目的：DNA甲基化（5mC）和羥甲基化（5hmC）是表觀遺傳修飾的重要組成部分。已有研究報道了不同組織或器官內(nèi)基因組5mC和5hmC含量存在差異,但對于不同組織內(nèi)5mC或5hmC在全基因組的分布規(guī)律我們卻知之甚少。因此,我們對小鼠不同器官基因組DNA中5mC和5hmC含量進行了驗證,并對不同器官DNA甲基組和羥甲基組進行初步分析,觀察并總結(jié)5mC和5hmC的全基因組分布規(guī)律。方法：摘取正常雄性C57小鼠不同器官,抽提基因組DNA。采用DNA點雜交方法檢測5mC和5hmC在小鼠不同器官基因組中的含量變化,并利用DNA-特異性抗體免疫沉淀方法富集小鼠心臟,肝臟,腎臟,肺,腦皮質(zhì)和小腦基因組中含5mC或5hmC的DNA片段,通過全基因組測序技術(shù)和生物信息學分析比較不同器官DNA甲基組和羥甲基組信息。結(jié)果：點雜交檢測發(fā)現(xiàn)小鼠不同器官5hmC含量存在顯著差異,與5mC含量無明顯相關(guān)性。對六種小鼠器官基因組DNA5mC和5hmC的測序結(jié)果進一步印證了上述結(jié)論。分析5mC/5hmC在不同基因區(qū)域比例發(fā)現(xiàn),5hmC多見于基因本體,5mC則大量分布于基因間區(qū)域。觀察小鼠不同器官5mC或5hmC在基因本體... 

【文章來源】：復旦大學上海市211工程院校985工程院校教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：107 頁

【學位級別】：博士

【文章目錄】：
縮略語與符號
中文摘要
    第一部分
    第二部分
    第三部分
Abstract
    Part 1
    Part 2
    Part 3
前言
第一部分 5mC和5hmC在小鼠不同器官基因組DNA中的含量與分布規(guī)律
    引言
    材料和方法
    結(jié)果
    討論
    結(jié)論
    參考文獻
第二部分 缺血再灌注損傷引起小鼠腎臟基因組DNA中5hmC含量減少
    引言
    材料和方法
    結(jié)果
    討論
    結(jié)論
    參考文獻
第三部分 小鼠腎臟缺血再灌注中5mC,5hmC的全基因組范圍分析
    引言
    材料和方法
    結(jié)果
    討論
    結(jié)論
    參考文獻
綜述
    參考文獻
后記
致謝



本文編號：3631632