基于稠密子圖挖掘的腦網(wǎng)絡分類研究及應用
本文選題:腦網(wǎng)絡分類 + 稠密子圖分割; 參考:《南京航空航天大學》2017年碩士論文
【摘要】:腦疾病不僅威脅到患者的生命,而且為社會帶來沉重的負擔,因此人們越來越關注腦疾病的研究。隨著神經(jīng)影像技術的快速發(fā)展,研究人員將神經(jīng)影像技術應用在腦疾病研究上,并且取得了極大的進展。研究人員通過從神經(jīng)影像中挖掘出腦功能連接網(wǎng)絡,然后應用機器學習和數(shù)據(jù)挖掘的方法從中挖掘特征,將其應用于腦網(wǎng)絡分類。本文的研究基于腦網(wǎng)絡研究腦疾病,主要工作如下:第一部分,我們提出了基于稠密子圖分割的腦網(wǎng)絡分類方法。此部分的工作主要利用稠密子圖來反映人類大腦中連接緊密的拓撲模式,具體而言,通過將腦網(wǎng)絡轉化為邊對偶圖,將轉化后的對偶圖分割為稠密度依次降低的稠密子圖,然后挑選出稠密度最大的若干稠密子圖,使用挑選出的稠密子圖重構原有的腦網(wǎng)絡。最后使用圖核度量重構后的腦網(wǎng)絡之間的相似性,構建圖核矩陣,使用SVM進行分類。實驗結果表明,提出的分類方法可以提升分類效果,并且可以挖掘出與腦疾病相關聯(lián)的區(qū)域。第二部分,我們在稠密子圖的基礎上結合頻繁子圖的概念,提出了基于頻繁稠密子圖的腦網(wǎng)絡分類方法。此部分的工作主要基于腦疾病患者和正常人之間的拓撲結構出現(xiàn)顯著性差異的事實,因此從患者數(shù)據(jù)集和正常人數(shù)據(jù)集中挖掘出的頻繁稠密子圖會存在顯著差異,可以用于腦網(wǎng)絡分類。具體而言:首先分別從患者和正常人數(shù)據(jù)集中挖掘出頻繁稠密子圖,然后計算每一個子圖的判別性,挑選出最具有判別性的稠密子圖并且構建指示矩陣作為特征矩陣,最后使用SVM分類。實驗結果表明,基于頻繁稠密子圖的分類方法不僅可以提高分類的精度,而且可以挖掘出與腦疾病相關的拓撲模式。
[Abstract]:Brain diseases not only threaten the lives of patients, but also bring a heavy burden to the society, so people pay more and more attention to the research of brain diseases. With the rapid development of neuroimaging technology, researchers applied neuroimaging technology to brain disease research, and made great progress. The researchers used neural images to extract brain functional connectivity networks and then used machine learning and data mining methods to extract features from them and apply them to the classification of brain networks. The main work of this paper is as follows: in the first part, we propose a classification method of brain network based on dense subgraph segmentation. In this part, dense subgraphs are mainly used to reflect the closely connected topological patterns in the human brain. In particular, by transforming the brain network into edge-pair bigraphs, the transformed digraphs are divided into dense subgraphs with decreasing density in turn. Then some dense subgraphs with the highest density are selected and the original brain network is reconstructed using the selected dense subgraphs. Finally, the similarity of the reconstructed brain network is measured by using the graph kernel, and the kernel matrix is constructed, and SVM is used to classify the reconstructed brain network. The experimental results show that the proposed classification method can improve the classification effect and can mine the regions associated with brain diseases. In the second part, combining the concept of frequent subgraph with dense subgraph, we propose a classification method of brain network based on frequent dense subgraph. This part of the work is mainly based on the fact that there are significant differences in topological structure between patients with brain disease and normal people, so there are significant differences between frequent dense subgraphs mined from patient data sets and normal person data sets. Can be used for brain network classification. Specifically, the frequent dense subgraphs are mined from the patient and normal data sets respectively, and then the discriminant properties of each subgraph are calculated, the dense subgraphs with the most discriminant characteristics are selected, and the indicator matrix is constructed as the characteristic matrix. Finally, SVM classification is used. The experimental results show that the classification method based on frequent dense subgraphs can not only improve the classification accuracy but also mine the topological patterns related to brain diseases.
【學位授予單位】:南京航空航天大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2017
【分類號】:R741.044;TP391.41
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,本文編號:2117065
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