Hsa-miR-181b-5p在急性Stanford A型主動(dòng)脈夾層發(fā)病的作用及機(jī)制探索
發(fā)布時(shí)間:2024-01-26 22:08
目的:通過對(duì)前期急性Stanford A型主動(dòng)脈夾層病例對(duì)照研究的主動(dòng)脈血管壁組織基因芯片檢測(cè)結(jié)果進(jìn)行分析,選取miRNA差異表達(dá)譜中表達(dá)差異明顯且具有研究價(jià)值的hsa-miR-181b-5p,通過生物信息學(xué)分析來探討其在急性Stanford A型主動(dòng)脈夾層發(fā)病可能參與的分子機(jī)制。方法:選取2018年1月至2019年3月期間中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院阜外醫(yī)院深圳醫(yī)院(深圳市孫逸仙心血管醫(yī)院)收治的急性Stanford A型患者,收集手術(shù)切取的升主動(dòng)脈夾層破口處血管壁組織10例,同一患者非主動(dòng)脈夾層破口處升主動(dòng)脈血管壁組織10例;另行選取同時(shí)期行心臟移植手術(shù)或主動(dòng)脈瓣置換術(shù)患者主動(dòng)脈血管壁組織5例。前期運(yùn)用基因芯片檢測(cè)技術(shù)獲取血管壁組織miRNAs表達(dá)譜。綜合分析后選出目標(biāo)miRNA,通過在線數(shù)據(jù)庫microBase、David等分析網(wǎng)站進(jìn)行相關(guān)生物信息學(xué)分析,研究hsa-miR-181b-5p參與急性Stanford A型主動(dòng)脈夾層可能的信號(hào)通路及發(fā)病機(jī)制。結(jié)果:基因芯片初篩結(jié)果進(jìn)行組間分析,在同一篩選標(biāo)準(zhǔn)下,A/C有193種miRNAs明顯差異表達(dá),其中48中上調(diào)表達(dá),145種下調(diào)表達(dá);A/B共...
【文章頁數(shù)】:79 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
主要英文縮略詞表
第一章 緒論
第二章 實(shí)驗(yàn)研究材料與方法
2.1 研究材料
2.1.1 研究標(biāo)本來源與分組
2.1.2 倫理審核和臨床資料收集
2.1.3 研究所用試劑、相關(guān)儀器及設(shè)備
2.1.4 研究樣本制作流程
2.2 實(shí)驗(yàn)研究方法
2.2.1 預(yù)存樣本totalRNA的提取以及質(zhì)量檢測(cè)
2.2.2 預(yù)存樣本totalRNA的去磷酸化及標(biāo)記
2.2.3 芯片洗滌及掃描
2.2.4 數(shù)據(jù)提取及分析
2.3 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)和生信分析
2.3.1 一般臨床資料統(tǒng)計(jì)
2.3.2 miRNA的篩選與生物信息學(xué)分析
第三章 實(shí)驗(yàn)研究結(jié)果
3.1 入選者臨床資料的統(tǒng)計(jì)結(jié)果
3.2 樣本totalRNA質(zhì)檢結(jié)果
3.2.1 totalRNA純度、濃度與總量測(cè)定結(jié)果
3.2.2 totalRNA完整性測(cè)定結(jié)果
3.2.3 基因芯片掃描圖
3.3 miRNA芯片掃描結(jié)果
3.3.1 三組樣本miRNA差異表達(dá)結(jié)果
3.3.2 篩選結(jié)果繪制表格與圖片
3.3.3 目標(biāo)miRNA的選取
3.4 生物信息學(xué)分析結(jié)果
3.4.1 目標(biāo)miRNA下游靶基因預(yù)測(cè)
3.4.2 繪制靶基因網(wǎng)絡(luò)圖譜
3.4.3 關(guān)鍵基因的篩選
3.4.4 目標(biāo)miRNA下游靶基因的GO分析結(jié)果
3.4.5 KEGG通路分析
3.5 miRNAs/lncRNA互作網(wǎng)絡(luò)
第四章 討論
4.1 研究樣本質(zhì)量檢測(cè)
4.2 芯片初篩結(jié)果以及目標(biāo)miRNA的選取
4.3 目標(biāo)miRNA的靶基因預(yù)測(cè)以及GO分析
4.4 目標(biāo)miRNA靶基因KEGG pathway分析
4.4.1 PI3K-Akt信號(hào)通路
4.4.2 MAPK信號(hào)通路
4.4.3 黏合連接(Adherens junction)
4.5 不足及展望
第五章 結(jié)論
第六章 參考文獻(xiàn)
第七章 文獻(xiàn)綜述
參考文獻(xiàn)
研究生期間發(fā)表的論文
致謝
本文編號(hào):3885779
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【學(xué)位級(jí)別】:碩士
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摘要
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主要英文縮略詞表
第一章 緒論
第二章 實(shí)驗(yàn)研究材料與方法
2.1 研究材料
2.1.1 研究標(biāo)本來源與分組
2.1.2 倫理審核和臨床資料收集
2.1.3 研究所用試劑、相關(guān)儀器及設(shè)備
2.1.4 研究樣本制作流程
2.2 實(shí)驗(yàn)研究方法
2.2.1 預(yù)存樣本totalRNA的提取以及質(zhì)量檢測(cè)
2.2.2 預(yù)存樣本totalRNA的去磷酸化及標(biāo)記
2.2.3 芯片洗滌及掃描
2.2.4 數(shù)據(jù)提取及分析
2.3 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)和生信分析
2.3.1 一般臨床資料統(tǒng)計(jì)
2.3.2 miRNA的篩選與生物信息學(xué)分析
第三章 實(shí)驗(yàn)研究結(jié)果
3.1 入選者臨床資料的統(tǒng)計(jì)結(jié)果
3.2 樣本totalRNA質(zhì)檢結(jié)果
3.2.1 totalRNA純度、濃度與總量測(cè)定結(jié)果
3.2.2 totalRNA完整性測(cè)定結(jié)果
3.2.3 基因芯片掃描圖
3.3 miRNA芯片掃描結(jié)果
3.3.1 三組樣本miRNA差異表達(dá)結(jié)果
3.3.2 篩選結(jié)果繪制表格與圖片
3.3.3 目標(biāo)miRNA的選取
3.4 生物信息學(xué)分析結(jié)果
3.4.1 目標(biāo)miRNA下游靶基因預(yù)測(cè)
3.4.2 繪制靶基因網(wǎng)絡(luò)圖譜
3.4.3 關(guān)鍵基因的篩選
3.4.4 目標(biāo)miRNA下游靶基因的GO分析結(jié)果
3.4.5 KEGG通路分析
3.5 miRNAs/lncRNA互作網(wǎng)絡(luò)
第四章 討論
4.1 研究樣本質(zhì)量檢測(cè)
4.2 芯片初篩結(jié)果以及目標(biāo)miRNA的選取
4.3 目標(biāo)miRNA的靶基因預(yù)測(cè)以及GO分析
4.4 目標(biāo)miRNA靶基因KEGG pathway分析
4.4.1 PI3K-Akt信號(hào)通路
4.4.2 MAPK信號(hào)通路
4.4.3 黏合連接(Adherens junction)
4.5 不足及展望
第五章 結(jié)論
第六章 參考文獻(xiàn)
第七章 文獻(xiàn)綜述
參考文獻(xiàn)
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本文編號(hào):3885779
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