發(fā)布時(shí)間：2023-10-02 06:12

　　目的:本研究通過高通量測(cè)序及生物信息學(xué)分析技術(shù),構(gòu)建2型糖尿病患者外周血mRNA、miRNA及l(fā)ncRNA的差異表達(dá)譜,并根據(jù)lncRNA-miRNA和miRNA-mRNA間的相關(guān)關(guān)系,構(gòu)建lncRNA-miRNA-mRNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò),定位網(wǎng)絡(luò)中的關(guān)鍵基因,明確上下游基因調(diào)控方式,為研究2型糖尿病的發(fā)生、診斷及治療提供轉(zhuǎn)錄及轉(zhuǎn)錄后水平的理論依據(jù)。方法:本研究納入于2017年8月至2018年6月就診于吉林大學(xué)第二醫(yī)院的3例新發(fā)的40-60歲男性2型糖尿病患者為病例組,3例年齡、性別匹配的健康體檢者為對(duì)照組,空腹采集靜脈血并收集臨床資料及相關(guān)檢查信息。測(cè)序采用Illumina Hiseq平臺(tái),使用PE150策略進(jìn)行測(cè)序。根據(jù)差異倍數(shù)和顯著水平篩選基因,其篩選條件為差異表達(dá)倍數(shù)>4并且P<0.05,并使用火山圖和熱圖展示差異基因的分布情況。根據(jù)lncRNA、miRNA和mRNA間的相關(guān)關(guān)系構(gòu)建lncRNA-miRNA-mRNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò),并使用Cytoscape3.7.0軟件對(duì)調(diào)控網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行可視化展示。對(duì)網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行分析后,獲得度中心性、接近中心性和中介中心性,以3個(gè)指標(biāo)均大于或等于總體的...

【文章頁數(shù)】：76 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
abstract
第1章 前言
    1.1 研究背景
    1.2 研究目的與意義
第2章 材料與方法
    2.1 研究對(duì)象
        2.1.1 病例組
        2.1.2 對(duì)照組
    2.2 試劑和儀器
        2.2.1 主要試劑
        2.2.2 主要儀器
    2.3 研究方法
        2.3.1 臨床信息收集
        2.3.2 血樣采集
        2.3.3 全血總RNA提取及質(zhì)量檢測(cè)
        2.3.4 lncRNA和 miRNA文庫構(gòu)建、質(zhì)量控制以及高通量測(cè)序
        2.3.5 原始測(cè)序數(shù)據(jù)質(zhì)量控制
        2.3.6 差異基因篩選
        2.3.7 lncRNA共表達(dá)m RNA
        2.3.8 GO和 KEGG富集分析
        2.3.9 調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建
        2.3.10 網(wǎng)絡(luò)關(guān)鍵節(jié)點(diǎn)分析
        2.3.11 蛋白互作網(wǎng)絡(luò)
    2.4 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析
第3章 結(jié)果
    3.1 樣本基本信息
    3.2 數(shù)據(jù)產(chǎn)出質(zhì)量情況
    3.3 3種RNA差異表達(dá)情況
    3.4 lncRNA共表達(dá)基因的GO和 KEGG富集分析
    3.5 lncRNA-miRNA-mRNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)
    3.6 lncRNA-miRNA-mRNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)關(guān)鍵節(jié)點(diǎn)分析
    3.7 調(diào)控網(wǎng)絡(luò)中基因的蛋白互作網(wǎng)絡(luò)
第4章 討論
    4.1 RNA差異表達(dá)譜
    4.2 lncRNA-miRNA-mRNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)
        4.2.1 lnc RNA-miRNA-mRNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)中mRNA的功能富集分析
    4.3 調(diào)控網(wǎng)絡(luò)中的關(guān)鍵基因
    4.4 蛋白互作網(wǎng)絡(luò)
第5章 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
作者簡(jiǎn)介及在學(xué)期間所取得的研究成果
致謝



本文編號(hào)：3850254