先天性甲狀腺功能減低癥患者SLC5A5基因突變篩查和體外功能研究
發(fā)布時(shí)間:2021-08-09 05:44
先天性甲狀腺功能減低癥(Congenital hypothyroidism,CH),簡稱甲低或甲減,是嬰兒時(shí)期的一種較為常見的內(nèi)分泌疾病,嚴(yán)重者出現(xiàn)身體發(fā)育遲緩以及不可逆的精神發(fā)育障礙。SLC5A5(Solute carrier family 5 member 5)基因編碼的鈉碘同向轉(zhuǎn)運(yùn)體(Sodium Iodide Symporter,NIS)是與甲狀腺激素合成密切相關(guān)的質(zhì)膜糖蛋白,其中NIS介導(dǎo)I-主動(dòng)轉(zhuǎn)運(yùn)到甲狀腺濾泡細(xì)胞中是甲狀腺激素生物合成的第一步。SLC5A5基因突變可能會(huì)引起碘轉(zhuǎn)運(yùn)缺陷(Iodine transport deficiency,ITD),進(jìn)而導(dǎo)致甲低。本研究通過對(duì)227例甲狀腺功能減低癥患者的SLC5A5基因的所有外顯子和相鄰區(qū)域進(jìn)行高通量測(cè)序,篩選出突變病例,并對(duì)這幾例突變病例的突變位點(diǎn)進(jìn)行生物信息學(xué)分析。然后對(duì)發(fā)現(xiàn)的新發(fā)突變進(jìn)行功能驗(yàn)證,進(jìn)而分析其突變是否對(duì)蛋白表達(dá)及功能有影響。結(jié)果在四例患者中檢出突變,占患者總?cè)藬?shù)的1.7%;其中一例患者攜帶了復(fù)合雜合突變(c.173_174del CC,p.P58fs和c.1532G>A,p...
【文章來源】:西北大學(xué)陜西省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:81 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
NIS二級(jí)結(jié)構(gòu)模型
第二章先天性甲狀腺功能低下癥SLC5A5基因突變篩查9第二章先天性甲狀腺功能低下癥SLC5A5基因突變篩查2.1實(shí)驗(yàn)材料2.1.1研究對(duì)象此次研究納入227例來自西安和新疆地區(qū)的CH患者(西安135例,新疆92例;漢族177例,少數(shù)民族50例;男性115例,女性112例)。新生兒先天性甲低篩查方法是對(duì)出生后大于72h但小于7d的足月新生兒充分哺乳,足跟采血,專用濾紙片測(cè)TSH值。但由于此方法僅能檢測(cè)到原發(fā)性甲低和高TSH癥,不能檢出中樞性甲低等。介于技術(shù)及個(gè)體水平的差異,約5%的先天性甲低患者無法通過新生兒篩查檢出。因此若TSH≥20uIU/mL則初步確診為陽性患者并召回復(fù)查如圖3所示[53];若TSH水平正常但出現(xiàn)臨床疑似甲低者也應(yīng)立即召回并復(fù)查。復(fù)查時(shí),若TSH水平高而FT4水平低,被診斷為先天性甲低;若TSH水平高而FT4水平正常,被診斷為高TSH癥;若TSH水平正常或低,F(xiàn)T4水平低,被診斷為中樞性或繼發(fā)性甲低。此外,也可通過圖3所示的其它診斷手段進(jìn)行輔助檢測(cè)。圖3甲低診斷流程Figure3Diagnosisprocessofhypothyroidism
第二章先天性甲狀腺功能低下癥SLC5A5基因突變篩查19疑似致病位點(diǎn)進(jìn)行驗(yàn)證(圖4),其中c.1313C>A和c.1915C>T是反向測(cè)序結(jié)果。圖4SLC5A5新發(fā)突變sanger測(cè)序圖Figure4SangersequenceofSLC5A5newmutation2.6.3計(jì)算機(jī)軟件預(yù)測(cè)突變對(duì)蛋白功能的影響SLC5A5基因編碼的NIS蛋白有643個(gè)氨基酸,包含13個(gè)跨膜域、胞外域和胞內(nèi)域。