本文關(guān)鍵詞：基于語義關(guān)系和鏈接分析的疾病知識提取研究，，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：近年來,生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的在線文獻數(shù)量呈指數(shù)增長,大量的文獻查詢費時費力,無法高效地提供給用戶所需的生物醫(yī)學(xué)信息。信息檢索技術(shù)和信息抽取技術(shù)在生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的應(yīng)用,極大地促進了傳統(tǒng)生物醫(yī)學(xué)文獻查詢方式的變革。信息檢索技術(shù)的應(yīng)用為生物醫(yī)學(xué)文獻的搜索提供了便利,例如在線生物醫(yī)學(xué)資源庫PubMed,可以根據(jù)輸入的查詢語句檢索到相關(guān)主題的文獻返回給用戶。然而,信息檢索技術(shù)需要給出適當(dāng)?shù)牟樵冊~,并且查詢后返回的文獻依然很多。信息抽取技術(shù)在一定程度上解決了文獻閱讀數(shù)量巨大的問題,對特定主題進行信息提取,給用戶提供文獻的文本摘要。本文基于語義網(wǎng)絡(luò),利用信息抽取技術(shù)對生物醫(yī)學(xué)文獻進行知識提取,并以網(wǎng)絡(luò)圖的形式將特定主題提取得到的語義知識網(wǎng)絡(luò)呈現(xiàn)出來。本文基于顯著信息提取算法,從疾病相關(guān)的語義網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)集中抽取與疾病相關(guān)的基因、藥物以及基因和藥物之間的關(guān)系。顯著信息提取算法得到疾病相關(guān)的單層語義網(wǎng)絡(luò)提取結(jié)果,并實現(xiàn)了疾病知識提取可視化系統(tǒng)。本文在顯著信息提取算法啟發(fā)下提出了一種基于鏈接分析的深層知識提取方法。實驗應(yīng)用一種新的顯著信息提取算法KM,對特定疾病的基因數(shù)據(jù)集中的語義類型和關(guān)系謂詞進行提取,得到與主題直接相關(guān)的基因。顯著信息提取算法得到的疾病和基因的提取結(jié)果作為第一層關(guān)系,利用深度搜索得到疾病與基因之間的深層關(guān)系,并通過隨機游走RRW的轉(zhuǎn)移概率矩陣對深層關(guān)系網(wǎng)絡(luò)進行過濾,最終得到疾病知識網(wǎng)絡(luò)可視化呈現(xiàn)�；阪溄臃治龅纳顚又R提取方法在三種疾病數(shù)據(jù)上進行了推廣和應(yīng)用。實驗結(jié)果表明,該方法在疾病知識提取方面具有一定的有效性和普適性。生物醫(yī)學(xué)語義網(wǎng)絡(luò)知識提取,能夠有效地提煉跟特定生物醫(yī)學(xué)主題相關(guān)的重要信息。本文的實驗方法對比Combo生物醫(yī)學(xué)信息提取算法有一定提高,并在多個疾病語料集上進行了驗證,能夠有效地提高生物醫(yī)學(xué)知識的獲取效率。
【關(guān)鍵詞】：信息抽取 語義網(wǎng)絡(luò) 顯著信息提取算法 深度搜索 隨機游走RRW
【學(xué)位授予單位】：大連理工大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2015
【分類號】：R319;TP391.1
【目錄】：

• 摘要4-5
• Abstract5-8
• 1 緒論8-12
• 1.1 研究背景8-9
• 1.2 研究現(xiàn)狀9-11
• 1.2.1 信息檢索和機器學(xué)習(xí)在生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域的應(yīng)用9-10
• 1.2.2 圖理論在生物醫(yī)學(xué)實體關(guān)系中的應(yīng)用10-11
• 1.3 本文主要工作和章節(jié)安排11-12
• 2 相關(guān)資源與技術(shù)12-18
• 2.1 生物醫(yī)學(xué)文獻及工具12-15
• 2.1.1 UMLS12-14
• 2.1.2 SemRep14-15
• 2.2 鏈接分析算法15-16
• 2.3 可視化工具16-17
• 2.3.1 JUNG16-17
• 2.3.2 Gephi17
• 2.4 小結(jié)17-18
• 3 基于語義關(guān)系的疾病、基因和藥物提取系統(tǒng)18-27
• 3.1 系統(tǒng)流程18-19
• 3.2 實驗數(shù)據(jù)19
• 3.3 顯著信息提取算法19-21
• 3.3.1 KLD19-20
• 3.3.2 RlogF20
• 3.3.3 顯著信息提取算法20-21
• 3.4 實驗結(jié)果分析21-24
• 3.4.1 膀胱癌相關(guān)的基因21-22
• 3.4.2 膀胱癌相關(guān)的藥物22-24
• 3.4.3 基因與藥物之間的關(guān)系24
• 3.5 疾病知識提取可視化系統(tǒng)24-26
• 3.6 小結(jié)26-27
• 4 基于鏈接分析的疾病知識深層提取27-50
• 4.1 系統(tǒng)流程27-28
• 4.2 膀胱癌數(shù)據(jù)集選取28
• 4.3 一種新的顯著信息提取算法28-29
• 4.3.1 互信息28-29
• 4.3.2 KM算法29
• 4.4 基于鏈接分析的深層關(guān)系提取29-33
• 4.4.1 深層關(guān)系提取29-30
• 4.4.2 Repeated Random Walk30-33
• 4.5 實驗結(jié)果分析33-41
• 4.5.1 膀胱癌實驗結(jié)果評估33-36
• 4.5.2 膀胱癌實驗結(jié)果分析36-41
• 4.6 疾病知識提取方法的應(yīng)用和推廣41-49
• 4.6.1 相關(guān)疾病數(shù)據(jù)集選取41-42
• 4.6.2 老年癡呆癥實驗結(jié)果分析42-44
• 4.6.3 艾滋病實驗結(jié)果分析44-47
• 4.6.4 帕金森病實驗結(jié)果分析47-49
• 4.7 小結(jié)49-50
• 結(jié)論50-51
• 參考文獻51-55
• 攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表學(xué)術(shù)論文情況55-56
• 致謝56-57

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1 顏偉;王潔;尚英;宋柔;;《中國大百科全書》人物傳記知識提取加工規(guī)范[A];語言計算與基于內(nèi)容的文本處理——全國第七屆計算語言學(xué)聯(lián)合學(xué)術(shù)會議論文集[C];2003年

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1 吳曉芳;基于語義關(guān)系和鏈接分析的疾病知識提取研究[D];大連理工大學(xué);2015年

2 朱琳玲;基于擴展概念格的多數(shù)據(jù)庫知識提取研究[D];合肥工業(yè)大學(xué);2003年

  本文關(guān)鍵詞：基于語義關(guān)系和鏈接分析的疾病知識提取研究，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

本文編號：364542