【摘要】：目的利用16s rRNA高通量測(cè)序技術(shù)分析糖尿病足骨髓炎(DFO)感染骨組織中病原微生物特點(diǎn),為臨床感染病原菌的鑒定及治療提供快速、準(zhǔn)確的方法。方法收取2016年9月~2017年4月于本科室住院的16例DFO患者清創(chuàng)術(shù)中獲取的感染骨標(biāo)本,分別利用16s rRNA高通量測(cè)序技術(shù)和血培養(yǎng)分析儀進(jìn)行病原微生物的鑒定,分析16s rRNA測(cè)序結(jié)果中DFO的菌群特點(diǎn),并與培養(yǎng)結(jié)果相比較。結(jié)果 16s rRNA測(cè)序顯示DFO骨組織病原微生物多樣性較大,分布較為均勻,共獲得優(yōu)勢(shì)菌屬20種,占所有菌屬的87.00%,其中Prevotella是豐度最大的菌屬。兩種鑒定方法結(jié)果均顯示DFO病原菌以革蘭氏陰性菌為主。與培養(yǎng)法相比,16s rRNA測(cè)序陽(yáng)性率較高(100%vs 88.24%),平均每個(gè)樣本病原菌數(shù)較多(12.56 vs 1.50),革蘭氏陰性菌所占的比例較高(67.16% vs 50.00%)。此外,16s rRNA測(cè)序結(jié)果覆蓋了除Escherichia coli、Serratia marcescens及Enterobacter cloaca外的所有培養(yǎng)病原菌結(jié)果,甚至有高達(dá)13種菌屬不存在于培養(yǎng)結(jié)果,其中Anaerococcus、Veillonella、Bacteroides、Fusobacterium、Porphyromonas、Finegoldia、Prevotella、Peptostreptococcus、Parvimonas、Peptoniphilus和Bulleidia均為專性厭氧菌或嚴(yán)格厭氧菌,而培養(yǎng)結(jié)果中并無厭氧菌的出現(xiàn)。但培養(yǎng)結(jié)果顯示,DFO中多重耐藥菌的比例高達(dá)58.33%。結(jié)論 16s rRNA高通量測(cè)序能較好展示DFO骨組織中菌群微生態(tài)的多樣性及豐度特點(diǎn)。DFO骨組織病原微生物多樣性大,分布均勻,但優(yōu)勢(shì)菌屬分布離散,以革蘭氏陰性菌為主。與培養(yǎng)法相比,16s rRNA測(cè)序?qū)Σ≡蔫b定簡(jiǎn)單而準(zhǔn)確,尤其在對(duì)革蘭氏陰性菌和厭氧菌鑒定方面有顯著的優(yōu)勢(shì),可快速而準(zhǔn)確地指導(dǎo)DFO感染治療。
【圖文】：

NA測(cè)序法的陽(yáng)性率高達(dá)100%（16/16）。培養(yǎng)法和16srRNA測(cè)序法在優(yōu)勢(shì)菌屬種類數(shù)上的區(qū)別相差不大，分別為16種和20種，但后者平均每個(gè)樣本優(yōu)勢(shì)菌屬的種類數(shù)是前者的8倍以上（12.56種vs1.50種）。兩種微生物鑒定方法結(jié)果均表明革蘭氏陰性菌所占比例高于革蘭氏陽(yáng)性菌，，且16srRNA測(cè)序結(jié)果中革蘭氏陰性菌所占比例高于培養(yǎng)法（67.16%vs50.00%），但差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義（P>0.05）。培養(yǎng)結(jié)果中Staphylococcusaureus（12.50%）為最主要病原菌，其次為Enterococcusfaecalis、Streptococcusacidominimus、Escherichiacoli、Proteus圖3菌屬相對(duì)豐度堆疊圖Fig.3Stackofrelativeabundancedominantgenera.Dd1Dd2Dd3Dd4Dd5Dd6Dd7Dd8Dd9Dd10Dd11Dd12Dd13Dd14Dd15Dd16Samples1.000.750.500.250.00ActinomycesBacteroidesPorphyromonasPrevotellaStaphylococcusStaphylococcusStreptococcusPeptostreptococcusDialisterVeillonellaAnaerococcusFinegoldiaParvimonasPeptoniphilusBulleidiaFusobacteriumCitrobacterKlebsiellaProteusHalomonasPseudomonasOthersdbunAanceDd1Dd10Dd11Dd12Dd13Dd14Dd15Dd16Dd2Dd3Dd4Dd5Dd6Dd7Dd8Dd930020010000100002000030000SequenceperSampleSamples圖1OUT稀釋曲線Fig.1RarefactioncurveofOTU.0100200300OTUrankelativeRdbunance1.00.10.010.0010.0001GroupDd1Dd2Dd3Dd4Dd5Dd6Dd7Dd8Dd9Dd10Dd11Dd12Dd13Dd14Dd15Dd16圖2Rankabundance曲線Fig.2RankabundancecurveofOTU.http://www.j-smu.comJSouthMedUniv,2017,37(11):1448-1455·1451·

