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結(jié)締組織相關(guān)基因與先天性脊柱側(cè)凸的遺傳學(xué)病因研究

發(fā)布時(shí)間:2021-01-09 09:08
  研究背景:先天性脊柱側(cè)凸(Congenital Scoliosis,CS)是青少年致殘的主要原因之一,為患者家庭和社會(huì)帶去了嚴(yán)重的負(fù)擔(dān)。CS可作為合并癥出現(xiàn)在許多遺傳性結(jié)締組織疾。℉ereditary Connective Tissue Disease,HCTD)中如馬凡氏綜合征,Ehlers-Danlos綜合征,成骨不全癥等。既往也有一些關(guān)聯(lián)研究顯示結(jié)締組織相關(guān)基因?qū)怪鶄?cè)凸的致病有一定的相關(guān)性。因此,HCTD相關(guān)致病基因可能對(duì)CS的致病同樣起著至關(guān)重要的作用。研究目的:1.建立CS患者隊(duì)列,明確HCTD相關(guān)致病基因;2.對(duì)CS隊(duì)列進(jìn)行全外顯子組測(cè)序,通過(guò)突變負(fù)荷檢驗(yàn)篩選候選致病基因;3.初步驗(yàn)證候選基因的致病性,分析其可能的致病機(jī)制;4.通過(guò)對(duì)CS患者表型的整理,分析候選基因變異對(duì)表型的貢獻(xiàn)。研究方法:1.通過(guò)確立入組和排除標(biāo)準(zhǔn),在前期課題組研究的基礎(chǔ)上繼續(xù)建立和擴(kuò)大CS患者和對(duì)照隊(duì)列;2.通過(guò)基因本體論的方法確定HCTD相關(guān)致病基因;3.通過(guò)全外顯子組測(cè)序?qū)颊吆蛯?duì)照進(jìn)行基因檢測(cè)分析,篩選出高致病性變異;4.通過(guò)突變負(fù)荷檢驗(yàn),分析HCTD相關(guān)致病基因?qū)S的貢獻(xiàn)。通過(guò)亞組分析確... 

【文章來(lái)源】:北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院北京市 211工程院校 985工程院校

【文章頁(yè)數(shù)】:75 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:博士

【部分圖文】:

結(jié)締組織相關(guān)基因與先天性脊柱側(cè)凸的遺傳學(xué)病因研究


圖1.體節(jié)、椎體發(fā)育與部分調(diào)控基因??(引自?Giampietro,et?al.?Clinical?Medicine?&?Research,?2003,?1?(2):??125-136.)??

技術(shù)路線圖,課題,測(cè)序,脊柱側(cè)凸


DNA隨機(jī)打碎為小片段后,并行地對(duì)數(shù)百萬(wàn)個(gè)DNA小片段進(jìn)行測(cè)序。進(jìn)而通過(guò)生??物信息學(xué)分析將各個(gè)測(cè)序片段參考人類基因組序列拼接起來(lái)。人類基因組中的??30億個(gè)堿基中的每一個(gè)都進(jìn)行了多次測(cè)序,高深度的測(cè)序可提供準(zhǔn)確的數(shù)據(jù)并??檢測(cè)出DNA水平變異%99]。??實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)思路與技術(shù)路線??綜上所述,脊柱側(cè)凸的遺傳學(xué)病因研究尚有許多亟待解決的問(wèn)題,除了經(jīng)典??的FGF,Wnt,Notch通路之外,ECMSCs基因也可能對(duì)脊柱側(cè)凸的致病起到貢獻(xiàn)。??本課題依托北京協(xié)和醫(yī)院骨科、北京市骨骼畸形遺傳學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室以及DISCO國(guó)??際協(xié)作組(Deciphering?Disorders?Involving?Scoliosis?&?Comorbidities)??的優(yōu)質(zhì)病例資源和完善的遺傳學(xué)研究平臺(tái),通過(guò)NGS研究ECMSCs基因變異與脊??柱側(cè)凸的相關(guān)性,并在此基礎(chǔ)之上研究基因型-表型相關(guān)性。技術(shù)路線圖如圖2??所示。??

路線圖,實(shí)驗(yàn)技術(shù),路線圖


第一部分細(xì)胞外基質(zhì)結(jié)構(gòu)性基因單核苷酸變異與先天性脊柱側(cè)??凸相關(guān)性研究??1.1.前言??在文獻(xiàn)復(fù)習(xí)中,我們了解到部分ECMSCs與脊柱側(cè)凸的致病有著相關(guān)性,??Haller等[1°°]曾在青少年特發(fā)性脊柱側(cè)凸隊(duì)列中驗(yàn)證了?ECMSCs多基因突變負(fù)荷??的貢獻(xiàn),但其在CS中的貢獻(xiàn)尚缺乏大規(guī)模隊(duì)列研究。本部分實(shí)驗(yàn)旨在通過(guò)北京??協(xié)和醫(yī)院骨科優(yōu)秀的病例資源,借助北京市骨骼畸形遺傳重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室完善的遺傳??學(xué)研究平臺(tái),研究ECMSCs在CS隊(duì)列中的多基因突變負(fù)荷貢獻(xiàn),進(jìn)而通過(guò)亞組分??析確定可能的候選基因。這一部分實(shí)驗(yàn)的技術(shù)路線圖如圖1.?1所示。??

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]先天性脊柱側(cè)凸遺傳學(xué)病因的研究進(jìn)展[J]. 寇瑤,杜柏均,田靜,祝勇.  中國(guó)脊柱脊髓雜志. 2016(07)
[2]青少年特發(fā)性脊柱側(cè)凸的遺傳機(jī)制研究現(xiàn)狀及基因關(guān)系圖[J]. 王偉,馬君,李淑元,吳嫻,胡斌,王笑峰,周許輝.  中國(guó)骨傷. 2015(09)
[3]青少年特發(fā)性脊柱側(cè)凸患者頂椎關(guān)節(jié)突中Ⅰ型膠原的表達(dá)[J]. 錢文偉,邱貴興,吳志宏,劉勇,王以朋,仉建國(guó),翁習(xí)生,楊新宇.  中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院學(xué)報(bào). 2005(02)



本文編號(hào):2966368

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