28個(gè)Joubert綜合征家系的基因突變分析
發(fā)布時(shí)間:2021-01-31 14:45
目的:利用多種基因檢測(cè)手段探究28個(gè)Joubert綜合征家系的致病基因及變異位點(diǎn)。研究對(duì)象及方法:在全國(guó)范圍內(nèi)募集了 28個(gè)Joubert綜合征家系(共29名患者),對(duì)患者的病例資料進(jìn)行匯總整理并對(duì)家系成員進(jìn)行提取核酸。1.利用靶向基因組測(cè)序和全外顯子組測(cè)序技術(shù)對(duì)患者基因組DNA進(jìn)行高通量測(cè)序。2.利用生物信息學(xué)方法對(duì)二代測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行比對(duì)、注釋、過濾,挑選出可能致病的變異位點(diǎn)。3.利用Sanger測(cè)序?qū)ψ儺愇稽c(diǎn)在患者及其直系親屬中進(jìn)行驗(yàn)證。4.進(jìn)行拷貝數(shù)變異分析檢測(cè)樣本可能存在的拷貝數(shù)變化并通過MLPA和Q-PCR的方法進(jìn)行驗(yàn)證。5.利用RT-PCR的方法在cDNA水平上驗(yàn)證剪接位點(diǎn)對(duì)剪接的影響。結(jié)果:本實(shí)驗(yàn)為來自24個(gè)Joubert綜合征家系的25例患者明確了致病基因和變異位點(diǎn),占比86.2%,在兩例患者中各找到一個(gè)位于已知致病基因雜合型的可能致病的變異位點(diǎn),占比6.9%,兩例患者的致病基因及位點(diǎn)尚未找到,占比6.9%。篩選出位于 CC2D2A、C5orf42、AHI1、ARMC9、CEP290、NPHP1、ARL13B、B9D2、CSPP1、INPP5E、PIBF1、RPGRIPI...
【文章來源】:北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院北京市 211工程院校 985工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:114 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖2.纖毛疾病基因和表型的復(fù)雜交疊M??1.2?Joubert綜合征的研究進(jìn)展??Joubert綜合征(Joubertsyndrome,簡(jiǎn)稱JS,MIM#213300)是纖毛病的典型代表,??
rt綜合征是1969年由Joubert[44]及其同事首次在一個(gè)法裔-加拿妹發(fā)現(xiàn)的。這四個(gè)患者均存在認(rèn)知障礙、共濟(jì)失調(diào)、呼吸急蝴部發(fā)育不全的異常表型。隨后在1977年,Boltshauser和Isler[4似臨床癥狀的患者,并將具有相同或類似這種臨床表型的這合征。后來隨著醫(yī)學(xué)技術(shù)的發(fā)展和磁共振成像技術(shù)應(yīng)用到臨察多數(shù)Joubert綜合征患者的臨床病例后,Marie[46]發(fā)現(xiàn)在Joube振成像中存在普遍的異,F(xiàn)象,即因患者小腦蚓部發(fā)育不良現(xiàn)為中后腦連接部位呈現(xiàn)“磨牙征”的現(xiàn)象,隨后將顱腦磁共”作為Joubert綜合征的特征性診斷標(biāo)志。隨著對(duì)Joubert綜合征rt綜合征致病機(jī)制的不斷探索,目前,己經(jīng)有相對(duì)完善的Joubet主要包括::(1)顱腦磁共振成像顯示為“磨牙征”,具體體現(xiàn)為間窩加深以及小腦上腳的抬高增粗;(2)患者存在不同程度的(3)存在嬰幼兒時(shí)期的肌張力減退;(4)下列兩項(xiàng)中至少存在一的呼吸節(jié)律異常(體現(xiàn)為呼吸急促和/或呼吸暫;騼煞N呼吸異眼運(yùn)動(dòng)異常(包括眼球震顫和/或眼球運(yùn)動(dòng)失能)[47]。??Normal?Classic?MTS??
圖4.?Joubert綜合征基因突變分析的技術(shù)路線??2實(shí)驗(yàn)材料和方法??2.1實(shí)驗(yàn)設(shè)備??儀器設(shè)備?生產(chǎn)商???微量移液器(2.5,10,100,200,1?OOOpL)?Eppendorf,Germany??高壓蒸汽滅菌鍋(MJS-54A)?施都凱儀器設(shè)備有限公司??恒溫金屬。ǎ龋拢保埃埃?杭州博日科技有限公司??高速離心機(jī)(1-14)?Sigma??核酸蛋白定量?jī)x(Nanodrop?2000C)?Thermo?Scientific,??QubitR3.0?Fluorometer?Life?Technologies,U.S.A??Milli-Q?Millipore,?U.S.A??
