肌層浸潤性膀胱尿路上皮癌MDM2擴增與PD-1/PD-L1抑制劑耐藥機制TCGA數(shù)據(jù)庫資料分析
發(fā)布時間:2022-12-10 20:51
目的免疫檢測點抑制劑能延長晚期膀胱尿路上皮癌患者的生存,但仍面臨耐藥問題,其機制是目前的研究熱點。本研究通過分析癌癥基因組圖譜(The Cancer Genome Atlas,TCGA)數(shù)據(jù)庫中肌層浸潤性膀胱尿路上皮癌的鼠雙微基因2(murine double minute 2,MDM2)擴增情況及相關(guān)基因表達,尋找免疫檢查點抑制劑耐藥的潛在機制。方法于2019-04-01從TCGA數(shù)據(jù)庫下載自建庫至2014-11-15肌層浸潤性膀胱尿路上皮癌數(shù)據(jù)包"bladder cancer(TCGA,cell2017)",含臨床信息、基因拷貝數(shù)變異與核糖核酸測序數(shù)據(jù),共412例患者,其中408例患者有基因拷貝數(shù)信息。對比MDM2擴增(36例)和未擴增(372例)的2組患者間臨床特征和預(yù)后差異;利用cBioportal和DAVID6.8在線分析mRNA表達與MDM2擴增相關(guān)基因,并進行功能富集分析;進一步采用cBioportal和GeneSpringGX軟件篩選出MDM2擴增和未擴增組間表達有差異的基因。結(jié)果肌層浸潤性膀胱尿路上皮癌中MDM2擴增發(fā)生率為8.8%(36/408)。MDM2基因擴增組...
【文章頁數(shù)】:6 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 數(shù)據(jù)來源
1.2 研究方法
1.2.1 臨床資料分析
1.2.2 共表達基因功能富集分析
1.2.3 差異表達基因分析
1.3 統(tǒng)計學方法
2 結(jié)果
2.1 MDM2基因擴增發(fā)生率及臨床病理特征
2.2 共表達基因分析及功能富集分析
2.3 差異表達基因鑒定
3 討論
【參考文獻】:
期刊論文
[1]程序性細胞死亡受體1抗體耐藥機制研究進展[J]. 辛道,王峰. 中華腫瘤雜志. 2018 (08)
本文編號:3717495
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【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 數(shù)據(jù)來源
1.2 研究方法
1.2.1 臨床資料分析
1.2.2 共表達基因功能富集分析
1.2.3 差異表達基因分析
1.3 統(tǒng)計學方法
2 結(jié)果
2.1 MDM2基因擴增發(fā)生率及臨床病理特征
2.2 共表達基因分析及功能富集分析
2.3 差異表達基因鑒定
3 討論
【參考文獻】:
期刊論文
[1]程序性細胞死亡受體1抗體耐藥機制研究進展[J]. 辛道,王峰. 中華腫瘤雜志. 2018 (08)
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