本文關鍵詞：雌激素受體ERα的生物信息學分析及臨床意義，，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：雌激素受體(estrogen receptors, ER)屬于類固醇受體超家族中的一員,分為兩大類：經(jīng)典的核受體與膜性受體。雌激素受體(estrogen receptor a, ERa)作為依賴配體活化轉(zhuǎn)錄因子的核受體家族成員之一,其活化的經(jīng)典途徑是與雌激素結(jié)合后直接作用于靶基因上游的雌激素受體反應元件(ERE),從而誘導靶基因轉(zhuǎn)錄,參與靶細胞的增殖和分化。這類受體與多種疾病,包括乳腺癌、子宮內(nèi)膜癌、心血管疾病、骨質(zhì)疏松癥、阿爾茨海默氏病等疾病的發(fā)生、轉(zhuǎn)歸和預后密切相關。本論文利用生物信息學的方法,對研究序列ERα的篩選及下載,氨基酸序列理化性質(zhì)、結(jié)構(gòu)特征、功能及系統(tǒng)演化關系等進行了預測和分析；以期為今后開展雌激素受體的相關研究提供一定的理論依據(jù)。結(jié)果：不同物種的ERa的氨基酸序列具有很高的同源性；人ERα屬于親水蛋白；氨基酸序列中不存在信號肽；分子中不含有跨膜結(jié)構(gòu)域,含有磷酸酶位點,可能受蛋白激酶的磷酸化；α-螺旋是人ERα蛋白二級結(jié)構(gòu)的主要結(jié)構(gòu)元件。
【關鍵詞】：ERα 生物信息學分析 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)
【學位授予單位】：中南大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2013
【分類號】：Q811.4;R3416
【目錄】：

• 摘要4-5
• ABSTRACT5-6
• 目錄6-8
• 1 緒論8-13
• 1.1 研究背景8-11
• 1.1.1 雌激素受體α結(jié)構(gòu)與功能8-9
• 1.1.2 雌激素受體α與疾病9-10
• 1.1.3 雌激素受體α作用機制10-11
• 1.2 研究內(nèi)容與方法11-13
• 2 數(shù)據(jù)庫檢索13-23
• 2.1 人ERα基因的數(shù)據(jù)庫檢索13-14
• 2.2 人ERα MRNA序列的數(shù)據(jù)庫檢索14-20
• 2.3 人ERα蛋白氨基酸序列的數(shù)據(jù)庫檢索20-22
• 2.3.1 ERα在染色體上的位置20-21
• 2.3.2 ERα基因編碼區(qū)信息21-22
• 2.4 小結(jié)22-23
• 3 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)與功能23-67
• 3.1 蛋白質(zhì)一級結(jié)構(gòu)——氨基酸序列信息23
• 3.2 蛋白質(zhì)理化性質(zhì)分析23-28
• 3.2.1 使用ProtParam軟件分析的結(jié)果24-25
• 3.2.2 使用SAPS軟件分析的結(jié)果25-28
• 3.3 蛋白質(zhì)親疏水性分析28
• 3.4 蛋白質(zhì)跨膜結(jié)構(gòu)區(qū)分析28-37
• 3.4.1 使用TMHMM軟件分析跨膜結(jié)構(gòu)區(qū)結(jié)果29-30
• 3.4.2 使用SOSUI軟件分析跨膜結(jié)構(gòu)區(qū)結(jié)果30-31
• 3.4.3 使用HMMTOP軟件分析跨膜結(jié)構(gòu)區(qū)結(jié)果31-32
• 3.4.4 使用PredictProtein軟件分析跨膜結(jié)構(gòu)區(qū)結(jié)果32-33
• 3.4.5 使用DAS軟件分析跨膜結(jié)構(gòu)區(qū)結(jié)果33-34
• 3.4.6 使用TMAP軟件分析跨膜結(jié)構(gòu)區(qū)結(jié)果34-35
• 3.4.7 使用TopPred軟件分析跨膜結(jié)構(gòu)區(qū)結(jié)果35-37
• 3.5 蛋白質(zhì)信號肽分析37-38
• 3.5.1 使用SignalP 4.1軟件分析信號肽結(jié)果37-38
• 3.5.2 使用iPSORT Prediction軟件分析信號肽結(jié)果38
• 3.6 蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)預測38-45
• 3.6.1 使用PredictProtein軟件分析蛋白二級結(jié)構(gòu)結(jié)果39-42
• 3.6.2 使用PSIpred軟件分析蛋白二級結(jié)構(gòu)結(jié)果42-44
• 3.6.3 使用SOPMA軟件分析蛋白二級結(jié)構(gòu)結(jié)果44-45
• 3.7 蛋白質(zhì)三級結(jié)構(gòu)預測45-48
• 3.8 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域分析48-59
• 3.8.1 使用NCBI分析蛋白結(jié)構(gòu)域結(jié)果49-50
• 3.8.2 使用InterPro軟件分析蛋白結(jié)構(gòu)域結(jié)果50-51
• 3.8.3 使用InterProScan軟件分析蛋白結(jié)構(gòu)域結(jié)果51-52
• 3.8.4 使用HMMER軟件分析蛋白結(jié)構(gòu)域結(jié)果52-56
• 3.8.5 使用PDB軟件分析蛋白結(jié)構(gòu)域結(jié)果56-59
• 3.9 蛋白質(zhì)翻譯后修飾分析59-64
• 3.9.1 使用PredictProtein分析翻譯后修飾59-60
• 3.9.2 使用NetPhosK 2.0 Server分析翻譯后修飾60-64
• 3.10 蛋白質(zhì)亞細胞定位分析64-65
• 3.11 小結(jié)65-67
• 4 系統(tǒng)進化生物信息學分析67-69
• 4.1 系統(tǒng)進化分析67-68
• 4.2 小結(jié)68-69
• 5 基因表達譜生物信息學分析69-72
• 5.1 基因表達譜分析69-71
• 5.2 小結(jié)71-72
• 討論72-73
• 參考文獻73-77
• 致謝77

【參考文獻】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前1條

1 楊華,武成斌,屈秋民;雌激素與阿爾茨海默病[J];中國臨床康復;2004年01期

  本文關鍵詞：雌激素受體ERα的生物信息學分析及臨床意義，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

本文編號：314402