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應(yīng)用生物信息學(xué)篩選多囊腎病治療藥物NS398及其效應(yīng)驗證

發(fā)布時間:2022-02-26 21:35
  研究目的:常染色體顯性多囊腎病(autosomal dominant polycystic kidney disease,ADPKD)是最常見的遺傳性腎臟病,主要由PKD1或PKD2基因突變引起,以小管上皮不斷增殖形成囊腫并持續(xù)擴張為特征,也被認(rèn)為是“變相的腫瘤”。腎透明細(xì)胞癌(clear cell renal cell carcinoma,ccRCC)是發(fā)生在腎臟的最常見的惡性腫瘤之一。本研究利用生物信息學(xué)研究方法,將對ADPKD患者和ccRCC患者疾病組織和對照組織進行RNA測序的芯片數(shù)據(jù)集進行分析,研究上述疾病在差異表達基因、富集的功能和信號通路、蛋白功能和生存相關(guān)性的異同,利用Connectivity Map數(shù)據(jù)庫篩選潛在的可用化合物,在體內(nèi)和體外進行實驗驗證,并探索其作用機制。研究方法:(1)在腎臟表達基因數(shù)據(jù)庫(RGED)檢索“ADPKD”和“Kidney Carcinoma”,選取ADPKD患者腎組織數(shù)據(jù)集RGED7869和腎透明細(xì)胞癌患者癌組織數(shù)據(jù)集RGED53757作為研究對象。(2)在NCBI-GEO數(shù)據(jù)庫獲取二者相應(yīng)的測序結(jié)果 GSE7869 和 GSE53757... 

【文章來源】:中國人民解放軍海軍軍醫(yī)大學(xué)上海市211工程院校

【文章頁數(shù)】:76 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【文章目錄】:
摘要
Abstract
縮略詞表
前言
第一部分 ADPKD患者腎組織和人腎透明細(xì)胞癌組織表達譜芯片生物信息學(xué)分析
    一、引言
    二、實驗方法和材料
    三、結(jié)果
    四、討論
第二部分 NS398對ADPKD和ccRCC細(xì)胞增殖的作用及機制研究
    一、引言
    二、實驗方法和材料
    三、結(jié)果
    四、討論
第三部分 NS398對ADPKD小鼠疾病進展的作用
    一、引言
    二、實驗方法和材料
    三、結(jié)果
    四、討論
全文總結(jié)
參考文獻
綜述 常染色體顯性多囊腎病和腫瘤的相關(guān)性
    參考文獻
在讀期間完成和發(fā)表的文章及成果
致謝


【參考文獻】:
期刊論文
[1]Specific COX-2 inhibitor NS398 induces apoptosis in human liver cancer cell line HepG2 through BCL-2[J]. Dong-Sheng Huang, Ke-Zhen Shen, Jian-Feng Wei, Ting-Bo Liang, Shu-Sen Zheng, Hai-Yang Xie, Department of Hepatobiliary Pancreatic Surgery, The First Affiliated Hospital, Zhejiang University, College of Medicine, Hangzhou 310003, Zhejiang Province, China.  World Journal of Gastroenterology. 2005(02)



本文編號:3645018

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