Dd15Dd16Samples1.000.750.500.250.00ActinomycesBacteroidesPorphyromonasPrevotellaStaphylococcusStaphylococcusStreptococcusPeptostreptococcusDialisterVeillonellaAnaerococcusFinegoldiaParvimonasPeptoniphilusBulleidiaFusobacteriumCitrobacterKlebsiellaProteusHalomonasPseudomonasOthersdbunAanceDd1Dd10Dd11Dd12Dd13Dd14Dd15Dd16Dd2Dd3Dd4Dd5Dd6Dd7Dd8Dd930020010000100002000030000SequenceperSampleSamples圖1OUT稀釋曲線Fig.1RarefactioncurveofOTU.0100200300OTUrankelativeRdbunance1.00.10.010.0010.0001GroupDd1Dd2Dd3Dd4Dd5Dd6Dd7Dd8Dd9Dd10Dd11Dd12Dd13Dd14Dd15Dd16圖2Rankabundance曲線Fig.2RankabundancecurveofOTU.http://www.j-smu.comJSouthMedUniv,2017,37(11):1448-1455·1451·

【相似文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前9條

1 金世鑫，汪耀，沈志衛(wèi);骨質(zhì)疏松綜合征:骨組織學(xué)和臨床的聯(lián)系(三)[J];中國(guó)骨質(zhì)疏松雜志;1997年02期

2 胡曉纓;廖進(jìn)民;陳艷;;氟、鋁和氟鋁聯(lián)合中毒對(duì)骨組織和骨相關(guān)調(diào)節(jié)系統(tǒng)影響的研究現(xiàn)狀[J];廣東醫(yī)學(xué)院學(xué)報(bào);2012年05期

3 巴月;余波;馬建國(guó);朱靜媛;李世宏;金艷濤;李二為;宋曉輝;高利華;程學(xué)敏;崔留欣;;Ⅰ型膠原α2鏈基因多態(tài)性及其與氟暴露人群骨組織異常關(guān)系的分析[J];中國(guó)地方病學(xué)雜志;2006年04期

4 楊丹;于燕妮;鄧超男;朱海振;;氟對(duì)大鼠骨組織Osterix mRNA及其蛋白表達(dá)影響[J];中國(guó)公共衛(wèi)生;2011年08期

5 祝賀峰;老年性骨質(zhì)疏松癥的防治[J];中國(guó)保健營(yíng)養(yǎng);2001年02期

6 劉月桂,張靈菊,陳寶龍,馮坤;對(duì)中藥治療后骨質(zhì)疏松模型大鼠骨組織中相關(guān)元素分析[J];微量元素與健康研究;2000年01期

7 楊丹;于燕妮;韓然;;慢性氟中毒大鼠骨組織Cthrc1 mRNA及蛋白表達(dá)[J];貴陽(yáng)醫(yī)學(xué)院學(xué)報(bào);2014年03期

8 吳延莉;向蓉;徐小東;曹發(fā)軍;范祥;韋艷;;慢性氟中毒大鼠骨組織中G蛋白的表達(dá)[J];環(huán)境與健康雜志;2014年04期

9 謝肇;吳雪暉;許建中;孟萍;李起鴻;;BEMF對(duì)OVX-OP大鼠骨組織TGF-β_1表達(dá)的影響及意義[J];重慶醫(yī)學(xué);2007年08期

相關(guān)碩士學(xué)位論文 前1條

1 陳修文;氟對(duì)大鼠骨組織RBPJ及相關(guān)基因表達(dá)的影響[D];貴州醫(yī)科大學(xué);2016年

本文編號(hào)：2570881