(jié)合可分為四個階段,即遠程吸引、表面結(jié)合調(diào)整、進入位點II空腔和穩(wěn)定結(jié)合。比較范德華和靜電相互作用能,發(fā)現(xiàn)初期以靜電吸引為主,中期在HSA表面的兩個極性區(qū)域間調(diào)整,逐步轉(zhuǎn)移至位點II附近;然后在位點II入口處的極性殘基和附近疏水殘基的共同作用下,布洛芬進入位點II空腔;進入空腔后,靜電和疏水共同作用形成穩(wěn)定結(jié)合。在結(jié)合過程中,位點II附近的蛋白表面發(fā)生明顯改變,體現(xiàn)出一定的"誘導契合"作用,同時分子模擬得到的結(jié)合模式和布洛芬-HSA結(jié)合的晶體結(jié)構(gòu)類似。結(jié)果表明,分子模擬可以輔助研究小分子和蛋白結(jié)合的動態(tài)過程,從分子水平闡述相關(guān)結(jié)合機制。
【作者單位】： 浙江大學化學工程與生物工程學院生物質(zhì)化工教育部重點實驗室;
【關(guān)鍵詞】： 人血白蛋白 位點Ⅱ 布洛芬 動態(tài)結(jié)合 分子模擬
【基金】：國家自然科學基金(21476198,21276228,21576233)資助項目~~
【分類號】：R96
【正文快照】： 1引言人血白蛋白(HSA),是人血漿中含量最豐富的一種蛋白質(zhì),占血漿總蛋白含量的60%。HSA能與許多內(nèi)源性和外源性化合物結(jié)合,是一種重要的存儲和轉(zhuǎn)運蛋白,還具有維持血液滲透壓、組成緩沖體系和為細胞提供原料等諸多生理功能。HSA由585個氨基酸殘基組成,單鏈,呈心形,其中α螺旋

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本文編號：1029329