Hsa-miR-181b-5p在急性Stanford A型主動脈夾層發(fā)病的作用及機制探索
發(fā)布時間:2024-01-26 22:08
目的:通過對前期急性Stanford A型主動脈夾層病例對照研究的主動脈血管壁組織基因芯片檢測結(jié)果進行分析,選取miRNA差異表達譜中表達差異明顯且具有研究價值的hsa-miR-181b-5p,通過生物信息學分析來探討其在急性Stanford A型主動脈夾層發(fā)病可能參與的分子機制。方法:選取2018年1月至2019年3月期間中國醫(yī)學科學院阜外醫(yī)院深圳醫(yī)院(深圳市孫逸仙心血管醫(yī)院)收治的急性Stanford A型患者,收集手術(shù)切取的升主動脈夾層破口處血管壁組織10例,同一患者非主動脈夾層破口處升主動脈血管壁組織10例;另行選取同時期行心臟移植手術(shù)或主動脈瓣置換術(shù)患者主動脈血管壁組織5例。前期運用基因芯片檢測技術(shù)獲取血管壁組織miRNAs表達譜。綜合分析后選出目標miRNA,通過在線數(shù)據(jù)庫microBase、David等分析網(wǎng)站進行相關(guān)生物信息學分析,研究hsa-miR-181b-5p參與急性Stanford A型主動脈夾層可能的信號通路及發(fā)病機制。結(jié)果:基因芯片初篩結(jié)果進行組間分析,在同一篩選標準下,A/C有193種miRNAs明顯差異表達,其中48中上調(diào)表達,145種下調(diào)表達;A/B共...
【文章頁數(shù)】:79 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
主要英文縮略詞表
第一章 緒論
第二章 實驗研究材料與方法
2.1 研究材料
2.1.1 研究標本來源與分組
2.1.2 倫理審核和臨床資料收集
2.1.3 研究所用試劑、相關(guān)儀器及設(shè)備
2.1.4 研究樣本制作流程
2.2 實驗研究方法
2.2.1 預存樣本totalRNA的提取以及質(zhì)量檢測
2.2.2 預存樣本totalRNA的去磷酸化及標記
2.2.3 芯片洗滌及掃描
2.2.4 數(shù)據(jù)提取及分析
2.3 數(shù)據(jù)統(tǒng)計和生信分析
2.3.1 一般臨床資料統(tǒng)計
2.3.2 miRNA的篩選與生物信息學分析
第三章 實驗研究結(jié)果
3.1 入選者臨床資料的統(tǒng)計結(jié)果
3.2 樣本totalRNA質(zhì)檢結(jié)果
3.2.1 totalRNA純度、濃度與總量測定結(jié)果
3.2.2 totalRNA完整性測定結(jié)果
3.2.3 基因芯片掃描圖
3.3 miRNA芯片掃描結(jié)果
3.3.1 三組樣本miRNA差異表達結(jié)果
3.3.2 篩選結(jié)果繪制表格與圖片
3.3.3 目標miRNA的選取
3.4 生物信息學分析結(jié)果
3.4.1 目標miRNA下游靶基因預測
3.4.2 繪制靶基因網(wǎng)絡圖譜
3.4.3 關(guān)鍵基因的篩選
3.4.4 目標miRNA下游靶基因的GO分析結(jié)果
3.4.5 KEGG通路分析
3.5 miRNAs/lncRNA互作網(wǎng)絡
第四章 討論
4.1 研究樣本質(zhì)量檢測
4.2 芯片初篩結(jié)果以及目標miRNA的選取
4.3 目標miRNA的靶基因預測以及GO分析
4.4 目標miRNA靶基因KEGG pathway分析
4.4.1 PI3K-Akt信號通路
4.4.2 MAPK信號通路
4.4.3 黏合連接(Adherens junction)
4.5 不足及展望
第五章 結(jié)論
第六章 參考文獻
第七章 文獻綜述
參考文獻
研究生期間發(fā)表的論文
致謝
本文編號:3885779
【文章頁數(shù)】:79 頁
【學位級別】:碩士
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主要英文縮略詞表
第一章 緒論
第二章 實驗研究材料與方法
2.1 研究材料
2.1.1 研究標本來源與分組
2.1.2 倫理審核和臨床資料收集
2.1.3 研究所用試劑、相關(guān)儀器及設(shè)備
2.1.4 研究樣本制作流程
2.2 實驗研究方法
2.2.1 預存樣本totalRNA的提取以及質(zhì)量檢測
2.2.2 預存樣本totalRNA的去磷酸化及標記
2.2.3 芯片洗滌及掃描
2.2.4 數(shù)據(jù)提取及分析
2.3 數(shù)據(jù)統(tǒng)計和生信分析
2.3.1 一般臨床資料統(tǒng)計
2.3.2 miRNA的篩選與生物信息學分析
第三章 實驗研究結(jié)果
3.1 入選者臨床資料的統(tǒng)計結(jié)果
3.2 樣本totalRNA質(zhì)檢結(jié)果
3.2.1 totalRNA純度、濃度與總量測定結(jié)果
3.2.2 totalRNA完整性測定結(jié)果
3.2.3 基因芯片掃描圖
3.3 miRNA芯片掃描結(jié)果
3.3.1 三組樣本miRNA差異表達結(jié)果
3.3.2 篩選結(jié)果繪制表格與圖片
3.3.3 目標miRNA的選取
3.4 生物信息學分析結(jié)果
3.4.1 目標miRNA下游靶基因預測
3.4.2 繪制靶基因網(wǎng)絡圖譜
3.4.3 關(guān)鍵基因的篩選
3.4.4 目標miRNA下游靶基因的GO分析結(jié)果
3.4.5 KEGG通路分析
3.5 miRNAs/lncRNA互作網(wǎng)絡
第四章 討論
4.1 研究樣本質(zhì)量檢測
4.2 芯片初篩結(jié)果以及目標miRNA的選取
4.3 目標miRNA的靶基因預測以及GO分析
4.4 目標miRNA靶基因KEGG pathway分析
4.4.1 PI3K-Akt信號通路
4.4.2 MAPK信號通路
4.4.3 黏合連接(Adherens junction)
4.5 不足及展望
第五章 結(jié)論
第六章 參考文獻
第七章 文獻綜述
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本文編號:3885779
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