【摘要】：基因芯片以其高通量、微型化和自動化等優(yōu)點(diǎn)成為醫(yī)學(xué)基因診斷的重要工具,芯片探針的設(shè)計和篩選是制備高質(zhì)量基因芯片關(guān)鍵步驟之一。目前,已有不少探針設(shè)計軟件被開發(fā)出來,它們針對不同的設(shè)計對象,顯示出各自的優(yōu)勢和局限性。本文聚焦寡核苷酸探針篩選設(shè)計的三個基本標(biāo)準(zhǔn),即特異性、敏感性和熔點(diǎn)(Tm),介紹了探針設(shè)計軟件研究發(fā)展?fàn)顩r。結(jié)合文獻(xiàn)報道,對軟件的用途進(jìn)行分類說明。本綜述將有助于用戶快速選擇合適的軟件用于探針設(shè)計,對降低芯片制備成本、提高芯片應(yīng)用研究效率、促進(jìn)高性能的探針設(shè)計軟件研究及商品化具有重要的意義。
[Abstract]:Because of its high throughput, miniaturization and automation, gene microarray has become an important tool for medical gene diagnosis. The design and screening of microarray probes is one of the key steps in the preparation of high quality gene chips. At present, many probe design software have been developed, which show their respective advantages and limitations for different design objects. In this paper, we focus on three basic criteria for the screening and design of oligonucleotide probes, namely specificity, sensitivity and melting point (TM), and introduce the development of probe design software. Combined with the literature report, the use of the software is classified and explained. This review will help users to quickly select suitable software for probe design. It is of great significance to reduce the cost of chip preparation, improve the efficiency of chip application research and promote the research and commercialization of high performance probe design software.
【作者單位】： 中南大學(xué)地球科學(xué)與信息物理學(xué)院生物醫(yī)學(xué)工程系;
【基金】：國家自然科學(xué)基金資助項目(60801019,61371042) 中南大學(xué)中央高�；究蒲袠I(yè)務(wù)費(fèi)專項資金資助(2013zzts252)
【分類號】：R318.6

【共引文獻(xiàn)】

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3 嚴(yán)自創(chuàng);劉永晶;高斌;李菲菲;張瀟瀟;程新超;許艷;;基于CNV區(qū)域網(wǎng)絡(luò)識別神經(jīng)膠質(zhì)瘤的重要功能區(qū)域[J];現(xiàn)代生物醫(yī)學(xué)進(jìn)展;2013年33期

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7 韓寶龍;黃波;丁衛(wèi)霖;王英;王進(jìn);王艷玲;蘭博;徐化林;畢世飛;張吉文;;數(shù)字化定量診斷乳腺腫瘤細(xì)胞形態(tài)學(xué)及軟件制作的研究[A];第五屆全國生物醫(yī)學(xué)體視學(xué)學(xué)術(shù)會議、第八屆全軍軍事病理學(xué)學(xué)術(shù)會議、第四屆全軍定量病理學(xué)學(xué)術(shù)會議論文匯編[C];2002年

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9 本版稿件采寫 本報記者 尹婷婷 張惠 王雪娟 繆琴;爭創(chuàng)國家軟件出口基地 外引內(nèi)培打造外包龍頭[N];成都日報;2006年

10 本報記者　 雷中輝;紅旗中文貳千主動出售：RedOffice傍上互聯(lián)網(wǎng)[N];21世紀(jì)經(jīng)濟(jì)報道;2006年

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2 李春梅;散粒噪聲分析方法及軟件研究[D];西安電子科技大學(xué);2009年

3 成亮;光纖溫度傳感網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)管理分析方法及軟件研究[D];長春理工大學(xué);2013年

4 陳永生;基于組件技術(shù)的開放式控制器軟件研究[D];北京工業(yè)大學(xué);2002年

5 鄧恩宏;500kV變電站運(yùn)行狀態(tài)分析軟件研究[D];重慶大學(xué);2002年

6 楊曉燕;鋼管混凝土拱橋運(yùn)營狀況監(jiān)測與報警系統(tǒng)軟件研究[D];西南交通大學(xué);2005年

7 吳曉青;機(jī)載測量中的實時數(shù)據(jù)采集軟件研究[D];西北工業(yè)大學(xué);2003年

8 張建明;掃描隧道顯微鏡運(yùn)行及圖像重建軟件研究[D];重慶大學(xué);2003年

9 邢作常;車床數(shù)控交流伺服系統(tǒng)軟件研究[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2006年

10 陳旭;基于Nevis芯片的高清數(shù)字電視機(jī)頂盒的軟件研究[D];華東師范大學(xué);2008年

本文編號：2122880