miR-196a2單核苷酸多態(tài)性與白癜風易感性的關(guān)聯(lián)及機制研究
發(fā)布時間:2017-04-11 08:04
本文關(guān)鍵詞:miR-196a2單核苷酸多態(tài)性與白癜風易感性的關(guān)聯(lián)及機制研究,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
【摘要】:白癜風是皮膚科常見的獲得性色素脫失性疾病,以皮損部位黑素細胞明顯減少或消失為特征。黑素細胞破壞或凋亡的機理迄今尚未完全闡明,白癜風的發(fā)病機制的研究多集中在自身免疫、神經(jīng)因子、氧化應(yīng)激、代謝毒素、遺傳等學說。越來越多的學者認為,白癜風的發(fā)生和進展是多因素多基因共同作用的,其中基因遺傳變異決定個體罹患白癜風的易感性。另外越來越多的研究顯示白癜風發(fā)病與氧化應(yīng)激密切相關(guān),白癜風患者皮損區(qū)出現(xiàn)過量H_2O_2的蓄積。 microRNA(miRNA)是約22個核苷酸長度的非編碼小分子RNA,從具有一個或多個發(fā)夾樣結(jié)構(gòu)的前體pre-miRNA加工而來。miRNA通過與靶信使RNA(mRNA)的3’非翻譯區(qū)(3’-UTR)結(jié)合對轉(zhuǎn)錄后水平發(fā)揮負調(diào)節(jié)作用,使mRNA翻譯抑制或降解,在機體的多種生理和病理過程中有重要作用。有研究顯示人類大約60%編碼蛋白基因受到miRNA的調(diào)控。 單核苷酸多態(tài)性(SNP)是人類基因中最常見的基因變異,可影響基因的表達、轉(zhuǎn)錄、翻譯、修飾,是疾病易感性和導(dǎo)致藥物反應(yīng)性個體和種族差異的重要原因之一。研究表明miRNA的SNP與多種人類疾病相關(guān),可以影響疾病的表型或發(fā)生發(fā)展,目前腫瘤性疾病如肺癌、乳腺癌、肝癌等研究較多,在一些非腫瘤性疾病如小兒先心病、煤工塵肺等中也有研究。明確位于miRNA的SNP是否與白癜風的易感性有關(guān)聯(lián),尋找到與白癜風發(fā)生發(fā)展可能相關(guān)的miRNA,初步探討其SNP對黑素細胞功能有無影響,可能對白癜風的發(fā)生機制及臨床治療提供新的理論依據(jù)。 方法: 通過公共miRBase數(shù)據(jù)庫和文獻查找所有miRNA,篩檢并確認pre-miRNA中MAF5%的SNP位點及在中國人群中的分布情況。應(yīng)用分子流行病學病例-對照的研究方法,PCR-RFLP的實驗方法,探討miRNA的SNP與白癜風易感性的關(guān)聯(lián)性。篩選出與白癜風易感性相關(guān)miRNA分子,并構(gòu)建不同基因型miRNA分子的真核表達質(zhì)粒,瞬時轉(zhuǎn)染黑素細胞PIG1,通過檢測黑素細胞活力、凋亡和超微結(jié)構(gòu)變化,觀察miRNA單核苷酸多態(tài)性對H_2O_2誘導(dǎo)氧化應(yīng)激下黑素細胞生物學的影響。之后對篩檢出的相關(guān)miRNA應(yīng)用生物學預(yù)測軟件進行靶基因的預(yù)測,并通過雙熒光素酶報告基因?qū)嶒烌炞CmiRNA和預(yù)測靶基因之間的關(guān)系。檢測轉(zhuǎn)染不同質(zhì)粒組黑素細胞中黑素合成量和酪氨酸酶活性,以及H_2O_2處理黑素細胞后各組ROS水平的變化,通過以上功能學實驗進一步驗證miRNA單核苷酸多態(tài)性對靶基因的調(diào)控以及黑素細胞損傷的影響。 結(jié)果: 1.從400個已知的人類pre-miRNA中確定了課題組研究的4個miRNA的SNP位點:miR-146a rs2910164,miR-149rs2292832,miR-196a2rs11614913,miR-499rs3746444,在819例白癜風病例組及817例對照組中鑒定出4個研究位點的基因型,通過統(tǒng)計學分析發(fā)現(xiàn),具有miR-196a2CC基因型的個體與TT和TC的聯(lián)合基因型相比白癜風的易感性降低。在其它3個miRNA鑒定的基因型分析結(jié)果中沒有顯示出類似的主效應(yīng)。.對miR-196a2rs11614913CC基因型與TT和TC聯(lián)合基因型進行了分層分析。