背景與目的:長(zhǎng)鏈非編碼RNAs(long noncoding RNAs,lncRNAs)已被證實(shí)參與冠心病(coronary artery disease,CAD)的病理生理過(guò)程,但仍缺乏系統(tǒng)的研究。本研究通過(guò)冠心病病例對(duì)照l(shuí)ncRNA表達(dá)譜研究及大樣本的重復(fù)驗(yàn)證,探索lncRNA在冠心病中的表達(dá)模式,鑒定診斷冠心病的lncRNA生物標(biāo)志物;通過(guò)初步功能研究,明確了差異表達(dá)lncRNA對(duì)鄰近基因和炎癥相關(guān)基因的表達(dá)調(diào)控作用。為動(dòng)脈粥樣硬化及冠心病的預(yù)防、診斷和治療提供新線索。方法:1.應(yīng)用高通量的lncRNA/mRNA芯片,在93例冠心病患者和48例健康對(duì)照對(duì)象的外周血單個(gè)核細(xì)胞中(peripheral blood mononuclear cells,PBMCs),進(jìn)行全基因組水平的lncRNA/mRNA表達(dá)譜分析。應(yīng)用GO(gene ontology)分析及通路分析,探索差異表達(dá)的mRNAs與差異表達(dá)的lncRNAs之間的潛在的生物功能關(guān)聯(lián);應(yīng)用通路網(wǎng)絡(luò)分析探究顯著通路的相互作用關(guān)系。2.基于差異倍數(shù)、P值、預(yù)測(cè)靶基因以及與CAD或者血脂異常易感位點(diǎn)位置關(guān)系等篩選標(biāo)準(zhǔn),挑選了 7個(gè)l...

【文章頁(yè)數(shù)】：67 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

圖１技術(shù)路線流程圖??９??

北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院?碩士研究生學(xué)位論文??因此，本研究主要內(nèi)容包括如下幾個(gè)部分：??１．進(jìn)行冠心病全基因組ＩｎｃＲＮＡ／ｍＲＮＡ表達(dá)譜分析；應(yīng)用ＧＯ分析及通路分析探??索差異表達(dá)的ｍＲＮＡ與差異表達(dá)的ＩｎｃＲＮＡ之間的潛在的生物功能關(guān)聯(lián)；應(yīng)用??ｑＲＴ－ＰＣＲ在冠心病病....

圖２生物表達(dá)譜差異表達(dá)ＩｎｃＲＮＡ／ｍＲＮＡ聚類(lèi)分析與火山圖??

ＩｎｃＲＮＡｓ和８９０個(gè)差異表達(dá)的ｍＲＮＡｓ；其中８３３個(gè)ＩｎｃＲＮＡｓ和４２７個(gè)ｍＲＮＡｓ顯??著上調(diào)，３７７個(gè)ＩｎｃＲＮＡｓ和４６３個(gè)ｍＲＮＡｓ顯著下調(diào)。差異表達(dá)基因聚類(lèi)分析和火??山圖見(jiàn)圖２。??２５??

圖３表達(dá)譜芯片數(shù)據(jù)的生物信息學(xué)分析結(jié)果??Ａ：前３０個(gè)的生物過(guò)程、分子成分以及分子功能的富集Ｇ?

差異表達(dá)ｍＲＮＡｓ的信號(hào)通路進(jìn)行相互作用分析。最顯著富集的前３０個(gè)ＧＯ條目包??括細(xì)胞因子活動(dòng)（Ｇ０：０００５１２５）、趨化因子活動(dòng)（Ｇ０：０００５１２５）和趨化因子受體結(jié)??合（Ｇ〇：００４２３７９）等（圖３Ａ）。差異ｍＲＮＡｓ結(jié)合差異表達(dá)ＩｎｃＲＮＡｓ的通路分析顯??示排名前....

圖６?４個(gè)ＩｎｃＲＮＡｓ在ＣＡＤ中ＲＯＣ曲線下面積結(jié)果，（Ａ）：?ＩｎｃＲＮＡ??ＥＮＳＴ０００００６０２５５８．１?和（Ｂ）：?ＡＳ０３９７３?的?ＡＵＣ?結(jié)果；??

?Ｊ??０．０?０．２?０．４?０．６?０．８?１．０?ｒ??１?－Ｓｐｅｃｉｆｉｃｉｔｙ??ｆ?ｏｂｊｅｃｔ??？?ＫＮＳＴ０ｔｆＨＪｆｔＵ？８８．１＋ｕｃ０Ｈｈｆｄ．ｌ?０Ａ５１（０ＪＪ１８５－０Ｊ？３６？??ＡＲｃ＋ＢＭＩ＋ＧＩｕｃｏｓｅ＋Ｈｄｌ?０．７７０９（０．７３４６....

本文編號(hào)：3903057