整合分析脆性X染色體綜合征患者來源的誘導多能干細胞在神經(jīng)元分化中的轉錄組變化
發(fā)布時間:2017-10-19 01:01
本文關鍵詞:整合分析脆性X染色體綜合征患者來源的誘導多能干細胞在神經(jīng)元分化中的轉錄組變化
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【摘要】:脆性X染色體綜合征(fragile X syndrome,FXS)患者在FMR1基因的啟動子區(qū)具有超過200個以上CGG三核苷酸重復片段,導致其編碼的脆性X智力低下蛋白(fragile X mental retardation protein,FMRP)的表達減少或缺失.然而目前尚未在單核苷酸分辨率(即RNA-seq)水平上鑒定FMRP缺失所引起的轉錄組變化.本文對FXS患者成纖維細胞來源的誘導多能干細胞(human induced pluripotent stem cell,iPS細胞)(FXS-iPSC)進行了體外神經(jīng)元分化.然后懫用RNA-seq技術檢測了FXS-iPSC在體外神經(jīng)元分化各階段的轉錄調(diào)控變化情況.通過詳盡的分析這些轉錄組數(shù)據(jù)并整合其他研究平臺的成果,發(fā)現(xiàn)在FXS-iPSC分化得到的神經(jīng)元中許多與神經(jīng)元分化相關的轉錄因子(WNT1,BMP4,POU3F4,TFAP2C和PAX3)表達上調(diào),鉀離子通道基因(KCNA1,KCNC3,KCNG2,KCNIP4,KCNJ3,KCNK9和KCNT1)表達下調(diào),而SHANK1和NNAT轉錄調(diào)控的時序發(fā)生改變,這表明FXS患者神經(jīng)元的分化和功能受損.綜上所述,本研究證明FXS患者中FMRP的缺失顯著影響了神經(jīng)發(fā)育過程的基因表達模式,并將有助于發(fā)現(xiàn)臨床治療FXS的潛在靶點.
【作者單位】: 同濟大學醫(yī)學院同濟干細胞研究中心;同濟大學生命科學與技術學院;Department
【關鍵詞】: 脆性X染色體綜合征 智力發(fā)育遲滯 人類誘導多能干細胞 神經(jīng)元分化
【基金】:科技部國家重大科學研究計劃(批準號:2015CB964601,2015CB964702) 國家自然科學基金海外及港澳學者合作研究基金項目(批準號:31428016);國家自然科學基金重點項目(批準號:81430026) 教育部“留學回國人員科研啟動基金”(祝獻民) 上海市衛(wèi)計委(批準號:XBR2013094) 江蘇省科技計劃(批準號:BM2014052)資助
【分類號】:R596.1
【正文快照】: 脆性X染色體綜合征(fragile X syndrome,FXS)是一種常見的遺傳性疾病,與智力低下和情緒障礙有關,也被認為是最常見的單基因引起的自閉癥.FXS患者中,FMR1基因的5′端非翻譯區(qū)(5′-untranslated region,5′-UTR)CGG三核苷酸重復序列與健康人相比明顯增加(200).高度重復的CGG三
【相似文獻】
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1 ;我國科學家發(fā)現(xiàn)阻礙誘導多能干細胞形成的“路障”[J];生物學教學;2013年05期
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4 李拉;;直接轉入重新編碼蛋白誘導多能干細胞產(chǎn)生[J];生理科學進展;2011年05期
5 楊夢晗;化冰;池亞菲;王超;;誘導多能干細胞研究進展[J];生理科學進展;2012年01期
6 毛潤一;王t,
本文編號:1058138
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