小分子化合物Vc和RG108組合對(duì)山羊iPSC-like細(xì)胞多能性維持的研究
發(fā)布時(shí)間:2021-11-10 02:42
本研究利用山羊誘導(dǎo)多能干細(xì)胞(giPSCs-like)為實(shí)驗(yàn)材料,篩選能夠促進(jìn)giPSCs多能性狀態(tài)維持的小分子化合物,從而優(yōu)化培養(yǎng)體系。再對(duì)優(yōu)化后的培養(yǎng)體系下獲得的giPSCs進(jìn)行一系列生物學(xué)特性檢測(cè),同時(shí)結(jié)合RNA-seq技術(shù)和生物信息學(xué)分析,探究其促進(jìn)多能性維持的相關(guān)分子機(jī)制。1.促進(jìn)山羊iPSC-like細(xì)胞多能性的培養(yǎng)條件篩選(1)通過(guò)比對(duì)添加單個(gè)作用于表觀遺傳的小分子藥物對(duì)giPSC-like細(xì)胞的影響,以克隆形態(tài),堿性磷酸酶活性以及相關(guān)基因的表達(dá)量作為鑒定指標(biāo),結(jié)果發(fā)現(xiàn):Vc組與RG108組可以明顯促進(jìn)克隆的生長(zhǎng)速度與維持克隆形態(tài),克隆更加透亮,堿性磷酸酶(AP)活性增強(qiáng)。同時(shí)添加Vc組顯著提高了組蛋白去甲基化酶KDM2B和DNA去甲基化酶TET1,TET3的表達(dá)。添加RG108組降低了 DNA甲基轉(zhuǎn)移酶抑制劑(DNMT1)的表達(dá)。(2)進(jìn)一步篩選小分子組合,結(jié)果發(fā)現(xiàn):Vc與RG108(即VR)組合使用時(shí),AP活性更強(qiáng),同時(shí)顯著上調(diào)TET1,TET3和顯著下調(diào)DNMT1的表達(dá)。另外多能性基因OCT4,SOX2,NANOG的表達(dá)量也顯著提高,促進(jìn)多能性的維持。(3)篩選基礎(chǔ)...
【文章來(lái)源】:廣西大學(xué)廣西壯族自治區(qū) 211工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:89 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖1-2:撤DOX時(shí)giPSC-26傳代后克隆形態(tài)變化
驗(yàn)單獨(dú)添加5個(gè)小分子化合物,濃度設(shè)為文獻(xiàn)報(bào)道工作濃度和2倍的工作濃度,??觀察對(duì)克隆形態(tài),堿性磷酸酶活性以及熒光定量PCR結(jié)果的影響,發(fā)現(xiàn):Vc組??與RG108組可以明顯促進(jìn)克隆的生長(zhǎng)速度與維持克隆形態(tài)(圖1-4),由圖1-5??能看出b,C兩組AP著色最深,活性強(qiáng),染色結(jié)果優(yōu)于Control組,與形態(tài)觀察??結(jié)果一致,因此確定篩選小分子為Vc(50?pM),RG108?(8?mM)。但是添加Vc提??高了組蛋白去甲基化酶KDM2B和DNA去甲基化酶TET1,TET3的表達(dá),OCT4??表達(dá)量顯著提高,NANOG表達(dá)量提高不顯著;添加RG108組降低了?DNA甲基??26??
