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高通量測(cè)序技術(shù)研究糖尿病大鼠與正常大鼠糞便菌群的結(jié)構(gòu)差異

發(fā)布時(shí)間:2018-08-14 10:17
【摘要】:為研究糖尿病大鼠和正常大鼠糞便菌群的結(jié)構(gòu)差異,選取SD雄性大鼠,隨機(jī)分為正常組和糖尿病組,于第4周末,對(duì)大鼠糞便菌群16S r RNA的V1~V3區(qū)進(jìn)行擴(kuò)增,Miseq高通量測(cè)序平臺(tái)測(cè)定其基因序列,與silva數(shù)據(jù)庫(kù)中微生物基因序列進(jìn)行比對(duì)、分類。研究發(fā)現(xiàn):糖尿病大鼠體重較正常組顯著下降;糖尿病大鼠糞便菌群多樣性高于正常大鼠;糖尿病大鼠糞便菌群中腸桿菌目,假單孢桿菌目等機(jī)會(huì)致病菌增多;同時(shí)克里斯滕森菌科,明串珠菌科,黃桿菌科,Clostridium sensu stricto 1,Gastranaerophilales_norank,Ruminococcaceae_incertae_sedis等在糖尿病組糞便中大量存在。結(jié)果表明:糖尿病大鼠腸道菌群結(jié)構(gòu)與正常大鼠差異顯著,存在腸道菌群紊亂的狀況,提示臨床上可通過(guò)調(diào)節(jié)飲食結(jié)構(gòu)來(lái)改善腸道菌群,達(dá)到防治2型糖尿病的目的。
[Abstract]:In order to study the difference of fecal flora between diabetic rats and normal rats, SD male rats were randomly divided into normal group and diabetic group at the end of the 4th week. The V1~V3 region of 16s r RNA of rat faecal flora was amplified by high throughput sequencing platform. The gene sequence was compared with that of microorganism in silva database and classified. The results showed that the body weight of diabetic rats was significantly lower than that of normal rats, the fecal microflora diversity of diabetic rats was higher than that of normal rats, the fecal flora of diabetic rats was increased, and the number of opportunistic pathogens such as Enterobacteriae, pseudomonas and so on were increased in diabetic rats. At the same time, Clostridium sensu stricto 1 and gastranaerophilia cells were found in the feces of diabetes mellitus group, such as Christensen, Streptomycaceae, Serulidae, Serulidae, Serulidae, and Clostridium sensu stricto 1 / gastranaerophilia sp. Ruminococcaceaeincertaesedis, and so on. The results showed that the intestinal flora structure of diabetic rats was significantly different from that of normal rats, and the intestinal microflora disorder existed, which suggested that the intestinal flora could be improved by adjusting dietary structure in order to prevent and treat type 2 diabetes mellitus.
【作者單位】: 天津科技大學(xué)食品工程與生物技術(shù)學(xué)院;
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31471701) 科技部中歐合作資金項(xiàng)目(SQ2013ZOA100001)
【分類號(hào)】:R587.1

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