本文關(guān)鍵詞：中國(guó)人群中前列腺癌相關(guān)遺傳易感位點(diǎn)的研究

  更多相關(guān)文章： 前列腺癌 單核苷酸多態(tài)性(SNP) COL28A1 GWAS

【摘要】：前列腺癌(prostate cancer,PCa)是男性泌尿系統(tǒng)常見的惡性腫瘤,PCa的發(fā)生和發(fā)展是一個(gè)涉及多因素、多基因和多步驟的過程,是諸多先天和后天因素綜合作用的結(jié)果。先天因素方面,單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphism,SNP)起著的主要作用。研究發(fā)現(xiàn)SNP不僅可以預(yù)測(cè)PCa的發(fā)生風(fēng)險(xiǎn),同時(shí)還可以預(yù)測(cè)患者預(yù)后狀況。近年來,隨著GWAS的廣泛運(yùn)用,大量與PCa發(fā)生相關(guān)的SNP位點(diǎn)被發(fā)現(xiàn),主要位于2q、8q、11p、19q、17q和22q等12條染色體上,目前已發(fā)現(xiàn)超過70個(gè)的前列腺癌易感位點(diǎn),其中大部分為歐美人群,而在PCa低發(fā)病率地區(qū)開展的GWAS研究中發(fā)現(xiàn)低發(fā)病率地區(qū)存在種族特異的易感位點(diǎn)。中國(guó)人群具有與歐美不同的遺傳背景,篩查中國(guó)人群特異的前列腺癌易感位點(diǎn),不僅可以深入研究相關(guān)SNP及基因在前列腺癌中的作用及功能,還可以為深入研究不同種族間前列腺癌發(fā)病率巨大差異的原因提供線索。Collagen基因家族編碼膠原蛋白,維持細(xì)胞外基質(zhì)結(jié)構(gòu)的完整性,目前已發(fā)現(xiàn)該家族包括28種不同的基因類型。Collagen基因在癌癥的發(fā)生發(fā)展中起著重要的作用,參與調(diào)控細(xì)胞增生、轉(zhuǎn)移、分化和凋亡,可促進(jìn)前列腺癌細(xì)胞的侵襲及轉(zhuǎn)移。COL28A1編碼一種新型蛋白,在前列腺癌的研究中未見報(bào)道,其兩端含有的VWA區(qū)與細(xì)胞粘附和轉(zhuǎn)移相關(guān)。因此,研究COL28A1的基因多態(tài)性和前列腺癌的關(guān)系對(duì)確定中國(guó)人群中特有的SNP位點(diǎn)有著重要的意義。目的:篩查及分析中國(guó)人群中特有的前列腺癌易感位點(diǎn),明確COL28A1基因調(diào)控區(qū)與中國(guó)人群前列腺癌發(fā)生相關(guān)的SNP位點(diǎn)及在前列腺癌發(fā)展中的作用。為認(rèn)識(shí)低發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)人群中前列腺癌發(fā)病機(jī)制提供科學(xué)依據(jù)。方法:本研究首先通過i COGS芯片篩查了211,155個(gè)SNP位點(diǎn)在中國(guó)人群中(495例前列腺癌病例和640例對(duì)照)的前列腺癌易感位點(diǎn),利用Taq Man探針法在驗(yàn)證隊(duì)列中(814例前列腺癌病例和1487例對(duì)照)對(duì)發(fā)現(xiàn)的新位點(diǎn)進(jìn)行驗(yàn)證。通過對(duì)60例正常人的COL28A1的啟動(dòng)子區(qū)、5’UTR和3’UTR區(qū)進(jìn)行sanger測(cè)序,篩查出中國(guó)人群中COL28A1基因調(diào)控區(qū)的SNP位點(diǎn),通過Taqman探針法在上述驗(yàn)證隊(duì)列中進(jìn)行基因表型的檢測(cè)。使用SPSS18.0軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析,卡方檢驗(yàn)用于比較病例對(duì)照組間SNP位點(diǎn)的分布是否具有差異,表達(dá)數(shù)量性狀定位(e QTL)分析用于比較SNP位點(diǎn)與前列腺癌組織中基因表達(dá)的相關(guān)性。結(jié)果:1、通過i COGS芯片篩查,在中國(guó)人群中發(fā)現(xiàn)了5個(gè)新的SNP位點(diǎn),進(jìn)一步驗(yàn)證發(fā)現(xiàn)rs10235505的A等位基因(OR=1.189,95%CI=1.052-1.343)將增加前列腺癌的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn),而rs12567052的A等位基因(OR=0.836,95%CI=0.737-0.947)為前列腺癌發(fā)生的保護(hù)因素。2、通過反轉(zhuǎn)錄定量PCR檢測(cè)了兩個(gè)SNP位點(diǎn)相關(guān)基因(KIF14和COL28A1)在前列腺癌組織中的表達(dá)水平,分析發(fā)現(xiàn)中國(guó)前列腺癌患者中rs10235505的A等位基因相比G等位基因與前列腺癌組織中的COL28A1高表達(dá)相關(guān),而在英國(guó)前列腺癌患者標(biāo)本中沒有發(fā)現(xiàn)該關(guān)聯(lián)的存在。3、通過sanger測(cè)序發(fā)現(xiàn)COL28A1啟動(dòng)子區(qū)的SNP位點(diǎn),rs4720739,rs79808090,rs76674714及rs7925534,最小等位基因頻率分別為:13.4%,15.4%,16.4%及3.4%。4、rs4720739,rs79808090和rs76674714的基因表型與前列腺癌的發(fā)生均沒有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異,rs76674714的C等位基因與PSA低水平(PSA50 ng/ml vs≥50 ng/ml)顯著相關(guān)(OR=0.566,95%CI=0.364-0.879)。結(jié)論:1、rs10235505和rs12567052為中國(guó)人群特有的前列腺癌易感位點(diǎn)。2、rs10235505的AA基因型和A等位基因?qū)⒃黾忧傲邢侔┑陌l(fā)病風(fēng)險(xiǎn),rs12567052的AA基因型和A等位基因?yàn)榍傲邢侔┌l(fā)生的保護(hù)因素。3、rs10235505的A等位基因在中國(guó)人群中可能通過增加COL28A1的mRNA水平從而影響細(xì)胞轉(zhuǎn)移和侵襲,進(jìn)而增加前列腺癌的發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)。4、COL28A1啟動(dòng)子區(qū)的SNP位點(diǎn)rs4720739,rs79808090和rs76674714與前列腺癌的發(fā)生無相關(guān)性。rs76674714的C等位基因可顯著降低前列腺癌病人的PSA低水平。
【關(guān)鍵詞】：前列腺癌 單核苷酸多態(tài)性(SNP) COL28A1 GWAS
【學(xué)位授予單位】：第二軍醫(yī)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2015
【分類號(hào)】：R737.25
【目錄】：