觀察到白癜風易感性的降低主要表現(xiàn)在以下組別中:年齡大于20歲,女性,散發(fā)型白癜風,無白癜風家族史,不伴有其它自身免疫性疾病,病史超過1年的患者。 2.成功構(gòu)建了miR-196a2的表達質(zhì)粒pCDNA3.1-miR-196a2-T和pCDNA3.1-miR-196a2-C。H_2O_2誘導(dǎo)的氧化應(yīng)激下,CCK-8結(jié)果顯示轉(zhuǎn)染pCDNA3.1-miR-196a2-T和pCDNA3.1-miR-196a2-C表達質(zhì)粒組黑素細胞的活力無顯著性差異。流式細胞術(shù)結(jié)果顯示,轉(zhuǎn)染pCDNA3.1-miR-196a2-T和pCDNA3.1-miR-196a2-C表達質(zhì)粒組的黑素細胞早期凋亡率均有顯著降低(P0.05),并且pCDNA3.1-miR-196a2-C和pCDNA3.1-miR-196a2-T相比凋亡也顯著減少(P 0.05)。透射電鏡下觀察細胞超微結(jié)構(gòu)發(fā)現(xiàn),轉(zhuǎn)染對照組細胞顯示明顯的凋亡改變,轉(zhuǎn)染pCDNA3.1-miR-196a2-T表達質(zhì)粒組細胞有輕微的凋亡變化,而轉(zhuǎn)染pCDNA3.1-miR-196a2-C表達質(zhì)粒組無明顯的凋亡改變。 3.通過生物信息學軟件預(yù)測出可能與白癜風氧化應(yīng)激相關(guān)的miR-196a2靶基因TRP-1,將其作為miRNA-196a2SNP研究的靶基因。成功構(gòu)建了TRP-1的報告基因質(zhì)粒psiCHECK2-TRP-1。雙熒光素酶報告系統(tǒng)結(jié)果顯示,miR-196a2-T和miR-196a2-C均結(jié)合靶基因TRP-1,從而抑制熒光素酶的表達,并且miR-196a2-C比miR-196a2-T更加容易和靶基因相結(jié)合(P 0.05)。與轉(zhuǎn)染對照組pCDNA3.1質(zhì)粒黑素細胞相比,pCDNA3.1-miR-196a2-C質(zhì)粒組黑素合成量顯著降低(P0.01)。H_2O_2處理后與轉(zhuǎn)染對照組質(zhì)粒黑素細胞相比,轉(zhuǎn)染pCDNA3.1-miR-196a2-C表達質(zhì)粒組黑素細胞中ROS水平顯著降低(P 0.05)。 結(jié)論: 1.具有miR-196a2CC基因型的個體與TT和TC的聯(lián)合基因型相比白癜風的發(fā)病易感性降低,miR-196a2SNP rs11614913TC可能降低白癜風易感性。 2. H_2O_2誘導(dǎo)的氧化應(yīng)激下,,miR-196a2SNP rs11614913TC可減少黑素細胞的早期凋亡率,對黑素細胞凋亡具有保護作用。 3. TRP-1是miR-196a2的靶基因,并且miR-196a2-C比miR-196a2-T更加容易和它相結(jié)合。miR-196a2SNP rs11614913TC可能通過結(jié)合靶基因TRP-1而降低H_2O_2處理后的ROS水平,從而保護黑素細胞的損傷。
【關(guān)鍵詞】:白癜風 miRNA miR-196a2 單核苷酸多態(tài)性 TRP-1 氧化應(yīng)激
【學位授予單位】:第四軍醫(yī)大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2012
【分類號】:R758.41
【目錄】:
- 縮略語表7-9
- 中文摘要9-13
- Abstract13-18
- 前言18-19
- 文獻回顧19-28
- 1 白癜風概述19-24
- 2 microRNA(miRNA)概述24-28
- 實驗一 miR-146a,miR-149,miR-196a2,miR-499 單核苷酸多態(tài)性與白癜風的關(guān)聯(lián)性研究28-43
- 1 材料28-29
- 1.1 實驗儀器28
- 1.2 主要試劑28-29
- 2 方法29-34
- 2.1 研究人群及數(shù)據(jù)采集30
- 2.2 調(diào)查表的設(shè)計及條目定義30-31
- 2.3 血液樣本中基因組 DNA 制備及保存31-32
