microRNA(miRNA)是非編碼RNA大家族中的一員,可以調(diào)控基因表達,這也就意味著它會影響細胞水平上的多種生物學(xué)過程,進而影響組織、器官、系統(tǒng)乃至生命體。所以,與miRNA相關(guān)的功能性障礙與包括癌癥在內(nèi)的眾多人類疾病有著密切的聯(lián)系。我們希望能較快地發(fā)現(xiàn)并了解更多的miRNA與人類疾病的關(guān)聯(lián),再通過miRNA檢測從而幫助治療疾病乃至于疾病預(yù)防。由于傳統(tǒng)的“濕實驗”耗時耗力,且在一定程度上缺乏方向性,所以利用已有相關(guān)數(shù)據(jù)去預(yù)測可能的miRNA-疾病關(guān)聯(lián),可以為下一步的“濕實驗”提供有益的幫助。在前人相關(guān)工作的基礎(chǔ)上,本文提出一種基于多網(wǎng)絡(luò)的miRNA與疾病關(guān)系標簽傳播預(yù)測模型(Heterogeneous Label Propagation for MiRNA-Disease Association prediction,HLPMDA)。首先,收集整理有關(guān)miRNA、疾病和長非編碼RNA的異質(zhì)數(shù)據(jù);其次,以已知人類miRNA-疾病相互關(guān)聯(lián)、長鏈非編碼RNA-疾病關(guān)聯(lián)、長鏈非編碼RNA-miRNA相互作用、miRNA功能相似性以及疾病語義相似性數(shù)據(jù)為基礎(chǔ),分別建立miRNA-疾病關(guān)聯(lián)網(wǎng)...

【文章頁數(shù)】：70 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
致謝
摘要
abstract
變量注釋表
1 緒論
    1.1 本課題研究背景與意義
    1.2 研究現(xiàn)狀及發(fā)展趨勢
    1.3 本文的研究內(nèi)容
    1.4 本文結(jié)構(gòu)
2 miRNA及其功能相似性
    2.1 miRNA簡介
    2.2 miRNA功能相似性
    2.3 長鏈非編碼RNA及其與miRNA的相互作用
    2.4 本章小結(jié)
3 疾病及其相似性
    3.1 有向無環(huán)圖
    3.2 疾病語義相似性
    3.3 本章小結(jié)
4 數(shù)據(jù)集與數(shù)據(jù)預(yù)處理
    4.1 人類miRNA與疾病關(guān)聯(lián)
    4.2 長鏈非編碼RNA與疾病關(guān)聯(lián)
    4.3 長鏈非編碼RNA-miRNA相互作用
    4.4 miRNA功能相似性
    4.5 高斯相互作用譜核相似性
    4.6 疾病和miRNA相似性的結(jié)合
    4.7 本章小結(jié)
5 預(yù)測模型
    5.1 投影
    5.2 標簽傳播
    5.3 迭代的收斂與極限
    5.4 網(wǎng)絡(luò)在線服務(wù)
    5.5 本章小結(jié)
6 模型評估
    6.1 交叉驗證評估
    6.2 案例評估
    6.3 本章小結(jié)
7 討論
    7.1 總體討論
    7.2 與隨機游走算法的比較
    7.3 本章小結(jié)
8 結(jié)論
    8.1 本文工作總結(jié)
    8.2 展望
參考文獻
作者簡歷
學(xué)位論文數(shù)據(jù)集



本文編號：3884835