細(xì)胞系多能性後持的研究??轉(zhuǎn)移酶抑制劑(DNMT1)的表達(dá),0CT4表達(dá)量提高不顯著,但是NANOG表??達(dá)量得到顯著提高(如圖1-6)。其中RG108組工作濃度為8?pM,效果優(yōu)于文獻(xiàn)??報(bào)道的4?|iM,?Vc設(shè)為文獻(xiàn)報(bào)道工作濃度(即50?pM)效果較好。??b?艮?e?E??MB??心t…??閣1-4:作用表觀遺傳的小分子篩選時(shí),克隆形態(tài)圖(10x)。Control為GIPS培養(yǎng)下的克??隆形態(tài),其他圖均是在GIPS基礎(chǔ)上添加單個(gè)小分子的培養(yǎng)基體系下的克隆形態(tài)。a:添加??VPA?(0.5mM),?A:添加?VPA(1?mM>。b:添加?Vc(50(iM),?B:添加?Vc(10〇hM)??c:添加??RG108(4pM),C:添力口?RG108(8|iM)。?d:添力口?3’Dznep(0.1jaM).D:添力口?3,Dznep(0.2??HM)〇?e:添加5-aza(0.5?pM),?E:添加5-aza(l?pM)。由圖能看出圖b,?B,?C克隆形態(tài)最??好,但是B組增殖過(guò)快,易分化,所以先排除。標(biāo)尺=100?pm。??Figure?1-4:?Morphology?of?clones?when?screening?for?small?molecules?that?are?epigenetic.?Control??is?a?cloned?form?under?GIPS?culture
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]整合素和E-鈣黏素在誘導(dǎo)多能干細(xì)胞重編程及干性維持中的作用[J]. 胡若文,陳曉芳. 中國(guó)組織工程研究. 2018(29)
[2]Hippo/YAP信號(hào)通路與細(xì)胞增殖相關(guān)信號(hào)通路交叉作用的研究進(jìn)展[J]. 王琪,陳希彥,文勇. 國(guó)際口腔醫(yī)學(xué)雜志. 2017(05)
[3]調(diào)控人類多能干細(xì)胞命運(yùn)決定信號(hào)通路研究新進(jìn)展[J]. 趙瀚知,金穎. 生命的化學(xué). 2016(06)
[4]誘導(dǎo)重編程過(guò)程中的表觀遺傳重塑[J]. 陳珺,高亞威,陳嘉瑜,高紹榮. 生物化學(xué)與生物物理進(jìn)展. 2015(11)
[5]轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)在水產(chǎn)動(dòng)物研究中的運(yùn)用[J]. 羅輝,葉華,肖世俊,鄭曙明,王曉清,王志勇. 水產(chǎn)學(xué)報(bào). 2015(04)
[6]維生素C與表觀遺傳調(diào)控[J]. 郭琳,陳捷凱,裴端卿. 科學(xué)通報(bào). 2014(Z2)
[7]轉(zhuǎn)錄組與RNA-Seq技術(shù)[J]. 張春蘭,秦孜娟,王桂芝,紀(jì)志賓,王建民. 生物技術(shù)通報(bào). 2012(12)
[8]轉(zhuǎn)錄組研究新技術(shù):RNA-Seq及其應(yīng)用[J]. 祁云霞,劉永斌,榮威恒. 遺傳. 2011(11)
[9]Wnt家族基因敲除小鼠胚胎發(fā)育異常的研究現(xiàn)狀[J]. 李珊珊,肖晶. 大連醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào). 2008(06)
碩士論文
[1]Wnt3a蛋白對(duì)小鼠胚胎干細(xì)胞多能性維持以及誘導(dǎo)多能干細(xì)胞重編程效率的影響[D]. 李少杰.內(nèi)蒙古大學(xué) 2016
[2]小分子化合物誘導(dǎo)小鼠多能干細(xì)胞(CiPSCs)的研究[D]. 張俊.廣西大學(xué) 2016
[3]利用特定轉(zhuǎn)錄因子的mRNA誘導(dǎo)獲得山羊iPS細(xì)胞的研究[D]. 邱峰龍.揚(yáng)州大學(xué) 2014
[4]RG108對(duì)水牛成纖維細(xì)胞甲基化水平及其核移植胚胎發(fā)育的影響[D]. 蒙麗娜.廣西大學(xué) 2012
[5]小分子化合物在誘導(dǎo)山羊iPS細(xì)胞中的作用[D]. 孟書燕.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2011
本文編號(hào):3486409
【文章來(lái)源】:廣西大學(xué)廣西壯族自治區(qū) 211工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:89 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖1-2:撤DOX時(shí)giPSC-26傳代后克隆形態(tài)變化
驗(yàn)單獨(dú)添加5個(gè)小分子化合物,濃度設(shè)為文獻(xiàn)報(bào)道工作濃度和2倍的工作濃度,??觀察對(duì)克隆形態(tài),堿性磷酸酶活性以及熒光定量PCR結(jié)果的影響,發(fā)現(xiàn):Vc組??與RG108組可以明顯促進(jìn)克隆的生長(zhǎng)速度與維持克隆形態(tài)(圖1-4),由圖1-5??能看出b,C兩組AP著色最深,活性強(qiáng),染色結(jié)果優(yōu)于Control組,與形態(tài)觀察??結(jié)果一致,因此確定篩選小分子為Vc(50?pM),RG108?(8?mM)。但是添加Vc提??高了組蛋白去甲基化酶KDM2B和DNA去甲基化酶TET1,TET3的表達(dá),OCT4??表達(dá)量顯著提高,NANOG表達(dá)量提高不顯著;添加RG108組降低了?DNA甲基??26??