五個(gè)突變的具體分布示意圖如1.2.1中圖1所示;CLCSequenceViewer6.5.2軟件對(duì)五個(gè)突變的序列保守性分析如圖5所示,其中conservation表示的是序列保守性;四個(gè)軟件對(duì)5個(gè)突變的功能進(jìn)行預(yù)測(cè),四個(gè)軟件預(yù)測(cè)結(jié)果均為有害(Damaged,D)或良性(Tolerated,T)則將該位點(diǎn)定性為有害(D)或良性(T),如表6所示。具體結(jié)果如下:p.P58fs位于第二個(gè)跨膜域,堿基變化發(fā)生在1號(hào)外顯子;高度保守;四個(gè)軟件預(yù)測(cè)蛋白功能時(shí),盡管只有MutationTaster預(yù)測(cè)結(jié)果為有害,其余三個(gè)預(yù)測(cè)軟件都無法對(duì)此類突變做出預(yù)測(cè),但該突變?cè)斐闪艘拼a突變,導(dǎo)致第190位氨基酸是終止密碼子,而該蛋白長度為643個(gè)氨基酸,因此極大損傷該蛋白的完整性,更無法定位到質(zhì)膜,判定為有害。p.G75A位于拓?fù)溆,堿基變異發(fā)生在1號(hào)外顯子;高度保守;四個(gè)軟件蛋白功能預(yù)測(cè)結(jié)果均顯示有害,因此判定為有害。p.P438Q位于拓?fù)溆,堿基變異發(fā)生于11
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]先天性甲狀腺功能減低癥的遺傳學(xué)研究進(jìn)展[J]. 宮麗霏,孔元原. 北京醫(yī)學(xué). 2018(09)
[2]新生兒遺傳代謝病篩查發(fā)展及診治規(guī)范[J]. 葉軍. 中國計(jì)劃生育和婦產(chǎn)科. 2016(01)
[3]中國山東地區(qū)先天性甲狀腺功能減低癥患者PAX8基因突變篩查研究[J]. 王學(xué)芹,劉相東,盧德國,李文杰,王梅,劉世國,閻勝利,葛銀林. 中國優(yōu)生與遺傳雜志. 2012(12)
[4]早期治療對(duì)先天性甲狀腺功能減低癥患兒智力及體格發(fā)育的影響[J]. 陸艷紅,劉曉瑛,宋媛. 中國當(dāng)代兒科雜志. 2012(06)
[5]暫時(shí)性甲狀腺功能減低伴甲狀腺腫大患兒DUOX2基因突變的研究[J]. 呂志萍,李桂花,李文杰,劉世國. 中華兒科雜志. 2011 (12)
[6]先天性甲狀腺功能減低癥診療共識(shí)[J]. 中華兒科雜志. 2011 (06)
[7]新生兒甲狀腺功能低下與人群碘缺乏的關(guān)系[J]. 沈健,馬錦裕,杜松如. 中華預(yù)防醫(yī)學(xué)雜志. 1997(01)
[8]中國新生兒先天性甲狀腺功能低下癥與苯丙酮尿癥篩查22年回顧[J]. 徐艷華,秦玉峰,趙正言. 中華兒科雜志. 2009 (01)
本文編號(hào):3331489
【文章來源】:西北大學(xué)陜西省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:81 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
NIS二級(jí)結(jié)構(gòu)模型
第二章先天性甲狀腺功能低下癥SLC5A5基因突變篩查9第二章先天性甲狀腺功能低下癥SLC5A5基因突變篩查2.1實(shí)驗(yàn)材料2.1.1研究對(duì)象此次研究納入227例來自西安和新疆地區(qū)的CH患者(西安135例,新疆92例;漢族177例,少數(shù)民族50例;男性115例,女性112例)。新生兒先天性甲低篩查方法是對(duì)出生后大于72h但小于7d的足月新生兒充分哺乳,足跟采血,專用濾紙片測(cè)TSH值。但由于此方法僅能檢測(cè)到原發(fā)性甲低和高TSH癥,不能檢出中樞性甲低等。介于技術(shù)及個(gè)體水平的差異,約5%的先天性甲低患者無法通過新生兒篩查檢出。因此若TSH≥20uIU/mL則初步確診為陽性患者并召回復(fù)查如圖3所示[53];若TSH水平正常但出現(xiàn)臨床疑似甲低者也應(yīng)立即召回并復(fù)查。復(fù)查時(shí),若TSH水平高而FT4水平低,被診斷為先天性甲低;若TSH水平高而FT4水平正常,被診斷為高TSH癥;若TSH水平正常或低,F(xiàn)T4水平低,被診斷為中樞性或繼發(fā)性甲低。此外,也可通過圖3所示的其它診斷手段進(jìn)行輔助檢測(cè)。圖3甲低診斷流程Figure3Diagnosisprocessofhypothyroidism
