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破骨細(xì)胞相關(guān)基因生物信息學(xué)分析及NFκB抑制劑JSH-23對破骨細(xì)胞作用研究

發(fā)布時(shí)間:2022-09-29 18:42
  研究背景和目的:骨質(zhì)疏松癥在老年人和絕經(jīng)后婦女當(dāng)中很常見,其主要原因是骨吸收率大于骨形成率而造成骨密度下降,導(dǎo)致骨折易發(fā)生。破骨細(xì)胞是唯一具有骨吸收作用的細(xì)胞,通過抑制其形成或功能是治療骨質(zhì)疏松癥的有效方法。本課題通過利用基因芯片篩選破骨細(xì)胞不同時(shí)期的差異基因并運(yùn)用信息生物學(xué)進(jìn)行分析,進(jìn)而尋找可能基因蛋白靶點(diǎn),然后使用對應(yīng)抑制劑驗(yàn)證其對破骨細(xì)胞作用,從而為骨質(zhì)疏松治療提供新藥物選擇。方法:1.通過GEO數(shù)據(jù)庫下載包含有破骨細(xì)胞不同時(shí)期的兩組基因芯片數(shù)據(jù)。利用R語言Limma包篩選出破骨細(xì)胞形成和分化過程中的差異表達(dá)基因。運(yùn)用DAVID在線分析軟件對差異基因進(jìn)行基因本體功能注釋和KEEG通路分析。并通過STRING在線分析軟件構(gòu)建基因蛋白互作網(wǎng)絡(luò)。使用Cytoscape的MCODE插件最終選出核心分子模塊,確定核心基因。2.通過C57B/L6小鼠獲得骨髓巨噬細(xì)胞,用30 ng/mL M-CSF誘導(dǎo)其成破骨前體細(xì)胞。用不同劑量濃度NFκB抑制劑JSH-23對其進(jìn)行干預(yù),5天后通過MTS實(shí)驗(yàn)評估JSH-23對破骨前體細(xì)胞增殖影響。通過使用30ng/mL M-CSF、l00ng/mL RANK... 

【文章頁數(shù)】:83 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

破骨細(xì)胞相關(guān)基因生物信息學(xué)分析及NFκB抑制劑JSH-23對破骨細(xì)胞作用研究


GSE107296芯片掃描圖像(灰度)

破骨細(xì)胞相關(guān)基因生物信息學(xué)分析及NFκB抑制劑JSH-23對破骨細(xì)胞作用研究


GSE107296芯原始數(shù)據(jù)MA-plot分析

破骨細(xì)胞相關(guān)基因生物信息學(xué)分析及NFκB抑制劑JSH-23對破骨細(xì)胞作用研究


GSE57468原始數(shù)據(jù)箱狀圖分析

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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本文編號:3683111

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