細(xì)胞系多能性後持的研究??轉(zhuǎn)移酶抑制劑(DNMT1)的表達(dá),0CT4表達(dá)量提高不顯著,但是NANOG表??達(dá)量得到顯著提高(如圖1-6)。其中RG108組工作濃度為8?pM,效果優(yōu)于文獻(xiàn)??報(bào)道的4?|iM,?Vc設(shè)為文獻(xiàn)報(bào)道工作濃度(即50?pM)效果較好。??b?艮?e?E??MB??心t…??閣1-4:作用表觀遺傳的小分子篩選時(shí),克隆形態(tài)圖(10x)。Control為GIPS培養(yǎng)下的克??隆形態(tài),其他圖均是在GIPS基礎(chǔ)上添加單個(gè)小分子的培養(yǎng)基體系下的克隆形態(tài)。a:添加??VPA?(0.5mM),?A:添加?VPA(1?mM>。b:添加?Vc(50(iM),?B:添加?Vc(10〇hM)??c:添加??RG108(4pM),C:添力口?RG108(8|iM)。?d:添力口?3’Dznep(0.1jaM).D:添力口?3,Dznep(0.2??HM)〇?e:添加5-aza(0.5?pM),?E:添加5-aza(l?pM)。由圖能看出圖b,?B,?C克隆形態(tài)最??好,但是B組增殖過(guò)快,易分化,所以先排除。標(biāo)尺=100?pm。??Figure?1-4:?Morphology?of?clones?when?screening?for?small?molecules?that?are?epigenetic.?Control??is?a?cloned?form?under?GIPS?culture
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]整合素和E-鈣黏素在誘導(dǎo)多能干細(xì)胞重編程及干性維持中的作用[J]. 胡若文,陳曉芳. 中國(guó)組織工程研究. 2018(29)
[2]Hippo/YAP信號(hào)通路與細(xì)胞增殖相關(guān)信號(hào)通路交叉作用的研究進(jìn)展[J]. 王琪,陳希彥,文勇. 國(guó)際口腔醫(yī)學(xué)雜志. 2017(05)
[3]調(diào)控人類多能干細(xì)胞命運(yùn)決定信號(hào)通路研究新進(jìn)展[J]. 趙瀚知,金穎. 生命的化學(xué). 2016(06)
[4]誘導(dǎo)重編程過(guò)程中的表觀遺傳重塑[J]. 陳珺,高亞威,陳嘉瑜,高紹榮. 生物化學(xué)與生物物理進(jìn)展. 2015(11)
[5]轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)在水產(chǎn)動(dòng)物研究中的運(yùn)用[J]. 羅輝,葉華,肖世俊,鄭曙明,王曉清,王志勇. 水產(chǎn)學(xué)報(bào). 2015(04)
[6]維生素C與表觀遺傳調(diào)控[J]. 郭琳,陳捷凱,裴端卿. 科學(xué)通報(bào). 2014(Z2)
[7]轉(zhuǎn)錄組與RNA-Seq技術(shù)[J]. 張春蘭,秦孜娟,王桂芝,紀(jì)志賓,王建民. 生物技術(shù)通報(bào). 2012(12)
[8]轉(zhuǎn)錄組研究新技術(shù):RNA-Seq及其應(yīng)用[J]. 祁云霞,劉永斌,榮威恒. 遺傳. 2011(11)
[9]Wnt家族基因敲除小鼠胚胎發(fā)育異常的研究現(xiàn)狀[J]. 李珊珊,肖晶. 大連醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào). 2008(06)
碩士論文
[1]Wnt3a蛋白對(duì)小鼠胚胎干細(xì)胞多能性維持以及誘導(dǎo)多能干細(xì)胞重編程效率的影響[D]. 李少杰.內(nèi)蒙古大學(xué) 2016
[2]小分子化合物誘導(dǎo)小鼠多能干細(xì)胞(CiPSCs)的研究[D]. 張俊.廣西大學(xué) 2016
[3]利用特定轉(zhuǎn)錄因子的mRNA誘導(dǎo)獲得山羊iPS細(xì)胞的研究[D]. 邱峰龍.揚(yáng)州大學(xué) 2014
[4]RG108對(duì)水牛成纖維細(xì)胞甲基化水平及其核移植胚胎發(fā)育的影響[D]. 蒙麗娜.廣西大學(xué) 2012
[5]小分子化合物在誘導(dǎo)山羊iPS細(xì)胞中的作用[D]. 孟書燕.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2011
本文編號(hào):3486409
本文鏈接:http://sikaile.net/yixuelunwen/swyx/3486409.html
最近更新
教材專著