- 2.4 PCR-RFLP 測定基因型32-34
- 2.5 質(zhì)量控制及統(tǒng)計學分析方法34
- 3 結(jié)果34-40
- 3.1 研究對象的一般特征34-36
- 3.2 電泳結(jié)果和基因型判別36-37
- 3.3 miRNA 位點單核苷酸基因多態(tài)性與白癜風易感性的關(guān)系37-40
- 4 討論40-43
- 實驗二 miR-196a2 單核苷酸多態(tài)性對人黑素細胞損傷保護的細胞生物學研究43-53
- 1 材料43-44
- 1.1 主要儀器設(shè)備43
- 1.2 主要試劑43-44
- 1.3 細胞株44
- 2 方法44-48
- 2.1 miR-196a2 表達質(zhì)粒的構(gòu)建44-45
- 2.2 細胞培養(yǎng)45
- 2.3 細胞轉(zhuǎn)染45-46
- 2.4 黑素細胞活性檢測46
- 2.5 黑素細胞凋亡檢測46-47
- 2.6 透射電鏡觀察不同質(zhì)粒轉(zhuǎn)染組黑素細胞超微結(jié)構(gòu)變化47
- 2.7 統(tǒng)計方法47-48
- 3 結(jié)果48-50
- 3.1 miR-196a2 SNP rs11614913 T>C 對黑素細胞活力無顯著影響48
- 3.2 miR-196a2 SNP rs11614913 T>C 可降低黑素細胞早期凋亡率48-49
- 3.3 miR-196a2 SNP rs11614913 T>C 對黑素細胞超微結(jié)構(gòu)的影響49-50
- 4 討論50-53
- 實驗三 miR-196a2 單核苷酸多態(tài)性對人黑素細胞損傷保護機制的初步研究53-62
- 1 材料53
- 1.1 主要儀器設(shè)備53
- 1.2 主要試劑53
- 2 方法53-57
- 2.1 預(yù)測及構(gòu)建 TRP-13’UTR 報告質(zhì)粒53-54
- 2.2 細胞培養(yǎng)54-55
- 2.3 細胞轉(zhuǎn)染55
- 2.4 熒光素酶報告基因檢測55
- 2.5 轉(zhuǎn)染細胞的黑素合成含量測定55-56
- 2.6 轉(zhuǎn)染細胞的酪氨酸酶活性測定56
- 2.7 轉(zhuǎn)染細胞的 ROS 含量測定56-57
- 3 結(jié)果57-58
- 3.1 miR-196a2 SNP rs11614913 T>C 降低靶基因 TRP-1 的表達57
- 3.2 miR-196a2 SNP rs11614913 T>C 能降低黑素細胞的黑素合成量,而對酪氨酸酶活性沒有影響57-58
- 3.3 miR-196a2 SNP rs11614913 T>C 能降低H_2O_2誘導(dǎo)下黑素細胞中 ROS 水平58
- 4 討論58-62
- 小結(jié)62-64
- 參考文獻64-79
- 附錄79-82
- 個人簡歷和研究成果82-83
- 致謝83-84
【參考文獻】
中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前3條
1 崔嘉;孫守榮;苗魯旭;席冬梅;何奕多;毛華明;鄧衛(wèi)東;;TYRP1基因控制動物色素形成的研究進展[J];中國畜牧獸醫(yī);2009年09期
2 陳佳萍;胡志斌;田甜;周小毅;苗瑞芬;靳光付;馬紅霞;沈洪兵;;miR-196a2成熟區(qū)單核苷酸多態(tài)性對靶基因LSP1表達的影響[J];南京醫(yī)科大學學報(自然科學版);2009年06期
3 朱秀敏;;細胞凋亡的形態(tài)特征與分子機制研究進展[J];中國老年學雜志;2011年13期
中國博士學位論文全文數(shù)據(jù)庫 前1條
1 牛軍州;Foxp3在黑素瘤細胞中表達的鑒定及其功能的初步研究[D];第四軍醫(yī)大學;2009年
本文關(guān)鍵詞:miR-196a2單核苷酸多態(tài)性與白癜風易感性的關(guān)聯(lián)及機制研究,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
本文編號:298641
本文鏈接:http://sikaile.net/yixuelunwen/pifb/298641.html
最近更新
教材專著