28個Joubert綜合征家系的基因突變分析
發(fā)布時間:2021-01-31 14:45
目的:利用多種基因檢測手段探究28個Joubert綜合征家系的致病基因及變異位點。研究對象及方法:在全國范圍內(nèi)募集了 28個Joubert綜合征家系(共29名患者),對患者的病例資料進(jìn)行匯總整理并對家系成員進(jìn)行提取核酸。1.利用靶向基因組測序和全外顯子組測序技術(shù)對患者基因組DNA進(jìn)行高通量測序。2.利用生物信息學(xué)方法對二代測序數(shù)據(jù)進(jìn)行比對、注釋、過濾,挑選出可能致病的變異位點。3.利用Sanger測序?qū)ψ儺愇稽c在患者及其直系親屬中進(jìn)行驗證。4.進(jìn)行拷貝數(shù)變異分析檢測樣本可能存在的拷貝數(shù)變化并通過MLPA和Q-PCR的方法進(jìn)行驗證。5.利用RT-PCR的方法在cDNA水平上驗證剪接位點對剪接的影響。結(jié)果:本實驗為來自24個Joubert綜合征家系的25例患者明確了致病基因和變異位點,占比86.2%,在兩例患者中各找到一個位于已知致病基因雜合型的可能致病的變異位點,占比6.9%,兩例患者的致病基因及位點尚未找到,占比6.9%。篩選出位于 CC2D2A、C5orf42、AHI1、ARMC9、CEP290、NPHP1、ARL13B、B9D2、CSPP1、INPP5E、PIBF1、RPGRIPI...
【文章來源】:北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院北京市 211工程院校 985工程院校
【文章頁數(shù)】:114 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖2.纖毛疾病基因和表型的復(fù)雜交疊M??1.2?Joubert綜合征的研究進(jìn)展??Joubert綜合征(Joubertsyndrome,簡稱JS,MIM#213300)是纖毛病的典型代表,??
rt綜合征是1969年由Joubert[44]及其同事首次在一個法裔-加拿妹發(fā)現(xiàn)的。這四個患者均存在認(rèn)知障礙、共濟失調(diào)、呼吸急蝴部發(fā)育不全的異常表型。隨后在1977年,Boltshauser和Isler[4似臨床癥狀的患者,并將具有相同或類似這種臨床表型的這合征。后來隨著醫(yī)學(xué)技術(shù)的發(fā)展和磁共振成像技術(shù)應(yīng)用到臨察多數(shù)Joubert綜合征患者的臨床病例后,Marie[46]發(fā)現(xiàn)在Joube振成像中存在普遍的異常現(xiàn)象,即因患者小腦蚓部發(fā)育不良現(xiàn)為中后腦連接部位呈現(xiàn)“磨牙征”的現(xiàn)象,隨后將顱腦磁共”作為Joubert綜合征的特征性診斷標(biāo)志。隨著對Joubert綜合征rt綜合征致病機制的不斷探索,目前,己經(jīng)有相對完善的Joubet主要包括::(1)顱腦磁共振成像顯示為“磨牙征”,具體體現(xiàn)為間窩加深以及小腦上腳的抬高增粗;(2)患者存在不同程度的(3)存在嬰幼兒時期的肌張力減退;(4)下列兩項中至少存在一的呼吸節(jié)律異常(體現(xiàn)為呼吸急促和/或呼吸暫停或兩種呼吸異眼運動異常(包括眼球震顫和/或眼球運動失能)[47]。??Normal?Classic?MTS??
圖4.?Joubert綜合征基因突變分析的技術(shù)路線??2實驗材料和方法??2.1實驗設(shè)備??儀器設(shè)備?生產(chǎn)商???微量移液器(2.5,10,100,200,1?OOOpL)?Eppendorf,Germany??高壓蒸汽滅菌鍋(MJS-54A)?施都凱儀器設(shè)備有限公司??恒溫金屬。ǎ龋拢保埃埃?杭州博日科技有限公司??高速離心機(1-14)?Sigma??核酸蛋白定量儀(Nanodrop?2000C)?Thermo?Scientific,??QubitR3.0?Fluorometer?Life?Technologies,U.S.A??Milli-Q?Millipore,?U.S.A??
