利用生物信息學(xué)發(fā)現(xiàn)SPINK1為結(jié)直腸癌MTX耐藥潛在治療靶點
發(fā)布時間:2022-10-31 20:03
為篩選結(jié)直腸癌MTX耐藥的潛在靶點,運用生物信息學(xué)手段從GEO(Gene expression omnibus)收集并整理有關(guān)結(jié)直腸癌甲氨蝶呤(MTX)耐藥相關(guān)數(shù)據(jù),利用GEO2R篩選對照細胞和耐藥細胞表達差異的基因,并用細胞生物學(xué)手段驗證該基因是否參與MTX耐藥.結(jié)果顯示15個基因在MTX耐藥結(jié)直腸癌細胞中差異表達,其中13個上調(diào),2個下調(diào);其中表達差異最顯著的是SPINK1.通過細胞增殖實驗、細胞毒性實驗證實敲低SPINK1抑制細胞增殖,解除結(jié)直腸癌甲氨蝶呤耐藥性.該研究表明SPINK1可能是結(jié)直腸癌耐藥潛在的治療靶點.利用細胞生物學(xué)方法進一步確認其功能,可為進一步實驗驗證提供依據(jù).
【文章頁數(shù)】:4 頁
【文章目錄】:
0 引言
1 材料與方法
1.1 材料
1.2 方法
1.2.1 獲取GEO數(shù)據(jù)集:
1.2.2 MTX耐藥差異表達基因分析:
1.2.3 候選耐藥基因?qū)嶒烌炞C:
2 結(jié)果
2.1 結(jié)直腸癌MTX耐藥差異表達基因
2.2 SPINK1抑制結(jié)直腸癌細胞增殖(圖2)
2.3 SPINK1低表達顯著增強結(jié)直腸癌對MTX敏感性(圖3)
3 討論
本文編號:3699632
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1 材料與方法
1.1 材料
1.2 方法
1.2.1 獲取GEO數(shù)據(jù)集:
1.2.2 MTX耐藥差異表達基因分析:
1.2.3 候選耐藥基因?qū)嶒烌炞C:
2 結(jié)果
2.1 結(jié)直腸癌MTX耐藥差異表達基因
2.2 SPINK1抑制結(jié)直腸癌細胞增殖(圖2)
2.3 SPINK1低表達顯著增強結(jié)直腸癌對MTX敏感性(圖3)
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