第二章先天性甲狀腺功能低下癥SLC5A5基因突變篩查19疑似致病位點(diǎn)進(jìn)行驗(yàn)證(圖4),其中c.1313C>A和c.1915C>T是反向測(cè)序結(jié)果。圖4SLC5A5新發(fā)突變sanger測(cè)序圖Figure4SangersequenceofSLC5A5newmutation2.6.3計(jì)算機(jī)軟件預(yù)測(cè)突變對(duì)蛋白功能的影響SLC5A5基因編碼的NIS蛋白有643個(gè)氨基酸,包含13個(gè)跨膜域、胞外域和胞內(nèi)域。五個(gè)突變的具體分布示意圖如1.2.1中圖1所示;CLCSequenceViewer6.5.2軟件對(duì)五個(gè)突變的序列保守性分析如圖5所示,其中conservation表示的是序列保守性;四個(gè)軟件對(duì)5個(gè)突變的功能進(jìn)行預(yù)測(cè),四個(gè)軟件預(yù)測(cè)結(jié)果均為有害(Damaged,D)或良性(Tolerated,T)則將該位點(diǎn)定性為有害(D)或良性(T),如表6所示。具體結(jié)果如下:p.P58fs位于第二個(gè)跨膜域,堿基變化發(fā)生在1號(hào)外顯子;高度保守;四個(gè)軟件預(yù)測(cè)蛋白功能時(shí),盡管只有MutationTaster預(yù)測(cè)結(jié)果為有害,其余三個(gè)預(yù)測(cè)軟件都無法對(duì)此類突變做出預(yù)測(cè),但該突變?cè)斐闪艘拼a突變,導(dǎo)致第190位氨基酸是終止密碼子,而該蛋白長度為643個(gè)氨基酸,因此極大損傷該蛋白的完整性,更無法定位到質(zhì)膜,判定為有害。p.G75A位于拓?fù)溆,堿基變異發(fā)生在1號(hào)外顯子;高度保守;四個(gè)軟件蛋白功能預(yù)測(cè)結(jié)果均顯示有害,因此判定為有害。p.P438Q位于拓?fù)溆,堿基變異發(fā)生于11
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]先天性甲狀腺功能減低癥的遺傳學(xué)研究進(jìn)展[J]. 宮麗霏,孔元原. 北京醫(yī)學(xué). 2018(09)
[2]新生兒遺傳代謝病篩查發(fā)展及診治規(guī)范[J]. 葉軍. 中國計(jì)劃生育和婦產(chǎn)科. 2016(01)
[3]中國山東地區(qū)先天性甲狀腺功能減低癥患者PAX8基因突變篩查研究[J]. 王學(xué)芹,劉相東,盧德國,李文杰,王梅,劉世國,閻勝利,葛銀林. 中國優(yōu)生與遺傳雜志. 2012(12)
[4]早期治療對(duì)先天性甲狀腺功能減低癥患兒智力及體格發(fā)育的影響[J]. 陸艷紅,劉曉瑛,宋媛. 中國當(dāng)代兒科雜志. 2012(06)
[5]暫時(shí)性甲狀腺功能減低伴甲狀腺腫大患兒DUOX2基因突變的研究[J]. 呂志萍,李桂花,李文杰,劉世國. 中華兒科雜志. 2011 (12)
[6]先天性甲狀腺功能減低癥診療共識(shí)[J]. 中華兒科雜志. 2011 (06)
[7]新生兒甲狀腺功能低下與人群碘缺乏的關(guān)系[J]. 沈健,馬錦裕,杜松如. 中華預(yù)防醫(yī)學(xué)雜志. 1997(01)
[8]中國新生兒先天性甲狀腺功能低下癥與苯丙酮尿癥篩查22年回顧[J]. 徐艷華,秦玉峰,趙正言. 中華兒科雜志. 2009 (01)
本文編號(hào):3331489
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