基于iTRAQ技術(shù)在類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎患者滑膜組織中差異表達(dá)蛋白的初步研究
本文選題:類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎 + iTRAQ技術(shù) ; 參考:《蘭州大學(xué)》2017年碩士論文
【摘要】:目的本實(shí)驗(yàn)應(yīng)用iTRAQ技術(shù)初步分析RA、OA及健康對(duì)照組患者滑膜組織中的差異表達(dá)蛋白,探討這些差異表達(dá)蛋白及其所參與的代謝通路與RA發(fā)病的相關(guān)性,為研究RA的形成機(jī)理及臨床干預(yù)提供理論依據(jù)。方法收集蘭州大學(xué)第二醫(yī)院2015年3月至2016年7月關(guān)節(jié)外科RA、OA及健康對(duì)照組患者(6例、14例、6例)手術(shù)后廢棄的滑膜組織作為研究對(duì)象。應(yīng)用iTRAQ技術(shù)對(duì)蛋白質(zhì)進(jìn)行定性、定量分析并對(duì)差異表達(dá)蛋白進(jìn)行GO功能分析及KEGG pathway通路注釋分析。結(jié)果1.差異表達(dá)蛋白定量分析顯示:RA組與N組相較,發(fā)現(xiàn)395個(gè)差異表達(dá)蛋白,其中上調(diào)蛋白216個(gè),下調(diào)蛋白179個(gè);RA組與OA組相比較,存在421個(gè)差異表達(dá)蛋白,234個(gè)上調(diào)表達(dá)蛋白,187個(gè)下調(diào)表達(dá)蛋白;OA組與N組相比較,共發(fā)現(xiàn)326個(gè)差異表達(dá)蛋白,132個(gè)差異表達(dá)蛋白表達(dá)上調(diào),94個(gè)差異表達(dá)蛋白下調(diào)。2.通過(guò)對(duì)差異表達(dá)蛋白的GO功能注釋分析顯示,RA組與N組相比較,發(fā)現(xiàn)生物學(xué)過(guò)程的功能分類有24種、分子功能作用有11種、分別位于10種細(xì)胞中。RA組與OA組相較存在25種不同的生物學(xué)過(guò)程、11種分子功能、分別位于10種細(xì)胞中。而OA組與N組比較,生物學(xué)過(guò)程有24種功能分類、分子功能作用有12種、位于11種細(xì)胞中。3.通過(guò)對(duì)差異表達(dá)蛋白的KEGG Pathway分析顯示,RA組與N組、RA組與OA組、OA組與N組比較,分別存在35條、41條、20條信號(hào)通路。結(jié)論1.S100蛋白家族、FIB家族參與了RA的發(fā)生、發(fā)展,有望成為RA診斷的新的分子標(biāo)志物。2.MMPs及CRP蛋白水平與RA患者病情活動(dòng)程度相關(guān)。3.PREX1、APO C-I可能參與了RA疾病的發(fā)生、發(fā)展。4.PI3K-AKT信號(hào)通路在RA患者的治療中具有潛在價(jià)值。
[Abstract]:Objective to analyze differentially expressed proteins in synovial tissues of patients with RAA OA and healthy controls by iTRAQ technique, and to explore the correlation between these proteins and the metabolic pathways involved in the pathogenesis of RA.To provide theoretical basis for studying the formation mechanism and clinical intervention of RA.Methods from March 2015 to July 2016, 14 patients with OA in arthrosurgery and 6 healthy controls were collected from the second Hospital of Lanzhou University. The abandoned synovial tissue was used as the study object.The protein was qualitatively and quantitatively analyzed by iTRAQ, and the differential expression protein was analyzed by go function analysis and KEGG pathway pathway annotation analysis.Result 1.Quantitative analysis of differentially expressed proteins showed that 395 differentially expressed proteins were found in group A and group N, including 216 up-regulated proteins and 179 down-regulated proteins in RA group compared with OA group.There were 421 differentially expressed proteins, 234 up-regulated proteins, and 187 down-regulated expression proteins compared with N group. 326 differentially expressed proteins were found in OA group, 132 differentially expressed proteins were up-regulated and 94 differentially expressed proteins were down-regulated.According to the go functional annotation analysis of differentially expressed proteins, it was found that there were 24 kinds of biological processes and 11 kinds of molecular functions in RA group compared with N group.There were 25 different biological processes and 11 molecular functions in RA group and OA group, respectively.Compared with N group, OA group had 24 functional classifications and 12 molecular functional functions, which were located in 11 kinds of cells.KEGG Pathway analysis of differentially expressed proteins showed that there were 35 or 41 signal pathways in RA group, N group, OA group, OA group and N group, respectively.Conclusion the 1.S100 family is involved in the pathogenesis and development of RA, which may be a new molecular marker for the diagnosis of RA. 2.MMPs and CRP protein levels may be related to the severity of disease activity in RA patients. 3. PREX1 APO C-I may be involved in the pathogenesis of RA.Development of PI3 K-AKT signaling pathway has potential value in the treatment of RA patients.
【學(xué)位授予單位】:蘭州大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2017
【分類號(hào)】:R593.22
【相似文獻(xiàn)】
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6 姚e,
本文編號(hào):1764835
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