• 摘要4-6
• Abstract6-9
• 主要英文縮寫詞表9-10
• 前言10-17
• 參考文獻(xiàn)13-17
• 第一部分 ICOGS SNP芯片篩查中國(guó)人群中特有的前列腺癌易感位點(diǎn)17-34
• 一、實(shí)驗(yàn)材料和設(shè)備17-18
• 二、實(shí)驗(yàn)方法18-22
• 三、實(shí)驗(yàn)結(jié)果22-28
• 四、討論28-30
• 參考文獻(xiàn)30-34
• 第二部分 COL28A1基因調(diào)控區(qū)SNP位點(diǎn)的研究34-51
• 一、實(shí)驗(yàn)材料和設(shè)備34-36
• 二、實(shí)驗(yàn)方法36-40
• 三、實(shí)驗(yàn)結(jié)果40-47
• 四、分析與討論47-49
• 參考文獻(xiàn)49-51
• 結(jié)論51-52
• 綜述52-63
• 參考文獻(xiàn)57-63
• 碩士在讀期間發(fā)表的論文63-64
• 致謝64

【參考文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前2條

1 韓蘇軍;張思維;陳萬青;李長(zhǎng)嶺;;中國(guó)前列腺癌發(fā)病現(xiàn)狀和流行趨勢(shì)分析[J];臨床腫瘤學(xué)雜志;2013年04期

2 LI Mei Ling;LIN Ji;HOU Jian Guo;XU Lei;CUI Xin Gang;XU Xing Xing;YU Yong Wei;HAN Xue;WANG Guo Min;GUO Jian Ming;XU Dan Feng;THOMPSON Timothy C;CAO Guang Wen;ZHANG Hong Wei;;Environmental and Psycho-social Factors Related to Prostate Cancer Risk in the Chinese Population:a Case-control Study[J];Biomedical and Environmental Sciences;2014年09期

，

本文編號(hào)：531829