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]少年型腎單位腎癆Ⅰ型臨床特點和基因診斷[J]. 王少華,李媛媛,章友康,張建春,馬祎楠,陳文志,劉運來. 中國中西醫(yī)結(jié)合腎病雜志. 2017(06)
[2]細(xì)胞纖毛在信號轉(zhuǎn)導(dǎo)與器官發(fā)育中的作用與機制[J]. 孫建建,武子涵,鐘濤. 中國科學(xué):生命科學(xué). 2016(04)
[3]初級纖毛與Wnt信號通路相關(guān)性研究進(jìn)展[J]. 張蔓麗,盧彥平,李亞里. 遺傳. 2015(03)
[4]纖毛中Hedgehog信號調(diào)控機制研究進(jìn)展[J]. 王亞楠,鄒沙沙,李錚,胡洪亮. 上海交通大學(xué)學(xué)報(醫(yī)學(xué)版). 2013(04)
[5]纖毛及纖毛相關(guān)疾病研究進(jìn)展[J]. 曹木青,潘俊敏. 中國細(xì)胞生物學(xué)學(xué)報. 2012(09)
[6]高通量測序技術(shù)及其應(yīng)用[J]. 王興春,楊致榮,王敏,李瑋,李生才. 中國生物工程雜志. 2012(01)
[7]衣藻、纖毛與“纖毛相關(guān)疾病”[J]. 潘俊敏. 中國科學(xué)(C輯:生命科學(xué)). 2008(05)
本文編號:3011078
【文章來源】:北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院北京市 211工程院校 985工程院校
【文章頁數(shù)】:114 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖2.纖毛疾病基因和表型的復(fù)雜交疊M??1.2?Joubert綜合征的研究進(jìn)展??Joubert綜合征(Joubertsyndrome,簡稱JS,MIM#213300)是纖毛病的典型代表,??
rt綜合征是1969年由Joubert[44]及其同事首次在一個法裔-加拿妹發(fā)現(xiàn)的。這四個患者均存在認(rèn)知障礙、共濟失調(diào)、呼吸急蝴部發(fā)育不全的異常表型。隨后在1977年,Boltshauser和Isler[4似臨床癥狀的患者,并將具有相同或類似這種臨床表型的這合征。后來隨著醫(yī)學(xué)技術(shù)的發(fā)展和磁共振成像技術(shù)應(yīng)用到臨察多數(shù)Joubert綜合征患者的臨床病例后,Marie[46]發(fā)現(xiàn)在Joube振成像中存在普遍的異常現(xiàn)象,即因患者小腦蚓部發(fā)育不良現(xiàn)為中后腦連接部位呈現(xiàn)“磨牙征”的現(xiàn)象,隨后將顱腦磁共”作為Joubert綜合征的特征性診斷標(biāo)志。隨著對Joubert綜合征rt綜合征致病機制的不斷探索,目前,己經(jīng)有相對完善的Joubet主要包括::(1)顱腦磁共振成像顯示為“磨牙征”,具體體現(xiàn)為間窩加深以及小腦上腳的抬高增粗;(2)患者存在不同程度的(3)存在嬰幼兒時期的肌張力減退;(4)下列兩項中至少存在一的呼吸節(jié)律異常(體現(xiàn)為呼吸急促和/或呼吸暫停或兩種呼吸異眼運動異常(包括眼球震顫和/或眼球運動失能)[47]。??Normal?Classic?MTS??
圖4.?Joubert綜合征基因突變分析的技術(shù)路線??2實驗材料和方法??2.1實驗設(shè)備??儀器設(shè)備?生產(chǎn)商???微量移液器(2.5,10,100,200,1?OOOpL)?Eppendorf,Germany??高壓蒸汽滅菌鍋(MJS-54A)?施都凱儀器設(shè)備有限公司??恒溫金屬。ǎ龋拢保埃埃?杭州博日科技有限公司??高速離心機(1-14)?Sigma??核酸蛋白定量儀(Nanodrop?2000C)?Thermo?Scientific,??QubitR3.0?Fluorometer?Life?Technologies,U.S.A??Milli-Q?Millipore,?U.S.A??
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]少年型腎單位腎癆Ⅰ型臨床特點和基因診斷[J]. 王少華,李媛媛,章友康,張建春,馬祎楠,陳文志,劉運來. 中國中西醫(yī)結(jié)合腎病雜志. 2017(06)
[2]細(xì)胞纖毛在信號轉(zhuǎn)導(dǎo)與器官發(fā)育中的作用與機制[J]. 孫建建,武子涵,鐘濤. 中國科學(xué):生命科學(xué). 2016(04)
[3]初級纖毛與Wnt信號通路相關(guān)性研究進(jìn)展[J]. 張蔓麗,盧彥平,李亞里. 遺傳. 2015(03)
[4]纖毛中Hedgehog信號調(diào)控機制研究進(jìn)展[J]. 王亞楠,鄒沙沙,李錚,胡洪亮. 上海交通大學(xué)學(xué)報(醫(yī)學(xué)版). 2013(04)
[5]纖毛及纖毛相關(guān)疾病研究進(jìn)展[J]. 曹木青,潘俊敏. 中國細(xì)胞生物學(xué)學(xué)報. 2012(09)
[6]高通量測序技術(shù)及其應(yīng)用[J]. 王興春,楊致榮,王敏,李瑋,李生才. 中國生物工程雜志. 2012(01)
[7]衣藻、纖毛與“纖毛相關(guān)疾病”[J]. 潘俊敏. 中國科學(xué)(C輯:生命科學(xué)). 2008(05)
本文編號:3011078
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