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]少年型腎單位腎癆Ⅰ型臨床特點(diǎn)和基因診斷[J]. 王少華,李媛媛,章友康,張建春,馬祎楠,陳文志,劉運(yùn)來. 中國(guó)中西醫(yī)結(jié)合腎病雜志. 2017(06)
[2]細(xì)胞纖毛在信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)與器官發(fā)育中的作用與機(jī)制[J]. 孫建建,武子涵,鐘濤. 中國(guó)科學(xué):生命科學(xué). 2016(04)
[3]初級(jí)纖毛與Wnt信號(hào)通路相關(guān)性研究進(jìn)展[J]. 張蔓麗,盧彥平,李亞里. 遺傳. 2015(03)
[4]纖毛中Hedgehog信號(hào)調(diào)控機(jī)制研究進(jìn)展[J]. 王亞楠,鄒沙沙,李錚,胡洪亮. 上海交通大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版). 2013(04)
[5]纖毛及纖毛相關(guān)疾病研究進(jìn)展[J]. 曹木青,潘俊敏. 中國(guó)細(xì)胞生物學(xué)學(xué)報(bào). 2012(09)
[6]高通量測(cè)序技術(shù)及其應(yīng)用[J]. 王興春,楊致榮,王敏,李瑋,李生才. 中國(guó)生物工程雜志. 2012(01)
[7]衣藻、纖毛與“纖毛相關(guān)疾病”[J]. 潘俊敏. 中國(guó)科學(xué)(C輯:生命科學(xué)). 2008(05)
本文編號(hào):3011078
【文章來源】:北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院北京市 211工程院校 985工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:114 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【部分圖文】:
圖2.纖毛疾病基因和表型的復(fù)雜交疊M??1.2?Joubert綜合征的研究進(jìn)展??Joubert綜合征(Joubertsyndrome,簡(jiǎn)稱JS,MIM#213300)是纖毛病的典型代表,??
rt綜合征是1969年由Joubert[44]及其同事首次在一個(gè)法裔-加拿妹發(fā)現(xiàn)的。這四個(gè)患者均存在認(rèn)知障礙、共濟(jì)失調(diào)、呼吸急蝴部發(fā)育不全的異常表型。隨后在1977年,Boltshauser和Isler[4似臨床癥狀的患者,并將具有相同或類似這種臨床表型的這合征。后來隨著醫(yī)學(xué)技術(shù)的發(fā)展和磁共振成像技術(shù)應(yīng)用到臨察多數(shù)Joubert綜合征患者的臨床病例后,Marie[46]發(fā)現(xiàn)在Joube振成像中存在普遍的異,F(xiàn)象,即因患者小腦蚓部發(fā)育不良現(xiàn)為中后腦連接部位呈現(xiàn)“磨牙征”的現(xiàn)象,隨后將顱腦磁共”作為Joubert綜合征的特征性診斷標(biāo)志。隨著對(duì)Joubert綜合征rt綜合征致病機(jī)制的不斷探索,目前,己經(jīng)有相對(duì)完善的Joubet主要包括::(1)顱腦磁共振成像顯示為“磨牙征”,具體體現(xiàn)為間窩加深以及小腦上腳的抬高增粗;(2)患者存在不同程度的(3)存在嬰幼兒時(shí)期的肌張力減退;(4)下列兩項(xiàng)中至少存在一的呼吸節(jié)律異常(體現(xiàn)為呼吸急促和/或呼吸暫;騼煞N呼吸異眼運(yùn)動(dòng)異常(包括眼球震顫和/或眼球運(yùn)動(dòng)失能)[47]。??Normal?Classic?MTS??
圖4.?Joubert綜合征基因突變分析的技術(shù)路線??2實(shí)驗(yàn)材料和方法??2.1實(shí)驗(yàn)設(shè)備??儀器設(shè)備?生產(chǎn)商???微量移液器(2.5,10,100,200,1?OOOpL)?Eppendorf,Germany??高壓蒸汽滅菌鍋(MJS-54A)?施都凱儀器設(shè)備有限公司??恒溫金屬。ǎ龋拢保埃埃?杭州博日科技有限公司??高速離心機(jī)(1-14)?Sigma??核酸蛋白定量?jī)x(Nanodrop?2000C)?Thermo?Scientific,??QubitR3.0?Fluorometer?Life?Technologies,U.S.A??Milli-Q?Millipore,?U.S.A??
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]少年型腎單位腎癆Ⅰ型臨床特點(diǎn)和基因診斷[J]. 王少華,李媛媛,章友康,張建春,馬祎楠,陳文志,劉運(yùn)來. 中國(guó)中西醫(yī)結(jié)合腎病雜志. 2017(06)
[2]細(xì)胞纖毛在信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)與器官發(fā)育中的作用與機(jī)制[J]. 孫建建,武子涵,鐘濤. 中國(guó)科學(xué):生命科學(xué). 2016(04)
[3]初級(jí)纖毛與Wnt信號(hào)通路相關(guān)性研究進(jìn)展[J]. 張蔓麗,盧彥平,李亞里. 遺傳. 2015(03)
[4]纖毛中Hedgehog信號(hào)調(diào)控機(jī)制研究進(jìn)展[J]. 王亞楠,鄒沙沙,李錚,胡洪亮. 上海交通大學(xué)學(xué)報(bào)(醫(yī)學(xué)版). 2013(04)
[5]纖毛及纖毛相關(guān)疾病研究進(jìn)展[J]. 曹木青,潘俊敏. 中國(guó)細(xì)胞生物學(xué)學(xué)報(bào). 2012(09)
[6]高通量測(cè)序技術(shù)及其應(yīng)用[J]. 王興春,楊致榮,王敏,李瑋,李生才. 中國(guó)生物工程雜志. 2012(01)
[7]衣藻、纖毛與“纖毛相關(guān)疾病”[J]. 潘俊敏. 中國(guó)科學(xué)(C輯:生命科學(xué)). 2008(05)
本文編號(hào):3011078
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