軌道可再生的三維DNA步行器構(gòu)建及其在分析檢測(cè)中的應(yīng)用
發(fā)布時(shí)間:2021-10-27 14:36
DNA步行器是一種利用DNA分子作為構(gòu)筑元件設(shè)計(jì)制備的DNA納米機(jī)器,它可以在精心設(shè)計(jì)的一維軌道、二維軌道或者三維軌道進(jìn)行可控的機(jī)械運(yùn)動(dòng),執(zhí)行一系列復(fù)雜的操作。DNA步行器具有獨(dú)特的優(yōu)勢(shì),例如無(wú)需人工干預(yù)即可自主完成規(guī)定任務(wù)、結(jié)構(gòu)可靠性以及系統(tǒng)高度可控性。由于其出色的能力,DNA步行器在生物傳感、分子計(jì)算、貨物運(yùn)輸、程序化合成、邏輯門設(shè)計(jì)等方面中具有巨大的應(yīng)用潛力。特別是基于納米材料的三維DNA步行器,其高的局部軌道濃度提高了步行器的運(yùn)行效率,有利于信號(hào)的快速釋放。提高DNA步行器的運(yùn)行持續(xù)性,增加其運(yùn)行步數(shù)有利于累積更多的信號(hào),從而增強(qiáng)DNA步行器作為生物傳感器的性能,提高其檢測(cè)靈敏度;谝陨戏治,設(shè)計(jì)了具有增強(qiáng)的持續(xù)運(yùn)行能力的新型DNA步行器,并在此基礎(chǔ)上構(gòu)建了基于DNA步行器的熒光傳感器用于疾病相關(guān)的生物標(biāo)志物的靈敏檢測(cè)。本文共分為兩章:第一章為緒論,主要概述了不同驅(qū)動(dòng)設(shè)計(jì)的DNA步行器的構(gòu)建以及DNA步行器在分析檢測(cè)方面的應(yīng)用,并簡(jiǎn)要闡述了本論文中主要解決的科學(xué)問(wèn)題及研究?jī)?nèi)容。第二章構(gòu)建了一種軌道可再生的DNA步行器,并作為一種熒光傳感器用于伊波拉病毒的檢測(cè)。該DNA步行器由...
【文章來(lái)源】:山東大學(xué)山東省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:63 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖1.1光驅(qū)動(dòng)的DNA步行器的運(yùn)行原理I"1??1.1.2?pH驅(qū)動(dòng)的DNA步行器??以pH為驅(qū)動(dòng)力,通過(guò)質(zhì)子化/去質(zhì)子化的反復(fù)刺激實(shí)現(xiàn)DNA步行器的往復(fù)??
復(fù)該酶切反應(yīng)和??分支遷移進(jìn)而實(shí)現(xiàn)步行器在線性軌道上的連續(xù)行走。隨后,切口核酸內(nèi)切酶驅(qū)動(dòng)??的在二維平面勻速前進(jìn)的DNA步行器被構(gòu)建出來(lái),并通過(guò)原子力顯微鏡實(shí)時(shí)監(jiān)??測(cè)行進(jìn)步驟,清楚地展現(xiàn)出該步行器在機(jī)械運(yùn)動(dòng)方面的細(xì)節(jié)。??切口核酸內(nèi)切酶被用作大多數(shù)酶切反應(yīng)驅(qū)動(dòng)的DNA步行器的驅(qū)動(dòng)力,同樣??被應(yīng)用于三維DNA步行器的設(shè)計(jì)和構(gòu)建中。Li課題組設(shè)計(jì)了一種在DNA功能??化修飾的金納米顆粒(Goldnanoparticle,?AuNP)構(gòu)建的三維軌道上行走的DNA??步行器||51。如圖1.4所示,首先利用直徑為20?nm的AuNP密集地功能化上修飾??t〇na?j,’:丄?I〉??I?1?t?X令丄d??嚴(yán)?AuNP?AuNP??^Payload?i??Nicking?endonuclease?^??:>??-?AuNP? ̄?—J??????AuNPr-)??圖1.4?Nicking內(nèi)切酶驅(qū)動(dòng)的DNA步行器的運(yùn)行原理問(wèn)??有熒光基團(tuán)的DNA單鏈構(gòu)建了三維軌道,同時(shí)AuNP上功能化了位置固定的單??足步行鏈。步行鏈與軌道鏈結(jié)合成雙鏈后,含有切口核酸內(nèi)切酶切割位點(diǎn)的軌道??鏈在切n核酸內(nèi)切酶的作用下被切割成兩部分,使得雙鏈的穩(wěn)定性下降,從而雙??鏈解離,釋放出DNA步行鏈繼續(xù)沿著明確定義的三維軌道行走。同時(shí),負(fù)載于??軌道鏈上的貨物隨著步行鏈沿軌道的行走而被釋放。該DNA步行器將行走限制??4??
被切割產(chǎn)生兩段較短的序列片段,雙??鏈穩(wěn)定性下降,從而使得步行鏈從雙鏈上解離下來(lái)。解離下來(lái)的步行鏈繼續(xù)與下??一條軌道鏈雜交,在APE1的作用下開(kāi)啟周期性循環(huán),直至整個(gè)軌道被消耗。該??DNA步行器實(shí)現(xiàn)了內(nèi)源性酶提供驅(qū)動(dòng)力,最大程度地減少了外源性酶或其他能??改變細(xì)胞活力的物質(zhì)對(duì)細(xì)胞狀態(tài)的影響。??\屬?,?七9??^?AuNPs?Walking?strand?Track?strand???Uracil?〇?AP?site?Fluorescein?%?UDG?蠢?APE1??圖1.5?APEl驅(qū)動(dòng)的DNA步行器的運(yùn)行原理l|7】??與核酸內(nèi)切酶不N,核酸外切酶的作用原理是從核酸鏈的?端開(kāi)始,依次水??5??
本文編號(hào):3461805
【文章來(lái)源】:山東大學(xué)山東省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:63 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖1.1光驅(qū)動(dòng)的DNA步行器的運(yùn)行原理I"1??1.1.2?pH驅(qū)動(dòng)的DNA步行器??以pH為驅(qū)動(dòng)力,通過(guò)質(zhì)子化/去質(zhì)子化的反復(fù)刺激實(shí)現(xiàn)DNA步行器的往復(fù)??
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被切割產(chǎn)生兩段較短的序列片段,雙??鏈穩(wěn)定性下降,從而使得步行鏈從雙鏈上解離下來(lái)。解離下來(lái)的步行鏈繼續(xù)與下??一條軌道鏈雜交,在APE1的作用下開(kāi)啟周期性循環(huán),直至整個(gè)軌道被消耗。該??DNA步行器實(shí)現(xiàn)了內(nèi)源性酶提供驅(qū)動(dòng)力,最大程度地減少了外源性酶或其他能??改變細(xì)胞活力的物質(zhì)對(duì)細(xì)胞狀態(tài)的影響。??\屬?,?七9??^?AuNPs?Walking?strand?Track?strand???Uracil?〇?AP?site?Fluorescein?%?UDG?蠢?APE1??圖1.5?APEl驅(qū)動(dòng)的DNA步行器的運(yùn)行原理l|7】??與核酸內(nèi)切酶不N,核酸外切酶的作用原理是從核酸鏈的?端開(kāi)始,依次水??5??
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