發(fā)布時間：2023-09-14 01:58

　　目的:利用已發(fā)表的基因表達綜合數(shù)據(jù)庫查找系統(tǒng)性紅斑狼瘡(Systemic Lupus Erythematosus,SLE)相關(guān)的基因表達標記,下載基因芯片表達數(shù)據(jù)并進行meta分析,尋找SLE基因表達標記特征的交集,分析并總結(jié)出SLE關(guān)鍵基因表達標記組群,并進行驗證。從而為確定SLE的關(guān)鍵基因以及疾病預(yù)防、早期診斷和藥物靶點治療等提供參考與理論依據(jù)。方法:從NCBI(National Center for Biotechnology Information)GEO(Gene Expression Omnibus)數(shù)據(jù)庫和PubMed數(shù)據(jù)庫下載DNA微陣列基因表達標記數(shù)據(jù),找出15個與SLE表型相關(guān)的的DNA微陣列數(shù)據(jù)集,然后將它們分成訓(xùn)練數(shù)據(jù)集(13個數(shù)據(jù)集)和驗證數(shù)據(jù)集(2個數(shù)據(jù)集),分別包括1,869和1,171個樣本(見S1表)。使用EXALT(Expression Analysis Tool)軟件行meta分析,我們從訓(xùn)練數(shù)據(jù)組的13個數(shù)據(jù)集中提取關(guān)鍵基因表達標記組群,然后用驗證數(shù)據(jù)組中2個數(shù)據(jù)集的樣本對所分析出來的關(guān)鍵基因表達標記組群進行回顧性和前瞻性驗證。將驗證數(shù)據(jù)集中的S...

【文章頁數(shù)】：66 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
第1章 前言
第2章 對象與方法
    2.1 公開可用的數(shù)據(jù)集
    2.2 定義Meta分析數(shù)據(jù)集
    2.3 SLE特征基因集合的前瞻性預(yù)測
    2.4 統(tǒng)計學(xué)處理
第3章 結(jié)果
    3.1 鑒定人類 SLE metaSig100
    3.2 SLE特征基因的信號通路分析
    3.3 通過SLEmetaSig100對SLE患者進行分層
    3.4 使用SLEmetaSig100 對患者進行個體化SLE預(yù)測
第4章 討論
第5章 結(jié)論
參考文獻
綜述
    參考文獻
中英文對照縮略詞表
作者攻讀學(xué)位期間的科研成果
致謝



本文編號：3846330