本文關鍵詞：東南沿海地區(qū)漢坦病毒的遺傳進化分析

  更多相關文章： 漢坦病毒 序列分析 系統(tǒng)進化 地理聚集現(xiàn)象 特殊亞型

【摘要】：目的對浙江、福建省及上海市東南沿海地區(qū)漢坦病毒的基因進行比較。方法收集浙江、福建省及上海市漢坦病毒部分M基因序列,應用Mega4.0和DNAStar軟件包進行系統(tǒng)發(fā)生分析,以鄰位相連法(NJ)構建系統(tǒng)發(fā)生樹,分析東南沿海地區(qū)浙江、福建省及上海市漢坦病毒的基因差異,分析采用1000個多序列組。結果經(jīng)對浙江、福建省及上海市若干株漢坦病毒基因的序列比較與系統(tǒng)進化分析,浙江省分離的同型別毒株的基因序列同源性高于福建省與上海市的分離毒株,而浙江省同地區(qū)分離株的核苷酸同源性更高,地區(qū)接近的分離株系統(tǒng)進化分支的分布也大部分更靠近。漢灘型病毒(HTNV)福建株的ZH53和漢城型病毒(SEOV)浙江建德株Gou3和ZJ5與本研究同型別的其他株及國際標準株的核苷酸同源性較低,分別為82.7%~86.3%和84.0%~85.3%,而且分別在HTNV和SEOV發(fā)生群中構成一獨立分支。浙江省從田鼠中分離到SEOV,產(chǎn)生宿主"溢出"現(xiàn)象。結論浙江、福建省及上海市東南沿海地區(qū)漢坦病毒的基因差異和親緣遠近關系主要表現(xiàn)在地區(qū)性,顯示出高度的地理聚集現(xiàn)象,浙江省建德地區(qū)和福建省分別存在SEOV和HTNV的特殊亞型病毒。
【作者單位】： 浙江省疾病預防控制中心浙江省腎綜合征出血熱疫苗研究重點實驗室;南京醫(yī)科大學第一附屬醫(yī)院;溫州醫(yī)科大學;南京軍區(qū)軍事醫(yī)學研究所;
【關鍵詞】： 漢坦病毒 序列分析 系統(tǒng)進化 地理聚集現(xiàn)象 特殊亞型
【基金】：國家自然科學基金(81171609,81473036)~~
【分類號】：R373
【正文快照】： 腎綜合征出血熱(HFRS)是一種疫區(qū)分布廣、病 析,以鄰位相連法(NJ)構建系統(tǒng)發(fā)生樹,分析東南死率較高的自然疫源性疾病。最初為漢灘型 沿海地區(qū)與其他地區(qū)漢坦病毒的基因差異。(HTN),之后又出現(xiàn)漢城型(SE0)疫區(qū),目前HTN和SE0混合型大量存在[1]。我國東南沿海地區(qū)HFRS ^病例數(shù)較

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本文編號：793399