為篩選結(jié)直腸癌MTX耐藥的潛在靶點,運用生物信息學(xué)手段從GEO（Gene expression omnibus）收集并整理有關(guān)結(jié)直腸癌甲氨蝶呤（MTX）耐藥相關(guān)數(shù)據(jù),利用GEO2R篩選對照細(xì)胞和耐藥細(xì)胞表達(dá)差異的基因,并用細(xì)胞生物學(xué)手段驗證該基因是否參與MTX耐藥.結(jié)果顯示15個基因在MTX耐藥結(jié)直腸癌細(xì)胞中差異表達(dá),其中13個上調(diào),2個下調(diào);其中表達(dá)差異最顯著的是SPINK1.通過細(xì)胞增殖實驗、細(xì)胞毒性實驗證實敲低SPINK1抑制細(xì)胞增殖,解除結(jié)直腸癌甲氨蝶呤耐藥性.該研究表明SPINK1可能是結(jié)直腸癌耐藥潛在的治療靶點.利用細(xì)胞生物學(xué)方法進(jìn)一步確認(rèn)其功能,可為進(jìn)一步實驗驗證提供依據(jù). 

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【文章目錄】：
0 引言
1 材料與方法
    1.1 材料
    1.2 方法
        1.2.1 獲取GEO數(shù)據(jù)集：
        1.2.2 MTX耐藥差異表達(dá)基因分析：
        1.2.3 候選耐藥基因?qū)嶒烌炞C：
2 結(jié)果
    2.1 結(jié)直腸癌MTX耐藥差異表達(dá)基因
    2.2 SPINK1抑制結(jié)直腸癌細(xì)胞增殖(圖2)
    2.3 SPINK1低表達(dá)顯著增強(qiáng)結(jié)直腸癌對MTX敏感性(圖3)
3 討論



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