多囊卵巢綜合征患者血清特異性LncRNA表達譜研究
發(fā)布時間:2021-02-23 08:22
目的探討多囊卵巢綜合征(PCOS)患者血清特異性長鏈非編碼核糖核酸(LncRNA)表達譜及下游mRNA通路。方法建立PCOS患者(PCOS組,50例)和健康人群(對照組,50例)隊列,隨機選取各3例,采用單色微陣列基因表達分析流程進行表達譜檢測,并輔以熱圖分析、實時定量逆轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng)(qRT-PCR)驗證和下游mRNA的基因本體注釋(GO)富集分析。結(jié)果PCOS患者血清中分別有351、217種顯著上調(diào)和下調(diào)的LncRNA(符合變化系數(shù)≥2.0,P<0.05);進一步聚類分析發(fā)現(xiàn),包含顯著上調(diào)的11種LncRNA和顯著下調(diào)的8種LncRNA的數(shù)據(jù)集可以成功區(qū)分PCOS患者和健康人群。qRT-PCR成功驗證其中16種LncRNA具有相同顯著變化。GO富集分析發(fā)現(xiàn),這些LncRNA調(diào)控的mRNA功能范圍包括細(xì)胞活化/生長/周期、基因及表觀遺傳學(xué)負(fù)調(diào)控等方面。結(jié)論 PCOS患者血清特異性LncRNA表達譜可為疾病的非侵入性診斷提供分子生物學(xué)標(biāo)志物。
【文章來源】:浙江醫(yī)學(xué). 2020,42(08)
【文章頁數(shù)】:5 頁
【部分圖文】:
差異表達Lnc RNA所預(yù)測靶基因的GO富集分析(a:顯著上調(diào)Lnc RNA所預(yù)測的下游m RNA;b:顯著下調(diào)的Lnc RNA所預(yù)測的下游m RNA)
綜上所述,本研究系統(tǒng)闡述了PCOS患者血清特異性LncRNA表達譜,并對熱圖分析產(chǎn)生的差異LncRNA進行q RT-PCR驗證,進一步對預(yù)測的下游m RNA進行生物信息學(xué)分析,通過GO富集分析找到若干關(guān)鍵基因功能,為PCOS非侵入性診斷提供分子生物學(xué)標(biāo)志物。但本研究也存在一些不足:(1)PCOS患者血清LncRNA表達譜測定的樣本數(shù)偏少,雖經(jīng)qRT-PCR驗證,但仍可能會發(fā)生較大偏倚,無法充分反映目標(biāo)人群情況;(2)筆者預(yù)測了差異表達程度最高的20個LncRNA的下游mRNA,但仍需要進一步q RT-PCR驗證,同時擴大驗證進行預(yù)測下游m RNA的LncRNA范圍;(3)僅采用GO富集分析LncRNA下游mRNA的生物信息學(xué)功能,后續(xù)可針對其KEGG通路作進一步分析。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]膽固醇側(cè)鏈裂解酶CYP11A1基因多態(tài)性與多囊卵巢綜合征發(fā)病的相關(guān)性[J]. 高貴花,曹云霞,易龍,魏兆蓮,徐玉萍,楊馳. 中華婦產(chǎn)科雜志. 2010 (03)
[2]環(huán)境因素與多囊卵巢綜合征發(fā)病的相關(guān)性分析[J]. 黃衛(wèi)娟,劉嘉茵,李麗娜. 中華婦產(chǎn)科雜志. 2007(05)
本文編號:3047293
【文章來源】:浙江醫(yī)學(xué). 2020,42(08)
【文章頁數(shù)】:5 頁
【部分圖文】:
差異表達Lnc RNA所預(yù)測靶基因的GO富集分析(a:顯著上調(diào)Lnc RNA所預(yù)測的下游m RNA;b:顯著下調(diào)的Lnc RNA所預(yù)測的下游m RNA)
綜上所述,本研究系統(tǒng)闡述了PCOS患者血清特異性LncRNA表達譜,并對熱圖分析產(chǎn)生的差異LncRNA進行q RT-PCR驗證,進一步對預(yù)測的下游m RNA進行生物信息學(xué)分析,通過GO富集分析找到若干關(guān)鍵基因功能,為PCOS非侵入性診斷提供分子生物學(xué)標(biāo)志物。但本研究也存在一些不足:(1)PCOS患者血清LncRNA表達譜測定的樣本數(shù)偏少,雖經(jīng)qRT-PCR驗證,但仍可能會發(fā)生較大偏倚,無法充分反映目標(biāo)人群情況;(2)筆者預(yù)測了差異表達程度最高的20個LncRNA的下游mRNA,但仍需要進一步q RT-PCR驗證,同時擴大驗證進行預(yù)測下游m RNA的LncRNA范圍;(3)僅采用GO富集分析LncRNA下游mRNA的生物信息學(xué)功能,后續(xù)可針對其KEGG通路作進一步分析。
【參考文獻】:
期刊論文
[1]膽固醇側(cè)鏈裂解酶CYP11A1基因多態(tài)性與多囊卵巢綜合征發(fā)病的相關(guān)性[J]. 高貴花,曹云霞,易龍,魏兆蓮,徐玉萍,楊馳. 中華婦產(chǎn)科雜志. 2010 (03)
[2]環(huán)境因素與多囊卵巢綜合征發(fā)病的相關(guān)性分析[J]. 黃衛(wèi)娟,劉嘉茵,李麗娜. 中華婦產(chǎn)科雜志. 2007(05)
本文編號:3047293
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