目的利用單細胞測序、微量蛋白質(zhì)組學(xué)及免疫組化三部分數(shù)據(jù)深入分析腎臟尿酸轉(zhuǎn)運蛋白的細胞分布及表達豐度。方法利用2個成人健康腎臟的單細胞測序數(shù)據(jù)集（GSE131685）分析12個腎臟尿酸轉(zhuǎn)運基因的細胞定位及表達豐度,進一步利用激光微切割聯(lián)合質(zhì)譜檢測大鼠腎小管14個區(qū)段蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)集12個蛋白的定位和豐度,最后利用Protein Atlas數(shù)據(jù)庫檢索上述蛋白在腎臟中的免疫組化染色結(jié)果。結(jié)果單細胞測序數(shù)據(jù)集GSE131685中,12個尿酸轉(zhuǎn)運蛋白集中表達于近端小管細胞,而在KIT數(shù)據(jù)集中,除了ABCG2、SLC22A12和SLC22A13外,其余都集中表達于近端腎小管S1,S2和S3段細胞。KEAT蛋白數(shù)據(jù)集的分析結(jié)果與KIT數(shù)據(jù)結(jié)果類似:ABCG2,SLC17A3,SLC22A12,SLC22A6和SLC22A8在近端小管S1,S2和S3段有顯著的表達,尤其是SLC22A6僅富集在S2段腎小管,而ABCG2在S3段有較強的富集,其它的蛋白表達豐度相對較低。Protein Atlas的免疫組化數(shù)據(jù)顯示出與單細胞測序及蛋白質(zhì)組的結(jié)果有較大的差異:ABCC2、SLC17A4、SLC22A6、SLC2... 

【文章來源】：中華腎病研究電子雜志. 2020,9(04)

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【部分圖文】：

尿酸轉(zhuǎn)運蛋白在人腎臟單細胞測序數(shù)據(jù)(GSE131685)中的表達情況

健康人腎臟單細胞核測序數(shù)據(jù)(KIT)中尿酸轉(zhuǎn)運蛋白的表達

蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫的檢索結(jié)果縮小了核酸數(shù)據(jù)檢索的范圍，為更深入的了解這部分蛋白在人腎臟組織中的定位表達，我們再次檢索了Protein Atlas數(shù)據(jù)。結(jié)果表明(如圖4所示)，除了未檢索到SLC17A3的免疫組化結(jié)果，其它11個基因都有相應(yīng)的染色。其中ABCC2、SLC17A4,SLC22A6,SLC22A11、SLC22A12、SLC22A13及SLC2A9顯示在近端小管比較特異的表達定位，其中ABCC2,SLC22A6和SLC22A11,SLC22A13信號較強。ABCC4,ABCG2和SLC16A9的表達豐度相對較低，特異性較差。免疫組化的結(jié)果顯示出與單細胞測序及蛋白質(zhì)組的結(jié)果有較大的差異。討論

【參考文獻】：
期刊論文
[1]人尿酸轉(zhuǎn)運蛋白在腎小管上皮細胞的定位表達研究[J]. 洪權(quán),吳鏑,陳香美,侯剴,馮哲,傅博,許國雙,丁瑞.  中華腎臟病雜志. 2005(09)



本文編號：3039774