本文關(guān)鍵詞：以LPAR3為中心的2型糖尿病相關(guān)基因功能富集及蛋白互作分析

  更多相關(guān)文章： LPAR 型糖尿病 生物信息學(xué) 數(shù)據(jù)庫(kù)

【摘要】：本研究目的是查找與2型糖尿病相關(guān)的潛在基因及其參與的生物過(guò)程、信號(hào)通路和蛋白互作網(wǎng)絡(luò)。利用GEO數(shù)據(jù)庫(kù)中GSE20966數(shù)據(jù)集,采用GENE-E平臺(tái),篩選出與LPAR3共表達(dá)的基因,結(jié)合生物信息學(xué)工具GOC、DAVID、COREMINE、Gene Mania對(duì)共表達(dá)基因進(jìn)行基因功能富集分析、文本挖掘及蛋白互作分析。我們篩選出LPAR3在2型糖尿病患者胰腺β細(xì)胞中表達(dá)值顯著低于正常對(duì)照組,其共表達(dá)基因603個(gè),主要涉及代謝過(guò)程、信號(hào)調(diào)控等生物過(guò)程和Hippo信號(hào)通路。共表達(dá)相關(guān)系數(shù)高的8個(gè)基因與2型糖尿病相關(guān),且均與腫瘤相關(guān),涉及代謝過(guò)程、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、發(fā)病機(jī)理、細(xì)胞增殖、細(xì)胞粘附等生物過(guò)程。LPAR3與20個(gè)已報(bào)道的2型糖尿病基因存在互作關(guān)系。本研究發(fā)現(xiàn)LPAR3及其共表達(dá)基因可能與2型糖尿病相關(guān),并可能增加患者罹患各系統(tǒng)腫瘤的風(fēng)險(xiǎn)。
【作者單位】： 桂林醫(yī)學(xué)院生物化學(xué)與分子生物學(xué)教研室;
【關(guān)鍵詞】： LPAR 型糖尿病 生物信息學(xué) 數(shù)據(jù)庫(kù)
【基金】：廣西壯族自治區(qū)教育廳科學(xué)技術(shù)研究項(xiàng)目(YB2014269)資助
【分類號(hào)】：R587.1
【正文快照】： Gene Function Enrichment and Protein Interaction Analysis of LPAR3 andIts Related Genes in Type 2 DiabetesMo Zhijing Ma Yili Li Kangzhi Liu Yongming*Department of Biochemistry and Molecular Biology,Guilin Medical University,Guilin,541100*Corresponding au，

本文編號(hào)：1047551